Cell Death Differ丨中南大學(xué)向波團(tuán)隊(duì)解析環(huán)狀RNA circRILPL1介導(dǎo)鼻咽癌的發(fā)病機(jī)制
鼻咽癌(NPC)發(fā)生于鼻咽部,是一種起源于鼻咽上皮細(xì)胞的惡性腫瘤,其發(fā)生主要與遺傳因素、EB病毒感染和環(huán)境因素有關(guān)。放眼全球,NPC的發(fā)病率極不均衡,具有明顯的區(qū)域聚集性和種族偏好性,多發(fā)于東亞和東南亞,尤其是我國南方[1]。然而,NPC的具體病因和發(fā)病機(jī)制尚不清楚,仍待進(jìn)一步研究。
環(huán)狀RNA(circRNA)具有種類豐富、結(jié)構(gòu)穩(wěn)定、序列保守以及組織特異性表達(dá)等特點(diǎn),且在腫瘤發(fā)生過程中發(fā)揮重要的調(diào)節(jié)作用。有學(xué)者利用高通量測(cè)序和生物信息學(xué)技術(shù),在NPC細(xì)胞中鑒定出了數(shù)個(gè)獨(dú)特的circRNA,發(fā)現(xiàn)它們?cè)贜PC細(xì)胞和正常細(xì)胞之間具有顯著差異表達(dá),表明circRNA可以作為潛在的臨床診斷和預(yù)后指標(biāo)[2]。然而,circRNA在NPC中的潛在機(jī)制仍然未知。
2023年5月12日,中南大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院腫瘤研究所向波研究員團(tuán)隊(duì)在Nature集團(tuán)旗下期刊Cell Death & Differentiation發(fā)表文章Circular RNA circRILPL1 promotes nasopharyngeal?carcinoma malignant progression by activating the?Hippo-YAP signaling pathway。作者在鼻咽癌細(xì)胞中鑒定到一個(gè)新的環(huán)狀RNA——circRILPL1。它可以結(jié)合并激活ROCK1以抑制LATS1激酶,從而抑制LATS1對(duì)YAP的磷酸化過程,并且增強(qiáng)YAP活性。同時(shí),circRILPL1通過增強(qiáng)YAP與核轉(zhuǎn)運(yùn)受體IPO7之間的相互作用,促進(jìn)YAP易位進(jìn)入細(xì)胞核。在細(xì)胞核中,活化的YAP會(huì)促進(jìn)CAPN2和PXN的轉(zhuǎn)錄表達(dá)。此外,circRILPL1在體內(nèi)外均能促進(jìn)NPC的增殖和轉(zhuǎn)移。文章解析了環(huán)狀RNA在鼻咽癌細(xì)胞中的信號(hào)傳導(dǎo)作用,揭示環(huán)狀RNA circRILPL1通過激活Hippo-YAP信號(hào)通路調(diào)控鼻咽癌的發(fā)病機(jī)制。

circRILPL1在鼻咽癌組織中高表達(dá),并與鼻咽癌患者預(yù)后不良相關(guān)
首先,作者在GEO數(shù)據(jù)庫中搜索并分析NPC的RNA-seq數(shù)據(jù),確定了30個(gè)在NPC組織中高表達(dá)的circRNA,其中circRILPL1為首次發(fā)現(xiàn)。qRT-PCR和ISH結(jié)果顯示,circRILPL1在NPC中的表達(dá)量顯著高于非癌性鼻咽上皮組織組別。此外,作者分析Kaplan-Meier曲線發(fā)現(xiàn),circRILPL1高表達(dá)對(duì)NPC患者預(yù)后差,而circRILPL1低表達(dá)的NPC患者預(yù)后較好。接著,通過核質(zhì)分離定量實(shí)驗(yàn)和FISH實(shí)驗(yàn)分析,發(fā)現(xiàn)circRILPL1在細(xì)胞質(zhì)和細(xì)胞核中均有分布。綜上表明,circRILPL1是一個(gè)在NPC中高表達(dá)的新環(huán)狀RNA,可能在NPC的腫瘤發(fā)生中發(fā)揮作用。

