? ? ?11月份單細(xì)胞測(cè)序相關(guān)文獻(xiàn)共收集到42篇（IF>9），文末列表中列出文獻(xiàn)發(fā)表期刊、研究方向和技術(shù)平臺(tái)等信息，接下來(lái)先看看其中5篇。

文章展示

【標(biāo)題】人類肺單細(xì)胞RNA測(cè)序的分子細(xì)胞圖譜【平臺(tái)】Smart-seq2，10X【期刊】Nature（IF=43.1）【時(shí)間】2020-11-18【摘要】雖然單細(xì)胞RNA測(cè)序研究已經(jīng)提供了細(xì)胞表達(dá)譜的報(bào)道，但要系統(tǒng)地識(shí)別和定位單個(gè)器官中的所有分子細(xì)胞類型以創(chuàng)建完整的分子細(xì)胞圖譜一直是困難的。本研究中，研究者使用基于液滴和平板的單細(xì)胞RNA測(cè)序，對(duì)所有肺組織和循環(huán)血液中的大約75,000個(gè)人類細(xì)胞進(jìn)行測(cè)序，結(jié)合多種細(xì)胞注釋方法，創(chuàng)建了一份人類肺的廣泛細(xì)胞圖譜。研究者定義了人類肺中58個(gè)細(xì)胞群體的基因表達(dá)譜和解剖位置，包括45種已知細(xì)胞類型中的41種和14種以前未知的細(xì)胞類型。這份全面的分子圖譜確定了肺細(xì)胞的生化功能以及轉(zhuǎn)錄因子和用于制造和監(jiān)測(cè)它們的標(biāo)記物；確定循環(huán)激素的細(xì)胞靶點(diǎn)，并預(yù)測(cè)了局部信號(hào)相互作用和免疫細(xì)胞歸巢；并確定了直接受肺部疾病基因和呼吸道病毒影響的細(xì)胞類型。通過(guò)比較人類和小鼠的數(shù)據(jù)，研究者確定了17種在肺進(jìn)化過(guò)程中獲得或丟失的分子細(xì)胞類型，以及其他表達(dá)譜發(fā)生顯著變化的分子細(xì)胞類型，這揭示了器官進(jìn)化過(guò)程中細(xì)胞類型和細(xì)胞類型特異性基因表達(dá)的廣泛可塑性和特定于細(xì)胞類型的基因表達(dá)。這份圖譜為研究肺細(xì)胞的特性、功能和相互作用如何在發(fā)育和組織工程中實(shí)現(xiàn)，以及在疾病和進(jìn)化中如何改變提供了分子基礎(chǔ)。

【標(biāo)題】頭頸癌患者HPV特異性B細(xì)胞應(yīng)答的確定【平臺(tái)】10X【期刊】Nature（IF=43.1）【時(shí)間】2020-11-18【摘要】腫瘤通常含有B細(xì)胞和漿細(xì)胞，但這些腫瘤內(nèi)B細(xì)胞的抗原特異性尚不清楚。本文中，研究者發(fā)現(xiàn)在人類乳頭瘤病毒(HPV)陽(yáng)性的頭頸癌患者的樣本中可以檢測(cè)到HPV特異性的B細(xì)胞反應(yīng)，并原位產(chǎn)生HPV特異性的IgG抗體。HPV特異性抗體分泌細(xì)胞(ASCs)存在于腫瘤微環(huán)境中，招募來(lái)的流感病毒特異性ASCs較少，提示有局部和抗原特異性的ASC反應(yīng)。HPV特異性ASC反應(yīng)與血漿IgG效價(jià)相關(guān)，并針對(duì)HPV蛋白E2、E6和E7，其中對(duì)E2的反應(yīng)最明顯。利用腫瘤內(nèi)的B細(xì)胞和漿細(xì)胞，研究者產(chǎn)生了幾種HPV特異性的人類單克隆抗體，這些抗體表現(xiàn)出高度的體細(xì)胞超突變，與慢性抗原暴露相一致。單細(xì)胞RNA測(cè)序分析檢測(cè)到腫瘤微環(huán)境中激活的B細(xì)胞、生發(fā)中心B細(xì)胞和ASCs。與腫瘤實(shí)質(zhì)相比，B細(xì)胞和ASCs優(yōu)先定位于腫瘤基質(zhì)中，并具有活化B細(xì)胞形成的簇，這表明生發(fā)中心反應(yīng)正在進(jìn)行。總的來(lái)說(shuō)，研究者發(fā)現(xiàn)在腫瘤微環(huán)境中可以發(fā)現(xiàn)抗原特異性激活的生發(fā)中心B細(xì)胞以及漿細(xì)胞。這些發(fā)現(xiàn)為人類癌癥中的體液免疫反應(yīng)提供了更好的理解，并提示可以利用腫瘤浸潤(rùn)性B細(xì)胞開(kāi)發(fā)治療劑。

