如何寫一篇好文章?中藥入血成分分析研究發(fā)文案例解析
01
研究背景
中藥療效確切、安全性高、副作用小,其多成分多靶點(diǎn)的作用特點(diǎn)已被廣泛接受。研究表明中藥原型入血成分和代謝產(chǎn)物均可能是有效活性成分,因此越來越多的中藥科研工作者展開了對中藥入血成分的分析研究。但據(jù)筆者了解,很多研究者并不清楚如何利用自己的研究數(shù)據(jù)去寫好相關(guān)的文章。為此,本期鹿明生物小編為大家整理了一篇:可以教大家寫好一篇中藥入血成分分析類型文章的完美案例推文,以供大家參考。
02
前言
2022年08月,吉林延邊大學(xué)藥學(xué)院鄭教授課題組在“Food Research International”期刊(IF:7.452)發(fā)表的題為 “Comprehensive characterization of the chemical composition of Lurong
dabu decoction and its absorbed prototypes and metabolites in rat plasma using UHPLC–Q Exactive Orbitrap–HRMS”的研究成果,通過高靈敏度的UPLC-HRMS的研究方法來高分辨率和準(zhǔn)確地識別“鹿茸大補(bǔ)湯(LRDBD)”的物質(zhì)基礎(chǔ),鑒定了122種成分,其中在血漿中鑒定出29種原型入血成分和35種代謝產(chǎn)物。為進(jìn)一步發(fā)現(xiàn)潛在的藥物靶點(diǎn)和揭示LRDBD在哮喘治療中的作用機(jī)制提供了基礎(chǔ)數(shù)據(jù)和方法。
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研究思路
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研究方法
研究材料
(1) 標(biāo)品:標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì),包括甜菜堿、鳥嘌呤、腺苷、(+)-兒茶素、苦杏仁苷、柚皮素和薯蕷皂苷,均購自成都普斯生物科技有限公司(中國四川)。DL-哌啶酸、L-(-)-蘋果酸、次黃嘌呤、尿苷、2′-脫氧核苷、異亮氨酸、(-)-epicatechin、d-酪氨酸、d-脯氨酸、d-組氨酸和甲酸鹽(純度≥98%)購自阿拉丁試劑有限公司(上海);
(2) 生藥水提物:LRDBD水提物;8種單味草藥水提物;
(3) 血漿樣本:LRDBD給藥組(14只大鼠),生理鹽水組(8只)。
研究技術(shù)
(1) 采集/數(shù)據(jù)處理:UHPLC–Q Exactive Orbitrap–HRMS 液質(zhì)聯(lián)用技術(shù),QI軟件/CD軟件;
(2) 數(shù)據(jù)分析:PCA、火山圖;
(3)數(shù)據(jù)庫:mzCloudTM、mzVault、TCM、TCMSP、TCMIP數(shù)據(jù)庫匹配。
05
研究結(jié)果
1、在LRDBD中主要成分鑒定122種
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LRDBD的含量采用高分辨率質(zhì)譜法進(jìn)行分析,對每個峰對應(yīng)的化合物進(jìn)行了初步鑒定。具體的鑒定步驟如下。首先,根據(jù)TCMSP和TCMIP建立8種單一草藥的化學(xué)成分?jǐn)?shù)據(jù)庫。然后,使用CD篩選平臺對MS數(shù)據(jù)進(jìn)行處理和分析,結(jié)合在線(mzCloud、mzVault),以匹配片段信息并識別化合物結(jié)構(gòu)。然后,根據(jù)準(zhǔn)一級精確質(zhì)量和二級碎片(匹配分?jǐn)?shù)大于85,誤差小于5.0 ppm)鑒定。圖1顯示了LRDBD在正離子和負(fù)離子模式下的UHPLC-MS基峰強(qiáng)度(BPI)色譜圖譜。