circRILPL1在體外和體內(nèi)均促進(jìn)NPC細(xì)胞的增殖和遷移
作者通過劃痕和transwell實(shí)驗(yàn)分析發(fā)現(xiàn),過表達(dá)circRILPL1可以顯著增強(qiáng)NPC細(xì)胞的遷移和侵襲。此外,MTT和克隆形成實(shí)驗(yàn)表明,過表達(dá)circRILPL1會(huì)促進(jìn)NPC細(xì)胞的增殖,而敲低circRILPL1后獲得了相反的結(jié)果。結(jié)合皮下腫瘤模型和IHC數(shù)據(jù)發(fā)現(xiàn),與對(duì)照組相比,circRILPL1過表達(dá)組的腫瘤體積和重量顯著增加且Ki67的表達(dá)量較高,而circRILPL1敲低組的結(jié)果相反,表明circRILPL1促進(jìn)了小鼠NPC細(xì)胞的生長。綜合尾靜脈注射肺轉(zhuǎn)移模型和裸鼠腳墊淋巴轉(zhuǎn)移模型實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)發(fā)現(xiàn),與對(duì)照組相比,過表達(dá)circRILPL1會(huì)促進(jìn)小鼠NPC細(xì)胞發(fā)生肺轉(zhuǎn)移和腹股溝淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移,而circRILPL1敲低組的腫瘤細(xì)胞轉(zhuǎn)移較少。綜上表明,過表達(dá)circRILPL1在體外和體內(nèi)均促進(jìn)了NPC細(xì)胞的增殖、遷移和侵襲。

circRILPL1激活Hippo-YAP信號(hào)通路
作者利用LC-MS/MS技術(shù)對(duì)過表達(dá)circRILPL1的NPC細(xì)胞系進(jìn)行蛋白質(zhì)組學(xué)分析,結(jié)果顯示Hippo信號(hào)通路中有11種蛋白質(zhì)被富集。通過WB實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,Hippo信號(hào)通路中的核心蛋白YAP(Ser127和Ser397)和LATS1的磷酸化會(huì)因circRILPL1的過表達(dá)或敲低而受到調(diào)節(jié),而MST1沒有顯著變化。熒光素酶報(bào)告基因結(jié)果顯示,過表達(dá)circRILPL1顯著增強(qiáng)了YAP的轉(zhuǎn)錄活性,而敲低circRILPL1則產(chǎn)生了相反的結(jié)果。此外,作者通過劃痕實(shí)驗(yàn)和transwell分析發(fā)現(xiàn),過表達(dá)YAP可以逆轉(zhuǎn)circRILPL1敲低對(duì)NPC細(xì)胞遷移和侵襲的抑制作用。而且,MTT和克隆形成測(cè)定結(jié)果顯示,過表達(dá)YAP逆轉(zhuǎn)了circRILPL1敲低對(duì)NPC細(xì)胞增殖的抑制作用。總之,circRILPL1在NPC細(xì)胞中的功能依賴于YAP信號(hào)通路的激活。

circRILPL1與ROCK1結(jié)合,抑制LATS1-YAP激酶級(jí)聯(lián)反應(yīng)
為了探索circRILPL1調(diào)節(jié)Hippo-YAP信號(hào)通路的機(jī)制,作者通過質(zhì)譜法鑒定RNA pull-down產(chǎn)物,發(fā)現(xiàn)circRILPL1不直接結(jié)合LATS1或YAP,但與ROCK1結(jié)合。接著,作者用RNA pull-down和RIP實(shí)驗(yàn),結(jié)合IF-FISH的共定位結(jié)果,證實(shí)了circRILPL1與ROCK1互作。WB結(jié)果顯示,在過表達(dá)circRILPL1的NPC細(xì)胞中利用siRNA敲低ROCK1的表達(dá)水平,顯著抑制了LATS1的去磷酸化,從而抑制了YAP去磷酸化并導(dǎo)致YAP蛋白水平顯著降低,表明circRILPL1與ROCK1互作在LATS1-YAP激酶級(jí)聯(lián)反應(yīng)中發(fā)揮重要作用。

