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公衛(wèi)考研-小衛(wèi)文獻(xiàn)帶讀 | 全基因組關(guān)聯(lián)研究(GWAS):復(fù)雜疾病相關(guān)的遺傳因素的研究方

2021-02-01 08:44 作者:衛(wèi)燦公衛(wèi)研習(xí)社  | 我要投稿

研究生復(fù)試中少不了考察科研素質(zhì)及專業(yè)能力,這就對考生了解學(xué)科熱點、熟悉學(xué)術(shù)前沿提出了較高的要求。想要在考研復(fù)試中脫穎而出,拔得頭籌,那就得具備一定的文獻(xiàn)閱讀能力,從而了解更多專業(yè)詞匯的英文,掌握科研技巧,提高科研素質(zhì)。


《中華流行病學(xué)雜志》2021年第1期目次,“創(chuàng)刊40周年”板塊刊登了一篇名為《大數(shù)據(jù)時代的流行病學(xué)研究:機(jī)遇、挑戰(zhàn)與展望》的期刊論文,本期“小衛(wèi)帶讀”基于當(dāng)前流行病學(xué)研究的進(jìn)展及研究熱點,為大家簡單介紹一篇關(guān)于全基因組關(guān)聯(lián)研究(GWAS)研究的綜述。

Title

Benefits and limitations of genome-wide assosiation studies.

Abstract

Genome-wide association studies (GWAS) involve testing genetic variants across the genomes of many individuals to identify genotype–phenotype associations. GWAS have revolutionized the field of complex disease genetics over the past decade, providing numerous compelling associations for human complex traits and diseases.


Despite?clear successes in identifying novel disease susceptibility genes and biological pathways and in translating these findings into clinical care, GWAS have not been without controversy.Prominent criticisms include concerns that GWAS will eventually implicate the entire genome in disease predisposition and that most association signals reflect variants and genes with no direct biological relevance to disease.


In this Review,?we comprehensively assess the benefits and limitations of GWAS in human populations and discuss the relevance of performing more GWAS.


01

GWAS簡介

全基因組關(guān)聯(lián)研究(Genome-Wide Association Studies,GWAS)是指在全基因組層面上,開展多中心、大樣本、反復(fù)驗證的基因與疾病的關(guān)聯(lián)研究,是通過對大規(guī)模的群體DNA樣本進(jìn)行全基因組高密度遺傳標(biāo)記(如SNP或CNV等)分型,從而尋找與復(fù)雜疾病相關(guān)的遺傳因素的研究方法,全面揭示疾病發(fā)生、發(fā)展與治療相關(guān)的遺傳基因。


02

研究現(xiàn)狀

全基因組關(guān)聯(lián)研究(GWAS)對許多個體基因組中的數(shù)十萬到數(shù)百萬個基因變異進(jìn)行了測試,以確定基因型-表型關(guān)聯(lián),在過去十年中,它徹底改變了復(fù)雜疾病遺傳學(xué)領(lǐng)域。自2005年發(fā)表第一份關(guān)于年齡相關(guān)性黃斑變性(AMD)的GWAS以來,已經(jīng)報道了基因變異與常見疾病和遺傳缺陷之間超過50000個全基因組意義的關(guān)聯(lián)。


這些關(guān)聯(lián)導(dǎo)致了對疾病易感性結(jié)構(gòu)的洞察(通過識別新的致病基因和機(jī)制),以及臨床護(hù)理(例如,識別新的藥物靶點和疾病生物標(biāo)記物)和個體化醫(yī)學(xué)(例如,風(fēng)險預(yù)測和優(yōu)化藥物)的進(jìn)展基于基因型的治療。


03

主要述評內(nèi)容

在這篇綜述中,評估了在人群中實施GWAS的優(yōu)勢和局限性。作者主要借鑒了從心臟代謝疾病領(lǐng)域獲得的經(jīng)驗教訓(xùn),以突出GWAS的主要進(jìn)展和局限性,盡管GWAS是一種全基因組的基因型分析,可以使用多種技術(shù)進(jìn)行測量,例如全基因組測序(WGS)或全基因組單核苷酸多態(tài)性(SNP)陣列加插補(bǔ),但大多數(shù)GWAS仍然使用SNP陣列的數(shù)據(jù)進(jìn)行。因此,作者討論了作為一般遺傳關(guān)聯(lián)研究設(shè)計的GWAS相關(guān)的優(yōu)點和注意事項,以及基于SNP陣列的GWAS特有的益處和注意事項。


04

主要內(nèi)容梳理


05

總結(jié)(綜合優(yōu)缺點談該項研究的應(yīng)用前景)

GWAS目前的許多限制并非無法克服,至少在某種程度上是可以克服的。例如,更大的樣本量,技術(shù)、方法和計算的進(jìn)步等等。對于一項已有十多年歷史的研究設(shè)計來說,發(fā)表的GWAS數(shù)量仍在不斷增加,這證明了這種方法在闡明復(fù)雜人類特征的遺傳基礎(chǔ)方面取得了持續(xù)的成功。


06

技巧點撥

???閱讀綜述是讓你快速了解某個研究領(lǐng)域的最新進(jìn)展以及優(yōu)勢局限的最好方法。綜述不涉及過多的復(fù)雜研究過程,是整合提煉出某領(lǐng)域近年的大量文獻(xiàn),并加上作者自身的觀點,進(jìn)行針對某一問題的綜合述評。


?? 綜述篇幅略長,但文章結(jié)構(gòu)清晰,主要內(nèi)容體現(xiàn)在摘要和小標(biāo)題上。同時,要關(guān)注圖表的展示,讀懂圖表也是高效閱讀的方法之一。


?? 關(guān)注引言部分的參考文獻(xiàn),綜述引言部分所引用的參考文獻(xiàn)往往是該領(lǐng)域影響力強(qiáng)的文獻(xiàn)。


注:本文涉及大量微觀機(jī)制層面的名詞及一些數(shù)據(jù)統(tǒng)計處理的專用技術(shù)手段,同學(xué)們稍作了解即可??紤]到GWAS等組學(xué)研究為當(dāng)前研究熱點,所以覺得有必要為大家拓寬眼界,擴(kuò)展知識面。


原始出處:Vivian Tam, Nikunj Patel, Michelle Turcotte, et al. Benefits and limitations of genome-wide association studies. 2019, 20(24):467-484.


**注:本文僅供考研學(xué)子學(xué)習(xí)交流,歡迎大家分享自己的看法。


哥哥姐姐們積極準(zhǔn)備復(fù)試呦~

END

帶讀老師 小嘉老師

中國醫(yī)科大學(xué) 公共衛(wèi)生碩士


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