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酸菜 | 《三十六策重置版》(解螺旋)第九策因材施教

2023-06-18 09:10 作者:Nuuuuuuuur  | 我要投稿

1.有表達(dá):在疾病中有表達(dá)差異。

qPCR:檢測(cè)mRNA表達(dá)水平

WB:檢測(cè)蛋白水平變化。

需用到測(cè)序:設(shè)計(jì)引物、克隆基因(用于過表達(dá))、設(shè)計(jì)siRNA、shRNA。


檢索基因:三個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)

從GENE數(shù)據(jù)庫(kù)找到基因可以鏈接到nucleotide里的mRNA

腺病毒:主要用于做過表達(dá),做RNA干擾時(shí)免疫源性較強(qiáng),不推薦。

慢病毒:本質(zhì)是逆轉(zhuǎn)錄病毒;尤其適合做RNAi,也可用于CRISPR;表達(dá)短的插入片段;理論上整合到基因組可長(zhǎng)期穩(wěn)定表達(dá);過表達(dá)上有局限性,是一個(gè)沉默載體。

腺相關(guān)病毒:過表達(dá)載體。

做RNAi干擾時(shí):shRNA 是siRNA的前體。前者更穩(wěn)定

陰性對(duì)照:

過表達(dá)實(shí)驗(yàn)里,陰性對(duì)照是空載體;

RNAi里,是一段打亂的序列,一段無效的siRNA



拯救實(shí)驗(yàn):能很好的消除假陽(yáng)性;在一個(gè)細(xì)胞里進(jìn)行正反兩次驗(yàn)證。

單變量拯救實(shí)驗(yàn):先把基因用siRNA沉默掉,然后把穩(wěn)定沉默基因的細(xì)胞再分成兩組,一組轉(zhuǎn)空載體對(duì)照,另一組轉(zhuǎn)入過表達(dá)載體,及過表達(dá)和沉默(細(xì)胞表型功能)。再在一個(gè)細(xì)胞里先沉默后過表達(dá)(反之亦然),將其表型與沉默和過表達(dá)的表型做對(duì)比。



配圖:

fig.1:組織和細(xì)胞表達(dá)的數(shù)據(jù)。

fig.2:細(xì)胞水平(in vitro)功能研究。a.提供過表達(dá)或者沉默有效的數(shù)據(jù);其余的應(yīng)該是用來檢測(cè)表型功能的實(shí)驗(yàn):如增值和細(xì)胞周期的表型(增值:細(xì)胞生長(zhǎng)曲線;細(xì)胞周期:流式),一個(gè)表型用多個(gè)不同原理實(shí)驗(yàn)進(jìn)行佐證。

fig.3:體內(nèi)動(dòng)物實(shí)驗(yàn)in vivo水平表型驗(yàn)證。



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