鳥槍法測序是一種將DNA序列隨機打散成許多小片段，并通過觀察重疊區(qū)域重新組裝序列的測序方法。 較大的哺乳動物基因組難以克隆序列和組裝。 這是由于它們的結(jié)構(gòu)復雜性和尺寸。 盡管通過克隆測序方法是可靠的，但對復雜生物的基因組進行測序需要很長時間。 因此，通過鳥槍法測序已成為一種可靠且成本更低、執(zhí)行速度更快的測序方法。 因此，現(xiàn)代科學家依靠這種測序方法來處理復雜的基因組。

在通過鳥槍測序方法進行克隆的過程中，沒有進行常規(guī)的基因組作圖和克隆步驟。 最初，整個基因組被分成不同大小的片段，從 20 千堿基到 300 千堿基不等。 接下來，進行測序。 然后，使用復雜的計算機軟件，有必要通過查看重疊區(qū)域來組裝片段。

想象一下，從一本書中取出一頁，復制數(shù)百份，然后將這些副本放入碎紙機中，碎紙機神奇地產(chǎn)生了紙條，其中包含起始頁上原始句子的各種點點滴滴。 然后想象一下，閱讀每條包含句子片段的條帶，尋找重疊的單詞和短語，并最終能夠通過閱讀足夠多的那些紙片，在起始頁上重建整個文本。 從本質(zhì)上講，這就是鳥槍法 DNA 測序。 科學家不是從一頁書開始，而是從一段克隆 DNA 甚至整個基因組開始。 DNA 被分解，從 DNA 片段中產(chǎn)生許多很多很多序列讀數(shù)。 所有這些數(shù)據(jù)都由一個計算機程序進行分析，該程序?qū)ふ抑丿B的序列片段，并最終將 DNA 拼圖拼湊起來。

通過鳥槍法測序有助于提高現(xiàn)有基因組序列的準確性。 這種方法的主要優(yōu)點是它比通過測序方法進行克隆更快且更便宜。 但是，此過程不涉及使用遺傳圖譜。 因此，在組裝過程中更容易發(fā)生錯誤。 因此，這是鳥槍法的主要缺點。

圖1.流感嗜血桿菌基因組的測序