1. 遺傳。據(jù)國(guó)外文獻(xiàn)統(tǒng)計(jì)，潰瘍性結(jié)腸炎患者的直系親屬中，15%～30%的人發(fā)病。此外雙胞胎的研究表明，單合子比雙合子更容易發(fā)病，提示本病的發(fā)生可能與遺傳因素有關(guān)。

2. 自身免疫反應(yīng)。多數(shù)學(xué)者認(rèn)為本病屬于自身免疫性疾病。因?yàn)楸静〔l(fā)自身免疫病者較多，腎上腺皮質(zhì)激素能使病情緩解，在部分患者的血清中可查到抗結(jié)腸上皮細(xì)胞抗體。某些患者感染腸道菌后，可與結(jié)腸上皮細(xì)胞抗原起免疫反應(yīng)，因此懷疑結(jié)腸炎的發(fā)生可能與細(xì)胞免疫異常有關(guān)。

3.神經(jīng)精神因素。有人認(rèn)為精神因素在發(fā)病中起一定作用，患者多有某些性格特征，對(duì)于生活中重大事件的心理承受能力和適應(yīng)性差，屬心身疾病一類。