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多重填補的tipping point analysis

2023-08-09 13:54 作者:陸震同學(xué)  | 我要投稿

問題

前面我寫了多重填補的統(tǒng)計學(xué)考慮與SAS實現(xiàn)這篇文章,里面提了一嘴MI的tipping point analysis。小伙伴們在后臺私信留言說寫一下tipping point analysis。今天它來了。

MNAR缺失模式

我們提到,對于MI的sensitivity analysis,常見的分析就是做tipping point analysis,它主要就是評估在MNAR(missing not at random)缺失模式下,該缺失值填補對主分析結(jié)果的影響,判斷主分析的結(jié)果是否是對于MAR的假設(shè)是穩(wěn)健的。

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換句話說,MI在MAR的前提假設(shè)下能夠提供無偏的效應(yīng)值的綜合估計。而tipping point analysis就是要做下壓力測試,即估計需要數(shù)據(jù)缺失多大程度上背離MAR,主分析的結(jié)果會被推翻(由p%5Cleq0.05變?yōu)?img type="latex" class="latex" src="http://api.bilibili.com/x/web-frontend/mathjax/tex?formula=p%3E0.05" alt="p%3E0.05">)。?

特別是在臨床試驗中,由于我們很難基于收集到的數(shù)據(jù)有百分百的把握確認(rèn)MAR的缺失,這個時候,tipping point analysis的結(jié)果對于主分析的結(jié)論就有一定程度上的驗證能力了。

tipping point analysis (tpa)

怎么做tpa?一般地,我們遵循以下的步驟:

  1. 數(shù)據(jù)先經(jīng)過標(biāo)準(zhǔn)的MI的處理。這個我們在多重填補的統(tǒng)計學(xué)考慮與SAS實現(xiàn)這篇文章中已經(jīng)完整介紹過了。

  2. 重復(fù)第一步的MI缺失值填補,但不同的是,這一步我們要求MI填補時,著重將試驗藥組的缺失值調(diào)整到更不利于試驗藥效果的數(shù)值,而將對照組的缺失值調(diào)整到更有利于對照組藥物效果的數(shù)值。

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舉個例子。某治療疣(wart)的藥物。我們需要在不同的visit采用Physician Wart Assessment (PWA) scale來評估疣的治療效果。這時候,兩組藥物受試者在不同的訪視存在PWA的缺失。此時,按照我們上面說的原則,在做tpa時,我們要求MI填補時盡可能將試驗組的PWA分?jǐn)?shù)填補得更高一些(即,治療效果更差),如我要求其PWA分?jǐn)?shù)的shift范圍是0-3,每次以0.5的速度增加;而將對照組的PWA分?jǐn)?shù)填補得更低(即,治療效果更好),我同樣要求其PWA分?jǐn)?shù)的shift范圍是0-3,每次以0.5的速度增加。這樣的話,即存在7*7= 49種填補的結(jié)果。然后我們分別針對每種情況得到的填補數(shù)據(jù)集,重復(fù)普通的MI過程,來綜合估計效應(yīng)值。最后來check主分析的結(jié)論是否會被推翻(p%3E0.05)。?

  1. 我們也可以在第2步的基礎(chǔ)上,采用更大的shift范圍,來看到何種程度時,主分析的結(jié)果會被完全推翻。

有同學(xué)可能就問了,那么這個shift范圍參數(shù)的選擇,有沒有一定的依據(jù)?這個參數(shù),一般,我們會根據(jù)藥物實際效應(yīng)的估計值來相應(yīng)地評估選擇。簡單點說,我們預(yù)估它在多大程度上shift在現(xiàn)實中是有可能發(fā)生的,那么采用這個范圍就是可行的。在這個范圍之內(nèi),主分析MI的結(jié)果都不會被推翻,那么我們就可以有足夠的信心,來說明主分析的結(jié)果是穩(wěn)健的了。而這也就是MI的tipping point analysis了。

示例tpa的sas實現(xiàn)代碼,會放在知識星球上,感興趣的朋友可以自行去查看。

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