此外,利用HMDB數(shù)據(jù)庫和ChemDraw Pro對異構(gòu)體的分化進(jìn)行了補(bǔ)充?;谏鲜鲨b定策略,初步鑒定了LRDBD的122種化合物(詳細(xì)信息見表1),包括氨基酸、哌啶生物堿、季銨生物堿、有機(jī)胺生物堿、有機(jī)胺生物堿、苯丙類、嘌呤生物堿、黃酮、脂肪酸及其衍生物、香豆素、氰藻苷、茚生物堿、甾體、同異黃酮等。
圖1 通過UHPLC-HRMS分析得到的LRDBD的基峰強(qiáng)度(BPI)色譜圖
A: 正離子掃描,B:負(fù)離子掃描
表1利用UHPLC–Q Exactive Orbitrap–HRMS鑒定LRDBD的化學(xué)成分。
a通過與標(biāo)準(zhǔn)品比較確定;b鹿角絨;c盾葉薯蕷;d苦艾;e麻黃;f杏仁仁;g麥冬;h蘆筍;i五味子的煎煮過程中產(chǎn)生的新成分
1.1對LRDBD中主要成分進(jìn)行來源歸屬
使用UHPLC–Q Exactive Orbitrap–HRMS對八種單一草藥煎劑進(jìn)行分析。然后LRDBD化合物的相對來源也得到了證實。8種單藥草在正、負(fù)離子模式下的BPI色譜圖見圖2。
圖2 ?用UHPLC-HRMS分析獲得的8種單一草藥的BPI色譜圖
1.2對LRDBD中主要成分進(jìn)行標(biāo)品比對確認(rèn)
根據(jù)保留時間、一級分子量的準(zhǔn)確測定,以及MS2片段(二級碎片)與標(biāo)準(zhǔn)品的比較結(jié)果,準(zhǔn)確鑒定了LRDBD中的17個化合物(見圖3)。
圖3 基于與參考標(biāo)準(zhǔn)品比較的化合物鑒定
1.3對LRDBD中122種化學(xué)成分進(jìn)行結(jié)構(gòu)明確
為了明確所鑒定122種化合物的結(jié)構(gòu),圖4展現(xiàn)了鑒定的化合物的主要結(jié)構(gòu)分類:圖4顯示了主要成分的化學(xué)結(jié)構(gòu)分類。根據(jù)取代基的不同,鑒定出10種氨基酸、1種哌啶生物堿、2種季銨生物堿、6種有機(jī)胺生物堿、3種苯丙烷類、8種嘌呤生物堿、14種黃酮類化合物、17種脂肪酸化合物及其衍生物、3種香豆素類、2種氰基糖苷、2種吲哚生物堿、5種類固醇和2種同源異黃酮。
圖4在LRDBD中鑒定的主要成分的化學(xué)結(jié)構(gòu)
另外,還鑒定出了其他43種化合物,如圖5所示。包括氨基酸、生物堿、苯丙素、氰磷酸糖苷、黃酮類化合物、脂肪酸及其衍生物。
圖5 在LRDBD中鑒定出的其他化合物的化學(xué)結(jié)構(gòu)
2、對LRDBD中不同成分類型的化合物鑒定過程進(jìn)行推導(dǎo)
通過對CD數(shù)據(jù)與參考文獻(xiàn)的比較,對LRDBD中氨基酸、生物堿類、苯丙素類、糖苷類、黃酮類、脂肪酸及其衍生物、及其他化學(xué)成分類型的鑒定過程進(jìn)行推導(dǎo)說明。質(zhì)譜圖見圖6,具體推導(dǎo)鑒定過程如下:
2.1氨基酸
通過對CD數(shù)據(jù)與參考文獻(xiàn)的比較,鑒定出了13個氨基酸。峰27在m/z 182.08127處有一個偽分子離子,在m/z136.07570([M+H-COOH]+)和m/z119.04934([M+H-COOH-NH3]+)處產(chǎn)生主要離子。在羧基的中性損失后,m/z 182處的碎片離子在m/z 136處產(chǎn)生了一個堿基峰,表明存在一個羧基。在羧基的中性損失后,m/z 182處的碎片離子在m/z 136處產(chǎn)生了一個堿基峰,表明存在一個羧基,因此,峰27被分配為d-酪氨酸(圖6-A)。
圖6-A d-酪氨酸質(zhì)譜圖和化合物可能的破碎途徑
2.2 生物堿類
在LRDBD中鑒定出36種生物堿,包括哌啶生物堿、季銨鹽生物堿、有機(jī)胺生物堿、嘌呤生物堿和銦生物堿。通過與參考標(biāo)準(zhǔn)的比較,峰28被明確地指定為腺苷。腺苷的質(zhì)譜和可能的片段途徑如圖6-B所示。
圖6-B 腺苷質(zhì)譜圖和化合物可能的破碎途徑
其余類型化合物推導(dǎo)及圖見原文:doi: 10.1016/j.foodres.2022.111852.
