質(zhì)譜流式應(yīng)用文章分析——神經(jīng)免疫:組織表征-百泰派克生物科技BTP
質(zhì)譜流式技術(shù)(Mass Cytometry)在藥物開(kāi)發(fā)和生物制品表征中的潛力巨大。質(zhì)譜流式細(xì)胞術(shù)將質(zhì)譜技術(shù)與流式細(xì)胞儀相結(jié)合,能夠?qū)崿F(xiàn)對(duì)單個(gè)細(xì)胞的生化成分進(jìn)行深入研究,幫助我們理解疾病機(jī)制,驗(yàn)證藥物的效果,發(fā)現(xiàn)新的藥物靶點(diǎn)以及增強(qiáng)生物制藥質(zhì)量控制。這在生物藥物表征中非常有用,它可以幫助解決以下一些問(wèn)題:
單細(xì)胞層次的分子表征:傳統(tǒng)的質(zhì)譜技術(shù)通常需要大量的樣本以獲取可靠的結(jié)果,而質(zhì)譜流式技術(shù)則可以分析單個(gè)細(xì)胞的生化成分,這可以幫助我們更深入地理解細(xì)胞的生物學(xué)特性。
生物分子的定量分析:質(zhì)譜流式技術(shù)可以對(duì)細(xì)胞內(nèi)的生物分子進(jìn)行定量分析,包括蛋白質(zhì)、代謝物和其他生物分子。
細(xì)胞異質(zhì)性的研究:細(xì)胞群體中的細(xì)胞并非完全相同,它們之間的差異可能影響疾病的發(fā)展和治療的效果。質(zhì)譜流式技術(shù)可以幫助我們研究這種細(xì)胞異質(zhì)性。
百泰派克生物科技BTP采用基于Fluidigm Helios流式細(xì)胞儀(Mass Cytometry System for Single Cell Analysis)用于單細(xì)胞質(zhì)譜分析,該平臺(tái)能夠完成包括單細(xì)胞捕獲、cDNA合成、實(shí)時(shí)定量PCR分析、目標(biāo)區(qū)域擴(kuò)增以及質(zhì)譜流式細(xì)胞分析。
免疫細(xì)胞包括多樣化的細(xì)胞亞群,它們通過(guò)細(xì)胞因子介導(dǎo)的互作和直接的細(xì)胞-細(xì)胞相互作用,與其他免疫和非免疫細(xì)胞協(xié)同行使生物學(xué)功能。大腦由影響大腦發(fā)育、組織平衡和神經(jīng)元活動(dòng)的常駐和浸潤(rùn)免疫細(xì)胞組成。中樞神經(jīng)系統(tǒng)(CNS)紊亂會(huì)引發(fā)廣泛的疾病,包括情緒障礙、腦血管疾病、多動(dòng)癥和自閉癥等神經(jīng)發(fā)育疾病,焦慮抑郁、精神錯(cuò)亂、成癮等精神類疾病,阿爾茨海默(AD)、帕金森(PD)、亨廷頓?。℉D)等神經(jīng)退行性疾病。而這些嚴(yán)重危害人類健康,造成沉重的社會(huì)負(fù)擔(dān)。越來(lái)越多的證據(jù)表明,免疫系統(tǒng)在中樞神經(jīng)系統(tǒng)發(fā)育和功能中的作用(圖1)。因此,免疫調(diào)節(jié)作為治療中樞神經(jīng)系統(tǒng)紊亂疾病的一種治療策略,已經(jīng)得到越來(lái)越多的關(guān)注。

