編者按：?

上期小鹿為各位關注蛋白質(zhì)組學、代謝組學研究的老師整理了歐易/鹿明生物植物方向2020年最佳項目文章TOP10，總影響因子：84.399；包含的物種有：水稻、擬南芥、紫薯幼苗、蠶豆、甘藍型油菜、黃瓜、菠菜、大豆芽等，相繼發(fā)表于Nature communication、Microbiome等高分期刊；

本期小鹿整理了歐易/鹿明生物醫(yī)學方向2020年最佳項目文章TOP5，包含：研究對象、發(fā)表期刊、運用生物技術及研究方法流程，總影響因子：61.414；希望2021年鹿明生物再接再厲能更好的助力各位老師登上高分期刊。

TOP1??移植喂食了褐藻寡糖的小鼠的糞便菌可改善精子質(zhì)量和精子形成

英文標題：Improvement in sperm quality and spermatogenesis following faecal microbiota transplantation from alginate oligosaccharide dosed mice

研究對象：小鼠糞便

發(fā)表期刊：Gut

影響因子：19.819

發(fā)表時間：2020年4月

合作發(fā)表單位：中國農(nóng)業(yè)科學院與青島農(nóng)業(yè)大學

主要運用歐易/鹿明生物技術：LC-MS非靶向代謝組（由鹿明生物提供技術支持）、16s微生物多樣性、轉錄組

最近在《Gut》和其它雜志上發(fā)表的12篇文章表明，腸道微生物群影響生育能力。應用糞便微生物群移植（FMT）手段改善生育能力是一個新興的研究領域。文章運用LC-MS非靶向代謝組、16s微生物多樣性、轉錄組學等多種檢測手段發(fā)現(xiàn)了腸道微生物群與挽救精子形成和精子質(zhì)量聯(lián)系起來的機制。首次說明，腸道微生物群可以通過改善精子形成來治療男性不育。

TOP2??藻酸鹽寡糖化小鼠的微生物群成功減輕了小腸粘膜炎

英文標題：Microbiota from alginate oligosaccharidedosed mice successfully mitigated small intestinal mucositis

研究物種：小鼠

發(fā)表期刊：Microbiome

影響因子：11.607

發(fā)表時間：2020年8月

合作發(fā)表單位：中國農(nóng)業(yè)科學院與青島農(nóng)業(yè)大學

主要運用歐易/鹿明生物技術：LC-MS非靶向代謝組學（由鹿明生物提供技術支持）、轉錄組、16S微生物多樣性檢測等；

本文通過LC-MS非靶向代謝組、16s微生物多樣性、轉錄組學等多種檢測手段發(fā)現(xiàn)了海藻酸鈉寡糖（AOS）通過增強細胞連接、恢復小腸功能以及改善可能有助于基因表達的轉錄因子來改善busulfan干擾的腸細胞膜；AOS改善血液代謝，以支持小腸功能的恢復。

TOP3??EphB6基因缺陷小鼠的腸道菌群通過介導維生素B6動態(tài)平衡調(diào)節(jié)自閉癥樣行為

英文標題：The gut microbiota regulates autism-like behavior by mediating vitamin B6 homeostasis in EphB6-deficient mice

研究對象：小鼠糞便、腦組織

發(fā)表期刊：Microbiome

影響因子：11.607

發(fā)表時間：2020年8月

合作單位：孫逸仙紀念醫(yī)院

主要運用歐易/鹿明生物技術：16S rRNA基因測序（歐易生物提供技術服務），LC-MS非靶標代謝組（鹿明生物提供技術服務）

文章研究的核心問題——腸道菌群與自閉癥行為的關系，需要通過多項實驗方案，將小鼠的行為學、組織電生理學、腸透性等表型結果，與蛋白質(zhì)轉錄組等檢測結果相互印證，更加入了16S rRNA基因測序和非靶向/靶向代謝組學這兩項研究腸道微生物與宿主關系必不可少的分析手段，最終提出了腸道菌群影響小鼠腦功能缺陷的新機制，揭示了腸腦微生物群軸對ASD的發(fā)展有重大影響的巨大潛力。

TOP4?LncRNA SNHG10通過正反饋環(huán)調(diào)節(jié)其同源基因SCARNA13促進肝癌的發(fā)生和轉移

英文標題：LncRNA SNHG10 Facilitates Hepatocarcinogenesis and Metastasis by Modulating Its Homolog SCARNA13 via a Positive Feedback Loop

研究對象：肝癌腫瘤及配對癌旁組織、細胞系、BALB/c裸鼠

發(fā)表期刊：Cancer Research

影響因子：9.727

合作單位：四川大學華西醫(yī)院

主要運用歐易/鹿明生物技術：RNA-seq測序分析、TMT定量蛋白質(zhì)組學（由鹿明生物提供技術支持）

該研究運用RNA-seq測序分析、TMT定量蛋白質(zhì)組學的多層組學方法報道了SNHG10通過miR-150-5p / RPL4-c-Myb陽性反饋環(huán)調(diào)節(jié)SCARNA13的表達，而SCARNA13通過調(diào)節(jié)HCC中的SOX9促進肝癌細胞的增殖、侵襲和遷移。揭示了非編碼RNA在肝癌發(fā)生和轉移中的作用，為肝癌確定診斷和治療靶點提供新的途徑。

TOP5?腸系膜脂肪細胞中由脂肪去飽和酶（FADS2）介導的脂肪去飽和紊亂導致克羅恩病慢性炎癥

英文標題：Disturbance of Fatty Acid Desaturation Mediated by FADS2 in Mesenteric Adipocytes Contributes to Chronic Inflammation of Crohn's Disease

研究對象：人的脂肪組織

發(fā)表期刊：Journal of Crohn's and Colitis

影響因子：8.658

發(fā)表時間：2020年5月

合作發(fā)表單位：南京大學醫(yī)學院附屬金陵醫(yī)院、青島大學附屬醫(yī)院、南京大學醫(yī)學院附屬鼓樓醫(yī)院、北京大學人民醫(yī)院、中科院遺傳與發(fā)育生物學研究所

主要運用歐易/鹿明生物技術：LC-MS非靶代謝組學(由鹿明生物提供技術支持)

本文通過LC-MS非靶向代謝組學研究方法，發(fā)現(xiàn)了炎癥腸系膜脂肪細胞和巨噬細胞表型轉化中有效調(diào)的節(jié)的細胞因子：FADS2，探究了腸系膜脂肪細胞的代謝譜以及在CD背景下關鍵代謝變化與局部炎癥之間的相關性，描繪了腸系膜脂肪細胞的代謝譜，為治療慢性炎癥性的克羅恩病提供了理論依據(jù)。

鹿明生物

上海鹿明生物科技有限公司，一直專注于生命科學和生命技術領域，是國內(nèi)早期開展以蛋白組和代謝組為基礎的多層組學整合實驗與分析的團隊。經(jīng)過近數(shù)年的發(fā)展沉淀，公司建立起了iTRAQ/TMT、DIA、PRM、修飾蛋白組等蛋白組學技術平臺和全譜代謝組、靶向代謝組、擬靶向代謝組、脂質(zhì)組等代謝組學技術平臺以及相應的數(shù)據(jù)整合分析平臺，并建立了科學完整的服務流程和精細規(guī)范的操作標準。

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文章來源于鹿明生物