3、LRDBD與單一草藥的多因素統(tǒng)計分析:復(fù)方中存在23種單一草藥中沒有的新化合物
在使用CD軟件對原始數(shù)據(jù)進(jìn)行比對和去卷積后,去除QC樣品中峰面積變化系數(shù)低于30%的背景離子和化合物,用于進(jìn)一步的PCA主成分和火山圖的多元分析。首先,PCA評分圖突出了QC樣品相對緊密的聚類,證實了樣品的色譜分離和質(zhì)譜分析在整個分析過程中都是穩(wěn)定的,數(shù)據(jù)的準(zhǔn)確性較好。然而,在LRDBD組和單藥草組的PCA評分圖中明顯分離(圖7-A)。
圖7-A ?從LRDBD和8種單一草藥中提取的正、負(fù)離子模式下的化合物的PCA評分圖
LRDBD和8種單一草藥的分析結(jié)果被總結(jié)在一個維恩圖中。如圖7-B所示,LRDBD湯劑中存在23種新成分。由于相容性、加熱等的影響,以及中藥化學(xué)成分的復(fù)雜性,LRDBD在煎煮過程中由于溶液中化學(xué)成分的絡(luò)合、水解、氧化或還原反應(yīng),可能產(chǎn)生新的成分。根據(jù)已知化合物,結(jié)合保留時間、m/z比和MS/MS片段信息,結(jié)合結(jié)構(gòu)推斷,從23種新成分中鑒定出9種成分:奎寧酸、原花青素A2、多聚素、氧白藜蘆醇、丙豆酸、18β-甘氨酸、2-羥丙基硬脂酸酯、單烯酸和化合物49。
圖7-B ?維恩圖顯示了在LRDBD和8種單一草本植物中鑒定出的和重疊的植物化學(xué)物質(zhì)的數(shù)量
其他化合物由于缺乏標(biāo)準(zhǔn)無法完全鑒定,數(shù)據(jù)庫中無法檢索,需要進(jìn)一步鑒定。建立并生成了一個火山模型,進(jìn)一步表征了其顯著性差異(圖7-C)。P值小于0.001和FC大于3的變量表示與LRDBD中8種單一草藥成分不同的化合物。
圖7-C ?8種不同單一草藥在正負(fù)離子模式下提取的LRDBD化合物的差異分析
據(jù)此,篩選出了39種化合物??偟膩碚f,LRDBD和8種不同的單一草藥之間有39種化合物不同。該分析還反映了多種藥物的多種成分之間復(fù)雜的相互作用,這不同于單一藥物。其具體機(jī)制有待進(jìn)一步研究。
4、大鼠血漿中鑒定了LRDBD的原型成分29個和代謝物35個
口服LRDBD 4天后,在不同時間采集大鼠血漿樣本。我們將在所有時間點(diǎn)收集的血漿樣本混合,以獲得用于分析的劑量血漿??瞻籽獫{和LRDBD分別作為陰性對照和陽性對照。提取的色譜峰,出現(xiàn)在給藥的血漿中和LRDBD中,而不是空白血漿中,即被確定為吸收的原型成分。根據(jù)這一標(biāo)準(zhǔn),通過將準(zhǔn)確的質(zhì)量和保留時間與LRDBD中識別的成分信息進(jìn)行比較,來確定LRDBD的可吸收成分。利用CD平臺上精確的精確質(zhì)譜和串聯(lián)質(zhì)譜數(shù)據(jù)進(jìn)行進(jìn)一步確認(rèn)。具體的識別過程如圖8所示。
圖8 進(jìn)入血液中吸收的LRDBD成分的成分分析
此外,使用CD軟件比較了給藥血漿和空白血漿的質(zhì)譜數(shù)據(jù),以鑒定代謝物。在給藥的血漿中檢測到代謝物,但在空白血漿和LRDBD中沒有檢測到,并且具有與原型成分相同的離子片段。
4.1 鑒定被血液吸收的原型成分29種
