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孟德爾隨機(jī)安裝包(TwoSampleMR)安裝

2023-06-16 00:51 作者:無序意識(shí)  | 我要投稿

自己剛學(xué)MR,因?yàn)閮蓚€(gè)安裝包,搞了2天,終于搞定了,做了五六種嘗試,最終下面這種方式成功了。也幫朋友成功安裝。采用的本地安裝。最下面有參考網(wǎng)址,非常感謝網(wǎng)友的建議。

安裝包下載

install.packages("devtools")

library("devtools")

devtools::install_local('/Users/y/Desktop/TwoSampleMR/MRInstruments.zip')

devtools::install_local('/Users/y/Desktop/TwoSampleMR/MRPRESSO.zip')

?

devtools::install_local('/Users/y/Desktop/TwoSampleMR/TwoSampleMR-master.zip')

不行,因?yàn)槿狈σ蕾嚨陌?/p>

devtools::install_local('/Users/y/Desktop/TwoSampleMR/TwoSampleMR-master.zip',dependencies = F)

?

#出現(xiàn)ERROR,原因是沒有一些依賴包,手動(dòng)安裝這些依賴包

?

#安裝TwoSampleMR的依賴包

install.packages("car")

install.packages("glmnet")

install.packages("MendelianRandomization")

install.packages("meta")

install.packages("mr.raps")

install.packages("MRMix")

install.packages("psych")

install.packages("googleAuthR")

?

devtools::install_local('/Users/y/Desktop/TwoSampleMR/ieugwasr-master.zip',dependencies = F)

?

devtools::install_local('/Users/y/Desktop/TwoSampleMR/MRMix-master.zip',dependencies = F)

?

devtools::install_local('/Users/y/Desktop/TwoSampleMR/RadialMR-master.zip',dependencies = F)

?

#最后安裝TwoSampleMR

devtools::install_local('/Users/y/Desktop/TwoSampleMR/TwoSampleMR-master.zip',dependencies = F)

大家盡量復(fù)制,不要漏了詞,否則出錯(cuò)很難發(fā)現(xiàn)。一些需要GIHUB下載的安裝包我已經(jīng)下載,需要的可以分享給大家,就不需要科學(xué)上網(wǎng)找了。最后如果再遇到這種問題其實(shí)花錢找專業(yè)的弄是最好的,自己真的很浪費(fèi)時(shí)間。

?

參考:https://blog.csdn.net/ACGTexplorer/article/details/127704914

需要本地安裝的安裝包在這里

鏈接:https://pan.baidu.com/s/1JBKyfUXL4RxqafQqWrhcIw?pwd=1234?

提取碼:1234


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