【標(biāo)題】體內(nèi)Perturb-Seq揭示與自閉癥風(fēng)險(xiǎn)基因相關(guān)的神經(jīng)元和神經(jīng)膠質(zhì)異常【平臺(tái)】10X【期刊】Science（IF=41）【時(shí)間】2020-11-27【摘要】通過(guò)人類遺傳學(xué)研究確定的疾病風(fēng)險(xiǎn)基因和位點(diǎn)的數(shù)量遠(yuǎn)遠(yuǎn)超過(guò)系統(tǒng)研究其功能的能力。研究者開(kāi)發(fā)了一種體內(nèi)大規(guī)模的遺傳功能研究技術(shù)Perturb-Seq，這個(gè)方法檢測(cè)了35個(gè)自閉癥譜系障礙/神經(jīng)發(fā)育延遲（ASD/ND）新發(fā)的喪失功能的風(fēng)險(xiǎn)基因。研究者利用CRISPR-Cas9在這個(gè)35個(gè)風(fēng)險(xiǎn)基因中引入移碼突變，隨后轉(zhuǎn)染進(jìn)子宮內(nèi)發(fā)育的小鼠大腦中，然后對(duì)出生后大腦中受到干擾的細(xì)胞進(jìn)行單細(xì)胞RNA測(cè)序。研究者從神經(jīng)元和神經(jīng)膠質(zhì)細(xì)胞分類中鑒定了細(xì)胞類型特異性和進(jìn)化保守的基因模塊。這些風(fēng)險(xiǎn)基因的擾動(dòng)會(huì)影響到神經(jīng)發(fā)育過(guò)程中反復(fù)出現(xiàn)的基因模塊和細(xì)胞類型，證明這些風(fēng)險(xiǎn)基因?qū)﹃P(guān)鍵細(xì)胞過(guò)程的影響。體內(nèi)Perturb-Seq使他們能夠研究各種突變?nèi)绾斡绊懓l(fā)育中生物的細(xì)胞類型和狀態(tài)。

【標(biāo)題】將畸胎瘤作為人類多譜系發(fā)育模型【平臺(tái)】10X【期刊】Cell（IF=36.2）【時(shí)間】2020-11-4【摘要】研究者認(rèn)為畸胎瘤是鑒定干細(xì)胞多能性的公認(rèn)標(biāo)準(zhǔn)，可能是研究人類發(fā)育過(guò)程的一個(gè)很有前途的平臺(tái)。對(duì)來(lái)自4個(gè)細(xì)胞系的23個(gè)畸胎瘤的179,632個(gè)細(xì)胞進(jìn)行單細(xì)胞RNA測(cè)序(RNA-seq)，研究者發(fā)現(xiàn)畸胎瘤在所有3個(gè)胚層中可包含約20種細(xì)胞類型，畸胎瘤間細(xì)胞類型的異質(zhì)性與器官系統(tǒng)相媲美，畸胎瘤腸道和腦細(xì)胞類型與相似的胎兒細(xì)胞類型非常吻合。此外，細(xì)胞條形碼驗(yàn)證了注射的干細(xì)胞能夠牢固地植入，并對(duì)所有譜系做出貢獻(xiàn)。研究者利用CRISPR-Cas9進(jìn)行基因敲除篩查，結(jié)果發(fā)現(xiàn)畸胎瘤可以同時(shí)分析所有胚層的遺傳干擾的影響。此外，他們還證明，畸胎瘤可以通過(guò)microRNA(MiRNA)調(diào)節(jié)的自殺基因表達(dá)來(lái)形成分子模型，以豐富特定組織?？偠灾チ鍪墙６嘧V系發(fā)育、泛組織功能基因篩查和組織工程的一個(gè)很有前途的平臺(tái)。

【標(biāo)題】揭示角質(zhì)細(xì)胞的增殖和遷移對(duì)鼓膜維持的貢獻(xiàn)【平臺(tái)】10X【期刊】Cell Stem Cell（IF=21.6）【時(shí)間】2020-11-11【摘要】鼓膜(TM)對(duì)聽(tīng)力至關(guān)重要，需要持續(xù)清除細(xì)胞碎片，但對(duì)TM表皮的穩(wěn)態(tài)機(jī)制知之甚少。研究者利用單細(xì)胞RNA測(cè)序、譜系追蹤、全器官移植和活細(xì)胞成像技術(shù)，發(fā)現(xiàn)穩(wěn)態(tài)TM表皮有別于其他表皮部位，具有離散的增殖區(qū)以及多個(gè)角質(zhì)形成細(xì)胞群體的3D結(jié)構(gòu)。TM干細(xì)胞散在分布于鼓膜，并產(chǎn)生長(zhǎng)壽克隆和定形祖細(xì)胞(CP)。CP克隆表現(xiàn)側(cè)向遷移，其增殖能力得到PDGFRA+成纖維細(xì)胞的調(diào)控產(chǎn)生遷移性。人類TM的單細(xì)胞測(cè)序揭示了相似的細(xì)胞類型和轉(zhuǎn)錄進(jìn)程。因此，在穩(wěn)態(tài)過(guò)程中，TM角質(zhì)形成細(xì)胞通過(guò)增殖的CP狀態(tài)，表現(xiàn)出側(cè)向遷移。為理解TM疾病和建立角質(zhì)形成細(xì)胞生物學(xué)模型奠定了基礎(chǔ)。

文章列表
下表列出42篇文獻(xiàn)信息，一起看看有沒(méi)有您關(guān)注的研究方向，掃描下方二維碼獲取文獻(xiàn)原文。

掃碼獲取文獻(xiàn)原文