根據(jù)提取離子色譜(EIC)函數(shù),與LRDBD成分相比,鑒定出29種原型成分作為給藥血漿中的吸收成分(表2)。此外,29個原型成分中有15個原型成分來自鹿茸,這與鹿茸是主要活性成分的SM理論相一致。所吸收的成分與LRDBD中的主要活性物質(zhì)相對應(yīng)。我們的研究結(jié)果為LRDBD的進(jìn)一步研究提供了標(biāo)志性化合物和方法參考。
4.2 35種代謝產(chǎn)物的鑒定
如表3所示,用CD軟件對大鼠血漿中16種原型成分轉(zhuǎn)化的35種代謝物進(jìn)行了分析。主要發(fā)生I相代謝反應(yīng),如硝基還原、氧化脫氨為醇、去飽和、還原、水化、氧化、脫水、氧化脫氨為酮、去甲基化和II相代謝反應(yīng),如乙?;?、甲基化、硫酸化。
表3 大鼠血漿中LRDBD的代謝物
以M19為例,說明代謝物的鑒定過程。M19在m/z 119.08604處有一個前體離子[M+H]+,主要特征產(chǎn)物離子為m/z91.054[M+H?C2H2]+和m/z115.054[M+H?H4] +。M19的前體離子比麻黃堿小47 Da,如圖9-A所示,M19的特征片段與麻黃堿相似。根據(jù)M19的相關(guān)質(zhì)譜裂解行為,推導(dǎo)是麻黃堿去飽和+硝基還原的代謝物。此外,比較M35與硬脂酰胺的精確分子量,質(zhì)譜結(jié)果表明,m/z57.071[m+H-?C15H30NO]+為碎片離子,與硬脂酰胺的碎片離子一致。因此,M35是硬脂酰胺的II相代謝物(圖9-B)。其他的代謝物也以類似的方式被鑒定出來。
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圖9 LRDBD中原型化合物的碎片離子
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研究結(jié)論
1、本研究建立了高靈敏度、高分辨率的UHPLC--HRMS法測定LRDBD的物質(zhì)基礎(chǔ),并將煎煮后的LRDBD與8種單藥的成分進(jìn)行比較。
2、在LRDBD中鑒定出122種化合物,包括氨基酸、苯丙素、生物堿、黃酮、脂肪酸化合物及其衍生物、黃酮類等。這是第一次對LRDBD的化學(xué)成分進(jìn)行了全面的表征。
3、在LRDBD中檢測到23種新成分是8種單藥中不存在的,可能是煎煮過程中藥物之間的化學(xué)成分相互作用。此外,統(tǒng)計分析LRDBD和8種單一藥草之間有39種化合物不同。這一結(jié)果也反映了多種藥物的多種成分之間復(fù)雜的相互作用,不同于單一藥物。
4、大鼠血漿中鑒定出29種LRDBD的原型成分和35種代謝物。去飽和、還原、水化、氧化、脫水、去甲基化、乙?;⒓谆土蛩猁}化是主要的代謝途徑。其中,鹿茸原型成分15種,在血漿中所占比例最大。上述結(jié)果與SM理論:鹿茸在哮喘治療中起主要作用相一致。本研究將有助于對哮喘癥狀指導(dǎo)網(wǎng)絡(luò)的藥理分析,以及發(fā)現(xiàn)潛在的藥物靶點(diǎn),揭示LRDBD在哮喘治療中的作用機(jī)制。
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鯤?撰文
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