這塊內(nèi)容首次發(fā)在網(wǎng)頁端，隨緣改進，暫不排版。

特別鳴謝：

以下是正文：

軟件版本：Bonsai 2.7.2

下載地址：https://wwxr.lanzoum.com/b04e7vugd 密碼:i8ke

更多內(nèi)容詳見官網(wǎng)：http://bonsai-rx.org/

安裝并運行Bonsai，選擇已經(jīng)設(shè)置好的Workflow《pupil size.bonsai》。

首次運行軟件時需安裝指定功能包。

模塊概述

序號

0：運行流程

1：導(dǎo)入視頻

2：裁剪畫面（可選）

3：BGR色彩模式轉(zhuǎn)黑白模式（可選）

4：黑白轉(zhuǎn)回BGR（可選）

5：BGR轉(zhuǎn)HSV

6：設(shè)置HSV閾值范圍

7：查找符合閾值范圍的區(qū)域

8：分析這些區(qū)域的大小

9：選取其中最大的一個區(qū)域（應(yīng)為孔徑）

10：逐幀分析該區(qū)域的最長徑和最短徑

11：導(dǎo)出孔徑數(shù)據(jù)。

模塊1、11：

選擇模塊1導(dǎo)入需要分析的視頻；選擇模塊11預(yù)設(shè)結(jié)果導(dǎo)出路徑。

模塊1：

運行流程前雙擊模塊1可導(dǎo)入視頻，運行后雙擊可播放視頻，播放完畢流程會自動停止。

為了能有充分的時間設(shè)置參數(shù)，默認(rèn)開啟loop功能，設(shè)置完參數(shù)后建議關(guān)閉loop。

模塊2、3、4：

默認(rèn)不啟用，視情況手動選擇是否開啟。

模塊2：

用于在固定位置剪裁視頻。

在運行狀態(tài)下雙擊模塊2，按圖示選取要截取的區(qū)域。四個數(shù)字分別代表：（紅色截取區(qū)域與窗口左邊界的距離、與上邊界的距離、區(qū)域長、區(qū)域?qū)挘?/p>

模塊3、4：

個別視頻拍到的瞳孔邊界不夠清晰，可通過模塊3將原視頻畫面從BGR色彩模式轉(zhuǎn)為Gray模式，再通過模塊4令Gray模式重新轉(zhuǎn)為BGR模式，此時瞳孔邊界也許能清晰一些。

但這種方法不一定有用，且會造成畫面色彩丟失降低分析效果。拍攝清晰的原始視頻對后期的數(shù)據(jù)分析非常重要。

模塊5：

用于將畫面從BGR色彩模式轉(zhuǎn)為HSV模式，可以查看視頻畫面的HSV色值（圖中省略了模塊2、3、4，不影響運行）。

模塊6：

用于設(shè)置瞳孔所在區(qū)域的HSV數(shù)值范圍，不同視頻的HSV閾值不同，此處僅為舉例。

由于該值會影響最終結(jié)果，且數(shù)值的確定受分析者的主觀影響較大，建議記下每個視頻分析使用的HSV閾值范圍。

模塊7、8、9、10：

這四個模塊無需額外操作，功能參考3.流程概述。確認(rèn)捕捉到良好的瞳孔畫面后重啟流程，運行結(jié)束即可在模塊11的預(yù)設(shè)目錄查看孔徑數(shù)據(jù)。

若沒開loop，軟件會在后臺播放完一輪視頻便自動停止，并生成該輪視頻中孔徑變化數(shù)據(jù)的csv文件；若打開loop，則需手動停止，并生成與實際循環(huán)播放時間相同的孔徑變化數(shù)據(jù)。

最終獲得的數(shù)據(jù)參考：

第一列為LargestBinaryRegion視頻中藍(lán)色線條（MajorAxisLength）的長度，單位為像素（pixel）；

第二列為LargestBinaryRegion視頻中紅色線條（MinorAxisLength）的長度，單位為像素（pixel）；

行數(shù)為FileCapture視頻中畫面的幀數(shù)（Frame）。