circRILPL1與IPO7結(jié)合,促進(jìn)YAP蛋白發(fā)生核易位
作者在與circRILPL1結(jié)合的pull-down產(chǎn)物中發(fā)現(xiàn)了一種核轉(zhuǎn)運(yùn)受體IPO7,并且用RNA pull-down、RIP和IF-FISH證實(shí)了circRILPL1和IPO7之間存在相互作用。通過核質(zhì)分離定量分析,結(jié)合免疫熒光結(jié)果,發(fā)現(xiàn)過表達(dá)circRILPL1能誘導(dǎo)IPO7進(jìn)入細(xì)胞核,而敲低circRILPL1則減少了IPO7入核。IP和免疫熒光結(jié)果顯示,過表達(dá)circRILPL1使IPO7和YAP之間的結(jié)合顯著增強(qiáng)。綜上表明,circRILPL1介導(dǎo)了IPO7和YAP之間的結(jié)合。WB結(jié)果顯示,敲低IPO7會(huì)阻礙circRILPL1誘導(dǎo)YAP從細(xì)胞質(zhì)易位到細(xì)胞核,并抑制YAP轉(zhuǎn)錄活性,表明circRILPL1在一定程度上依賴于IPO7蛋白誘導(dǎo)YAP核易位。

circRILPL1-YAP信號(hào)傳導(dǎo)促進(jìn)CAPN2和PXN的轉(zhuǎn)錄
作者分析circRILPL1過表達(dá)后的差異表達(dá)基因,發(fā)現(xiàn)circRILPL1-YAP信號(hào)傳導(dǎo)通路能激活在細(xì)胞遷移和侵襲中起重要作用的基因CAPN2和PXN。此外,qRT-PCR和WB結(jié)果證實(shí)了circRILPL1可以使NPC細(xì)胞中CAPN2和PXN的mRNA表達(dá)和蛋白水平上調(diào)。過表達(dá)YAP促進(jìn)了CAPN2和PXN的轉(zhuǎn)錄,而敲低YAP抑制其轉(zhuǎn)錄。而且,過表達(dá)YAP能逆轉(zhuǎn)由circRILPL1敲低引起的CAPN2和PXN轉(zhuǎn)錄水平降低。ChIP實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,過表達(dá)circRILPL1促使YAP富集在CAPN2和PXN啟動(dòng)子區(qū)域。綜上表明,circRILPL1通過激活YAP來促進(jìn)CAPN2和PXN的轉(zhuǎn)錄。

總結(jié):
circRILPL1通過結(jié)合并激活ROCK1來抑制LATS1激酶,從而抑制YAP的磷酸化;circRILPL1與核轉(zhuǎn)運(yùn)受體IPO7互作,使YAP與IPO7結(jié)合,從而增強(qiáng)YAP核易位;而YAP可以激活CAPN2和PXN的轉(zhuǎn)錄表達(dá)。總的來說,circRILPL1通過結(jié)合ROCK1和IPO7,協(xié)同調(diào)節(jié)YAP的激活及其核易位,誘導(dǎo)NPC細(xì)胞發(fā)生增殖、遷移和侵襲,在鼻咽癌腫瘤發(fā)生中發(fā)揮關(guān)鍵的致癌作用。

參考文獻(xiàn):
[1] Chen, Y.P., et al., Nasopharyngeal carcinoma. Lancet, 2019. 394(10192): p. 64-80.
[2] Zhou, D.N., et al., Integrated analysis of transcriptome profiling predicts potential lncRNA and
circRNA targets in human nasopharyngeal carcinoma. Oncol Lett, 2020. 19(4): p.?3123-3136.
原文鏈接:
https://doi.org/10.1038/s41418-023-01171-8
