近年來，單細胞測序技術(shù)在醫(yī)學領(lǐng)域研究中已有廣泛應用，但在農(nóng)學方向，部分物種已知 Maker 基因較少不能準確鑒定細胞類型；某些物種缺少參考基因組、或同一物種有多個參考基因組很難選定；植物樣本原生質(zhì)體制備困難等也是影響農(nóng)學單細胞組學研究進展的主要因素。

針對這一系列難題，博奧晶典首先對不同物種的多種組織類型開發(fā)了特有的解離方法，已成功完成了擬南芥、水稻、油菜、白菜、橄欖、苜蓿、蘋果、菠菜等多物種多部位的原生質(zhì)體制備，項目經(jīng)驗豐富。此外，在數(shù)據(jù)分析方面，博奧晶典自主搭建了 SingleCellBase 細胞注釋數(shù)據(jù)庫，該數(shù)據(jù)庫整合 2000+ 篇高分單細胞文獻數(shù)據(jù)，納入了多個物種（包括魚、雞、猴子、豬、擬南芥等 33 個物種）和組織的細胞類型 Markers，實現(xiàn)了各類物種各類組織的細胞類型精準注釋。

目前博奧晶典已助力研究人員發(fā)表 20+ 篇農(nóng)學領(lǐng)域新成果，影響因子超 170 分。接下來跟小編一起回顧近期博奧晶典支持發(fā)表的 3 篇農(nóng)學領(lǐng)域優(yōu)秀文章吧！

Differentiation trajectories and biofunctions of symbiotic and un-symbiotic fate cells in root nodules of?Medicago truncatula

研究主題：截短苜蓿根瘤共生和非共生命運細胞的分化軌跡和生物功能

發(fā)表期刊：Molecular Plant

影響因子：21.95

發(fā)表單位：中國農(nóng)業(yè)大學

文章研究團隊攻克了分離根瘤單細胞的技術(shù)難關(guān)，報道了以截形苜蓿為代表的不定型根瘤單細胞轉(zhuǎn)錄組圖譜，揭示了成熟的不定型根瘤中不同轉(zhuǎn)錄表達模式的細胞類群，以及共生細胞類型和非共生細胞類型的分化軌跡和生物學功能，發(fā)現(xiàn)了共生固氮新機制：固氮細胞將氮同化為谷氨酰胺，非固氮細胞將谷氨酰胺轉(zhuǎn)化為天冬酰胺供植物生長發(fā)育的新機制。

Integration of single-cell transcriptome and chromatin accessibility of early gonads development among goats, pigs, macaques, and humans

研究主題：山羊、豬、獼猴和人類性腺發(fā)育早期單細胞轉(zhuǎn)錄組和染色質(zhì)可及性的整合

發(fā)表期刊：Cell Reports

影響因子：9.995

發(fā)表單位：中國科學院動物研究所

哺乳動物的早期性腺包含原始生殖細胞（PGCs）和體細胞前體，它們對性別決定和配子形成至關(guān)重要。研究者整合了單細胞轉(zhuǎn)錄組和染色質(zhì)可及性分析，以識別山羊、豬、獼猴和人類早期生殖腺中 PGCs 和體細胞的調(diào)控特征；確定了進化保守和物種特定的事件，包括基因表達、信號通路和細胞-細胞相互作用；還發(fā)現(xiàn)了潛在的順式調(diào)控元件和關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子在 PGCs 和體細胞；更好的解釋了哺乳動物 PGCs 和性腺體細胞發(fā)育的進化程序。

Single-cell transcriptome of?Nepeta tenuifolia?leaves reveal differentiation trajectories in glandular trichomes

研究主題：細葉豬籠草葉片的單細胞轉(zhuǎn)錄組揭示腺毛的分化軌跡

發(fā)表期刊：Frontiers in Plant Science

影響因子：6.627

發(fā)表單位：南京中醫(yī)藥大學

細葉豬籠草葉片上的盾狀腺毛（PGTs）可以分泌和儲存具有生物活性的精油。用富含 PGT 的葉片分離原生質(zhì)體，成功捕獲了 33,254 個原生質(zhì)體用于單細胞轉(zhuǎn)錄組測序。細胞類型注釋將所有細胞劃分為 6 種類型，19 個亞型。基于毛狀體特異性基因、單萜生物合成基因的表達模式和 PGT 分泌物的代謝分析，鑒定出來自 PGT 的細胞。通過擬時序分析描繪了 PGT 的發(fā)育軌跡。對細葉豬籠草葉片和擬南芥莖單細胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的綜合分析表明，PGTs 對細葉豬籠草具有特異性。文章為探索植物細胞的發(fā)育和分化，特別是腺毛的起始和發(fā)育提供了新思路。

為鼓勵廣大研究人員利用單細胞及空間組學技術(shù)更多地探索農(nóng)學領(lǐng)域，博奧晶典已推出“農(nóng)學單細胞&空間研究激勵計劃”。更多詳情請點擊查看往期，快來參與吧！

另外由北京博奧晶典生物技術(shù)有限公司主辦的“首屆農(nóng)學單細胞空間組學技術(shù)研討會”將于5月12日在北京拉開帷幕，敬請期待！