質(zhì)譜流式技術(shù)可以對(duì)復(fù)雜的免疫網(wǎng)絡(luò)中的其單個(gè)細(xì)胞成分進(jìn)行描述,該技術(shù)的出現(xiàn)使得對(duì)大腦的高維分析成為可能,從而使人們對(duì)神經(jīng)-免疫相互作用的理解達(dá)到新的水平。
2017年,來(lái)自以色列理工學(xué)院的Asya Rolls團(tuán)隊(duì)使用44個(gè)細(xì)胞表面標(biāo)記來(lái)表征幼稚小鼠大腦的免疫群體,以繪制大腦免疫區(qū)室的高維單細(xì)胞表征。文章確定了大腦區(qū)室中的各種免疫細(xì)胞亞群,表征了這些細(xì)胞亞群的獨(dú)特特征,并將其組成與外周血中的組成進(jìn)行了比較。這種廣泛的分析能夠揭示以前未表征的浸潤(rùn)免疫群體,證明常駐髓細(xì)胞和浸潤(rùn)細(xì)胞的表型的范圍和豐富性,并將CD44鑒定為區(qū)分幼稚大腦內(nèi)常駐免疫細(xì)胞和浸潤(rùn)免疫細(xì)胞的標(biāo)志物。2018年,該團(tuán)隊(duì)在Nature Protocol上發(fā)表了對(duì)腦中免疫細(xì)胞的質(zhì)譜流式分析流程。文章提供了一個(gè)分步驟的描述,介紹了分析小鼠腦區(qū)的質(zhì)譜流式實(shí)驗(yàn)方法。該程序的不同階段包括腦灌注、提取腦組織并將其分離成單細(xì)胞懸液,然后用金屬標(biāo)記的抗體進(jìn)行細(xì)胞染色,用質(zhì)譜儀讀取樣品,用SPADE和viSNE進(jìn)行數(shù)據(jù)分析。這個(gè)過(guò)程需要<5小時(shí)(不包括數(shù)據(jù)分析),可用于研究正常和病理?xiàng)l件下大腦免疫群體的變化(圖2)。

中樞神經(jīng)系統(tǒng)(CNS)包含多種免疫細(xì)胞類型,在組織穩(wěn)態(tài)、免疫防御和神經(jīng)系統(tǒng)疾病中具有不同的作用。繪制整個(gè)大腦的白細(xì)胞圖一直是個(gè)挑戰(zhàn),特別是在病理學(xué)中,表型變化和血源細(xì)胞的涌入阻礙了對(duì)反應(yīng)性白細(xì)胞群的明確區(qū)分。有研究應(yīng)用高維單細(xì)胞質(zhì)量和熒光細(xì)胞儀,與遺傳命運(yùn)圖譜系統(tǒng)并行,來(lái)識(shí)別、定位和描述哺乳動(dòng)物中樞神經(jīng)系統(tǒng)內(nèi)多個(gè)不同的免疫群體。使用這種方法,文章發(fā)現(xiàn)小膠質(zhì)細(xì)胞、邊界相關(guān)巨噬細(xì)胞的幾個(gè)亞群和樹(shù)突狀細(xì)胞在穩(wěn)定狀態(tài)下共存于中樞神經(jīng)系統(tǒng),并在衰老過(guò)程中以及在阿爾茨海默病和多發(fā)性硬化癥模型中表現(xiàn)出疾病特定的轉(zhuǎn)變(圖3)。

小膠質(zhì)細(xì)胞是中樞神經(jīng)系統(tǒng)的常駐先天免疫細(xì)胞,在維持中樞神經(jīng)系統(tǒng)完整性和功能方面具有重要作用。它們參與去除凋亡神經(jīng)元,完善突觸連接并為記憶和運(yùn)動(dòng)學(xué)習(xí)提供營(yíng)養(yǎng)支持。有研究通過(guò)質(zhì)譜流式技術(shù)測(cè)定人小膠質(zhì)細(xì)胞區(qū)域異質(zhì)性和表型。該研究使用兩個(gè)不同的抗體組合(35個(gè)抗體/組合)對(duì)樣本進(jìn)行染色。A組旨在檢測(cè)主要的循環(huán)免疫細(xì)胞亞群(T和B細(xì)胞,單核細(xì)胞,自然殺傷(NK)細(xì)胞)和小膠質(zhì)細(xì)胞,使用增殖標(biāo)志物,活性相關(guān)標(biāo)志物,趨化因子受體和細(xì)胞亞群標(biāo)志物,包括P2Y12,IRF4,IRF8,CD45,CD3,CD62L,CD19,HLA-DR,CD56,cyclin A&B1以及Ki-67。B組旨在使用35種抗體分析小膠質(zhì)細(xì)胞和先天免疫細(xì)胞亞群的表型,包括TMEM119,CD172a,CD279(PD-1),CD274(PD-L1),arginase-1,CCR7,CD44,CD18和CD32(圖4)。文章對(duì)來(lái)自不同大腦區(qū)域的小膠質(zhì)細(xì)胞進(jìn)行了大規(guī)模的單細(xì)胞免疫分析,確定了小膠質(zhì)細(xì)胞的表型特征。
