案例分享 | NanoTemper助力藥企研發(fā)STING抑制劑片段篩選

干擾素基因刺激因子(Stimulator of interferon genes, STING)在天然免疫中發(fā)揮重要作用,當細胞被病原體(如病毒)感染時,STING可以誘導I型干擾素和促炎性細胞因子的產(chǎn)生,是靶向治療自身免疫疾病和癌癥的潛在靶標蛋白。近年STING相關(guān)研究火爆,管線數(shù)量激增。目前全球范圍內(nèi)在研的STING靶向藥物超過50種。
今天給大家介紹的STING抑制劑片段篩選案例是由NanoTemper和藥明康德旗下的Crelux公司合作完成的。研究人員生產(chǎn)純化了帶有His-tag的STING蛋白,隨后使用Prometheus蛋白穩(wěn)定性分析儀進行緩沖液優(yōu)化并使用環(huán)二核苷酸cGAMP作為陽性對照進行Thermal shift assay,快速驗證了蛋白的結(jié)合活性。案例回顧:差示掃描熒光法表征蛋白配體互作,不加染料的那種
接下來研究人員使用Dianthus完成了片段化合物庫單點篩選及親和力排序。
在使用Dianthus進行篩選時,其中一個分子需要帶有熒光。本實驗中, 研究人員使用His-tag熒光標記試劑盒對STING蛋白進行了特異性標記,片段終濃度為500μM,結(jié)合緩沖液為50 mM HEPES, pH 7.4, 150 mM NaCl, 3 mM DTT, 0.005% TWEEN? 20, 4% DMSO。
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下圖為單點篩選結(jié)果,2213個片段加上陽性及DMSO對照(均重復(fù)一次)總共采集了5376個數(shù)據(jù)點,即14塊384孔板。消耗590μg STING蛋白,上機檢測時間約8h(Dianthus 33分鐘即可完成一塊384孔板檢測,↓?文末觀看Dianthus上機演示)。紫色線框中的黃色數(shù)據(jù)點為陽性對照cGAMP,213個陽性化合物響應(yīng)值CV僅0.25%,檢測重復(fù)性非常好。

最后將單點篩選結(jié)果中的162個hits(上圖藍色數(shù)據(jù)點)進行12個濃度點的梯度稀釋檢測親和力。消耗STING蛋白190μg,上機檢測時間約3小時。

基于片段的藥物發(fā)現(xiàn) (FBDD) 是藥物研發(fā)的主流方法之一。但片段分子量低,且與蛋白靶標親和力低,通常在μM-mM范圍,因此對篩選技術(shù)的靈敏度有較高的要求。Dianthus基于光譜位移技術(shù)(Spectral shift)檢測,不依賴于分子量,可檢測pM-mM的親和力。此外,Dianthus檢測一個kd僅需1min,單孔上樣體積20μl,是您親和力篩選項目的強大工具!Dianthus產(chǎn)品介紹:全新Dianthus攜光譜位移技術(shù)橫空出世,1分鐘擊破親和力篩選難點!
一起來看看超詳細的Dianthus實驗操作演示吧
