WB實驗

01蛋白提取
? 細胞樣品在提取前需要使用PBS清洗兩遍,以減少培養(yǎng)基對樣品的干擾,懸浮細胞可500Xg低速離心后收集進行蛋白提取。貼壁細胞可在培養(yǎng)器皿中直接進行蛋白提取。蛋白提取前建議進行細胞計數(shù),以確定提取中添加裂解液的比例,得到最佳提取效率。
? 組織樣品在提取前也需要用PBS清洗,一些含血量豐富的組織,建議使用紅細胞破裂液去除紅細胞,以避免血液中IgG對后續(xù)實驗的影響。
? 為了防止蛋白降解、去磷酸化,各種蛋白酶抑制劑、磷酸酶抑制劑都是必須的。
? 在提取蛋白的時候僅僅靠裂解液有時候也不能達到完全抽提的效果,有條件的話,可以對抽提懸液進行超聲破碎處理;超聲的時候,因為超聲發(fā)熱損傷蛋白,需要把要超聲的樣本放到冰水混合物里。
? 此外如果沒有裂解buffer,可以用1×SDSloading buffer代替來抽提蛋白,其效果類似于SDS裂解液,不過抽提后的樣本不能進行濃度測定。
? 蛋白煮沸變性一般是95-100°C,5-10min,水浴鍋煮沸時,可用帶夾EP管防止EP管蓋彈開,使水浴鍋內(nèi)的水進入而使樣品廢掉。
02蛋白電泳
正確選擇凝膠濃度與電泳條件能夠讓目的蛋白區(qū)域最大限度的分離開,從而使條帶的位置,雜帶位置等一些因素的影響降到最低;目的蛋白分子量與膠濃度的選擇見下表:
蛋白質(zhì)分子量范圍(KD)
凝膠濃度(%)
<10
15
10-30
12
30-100
10
100-500
8
>500
6
采用SDS-PAGE電泳,每孔上樣等體積總蛋白,上樣時,先加marker,如有空置的加樣孔,須加等體積的1×loading buffer,以防相鄰泳道樣品的擴散。開始電壓為80V,使樣品跑得慢一些,充分濃縮,到達分離膠后調(diào)為120V,電泳至溴酚藍要跑出即可終止電泳。關于電泳液,建議新鮮配制,也可先配10x的,然后現(xiàn)用現(xiàn)稀釋。
Tips:蛋白電泳
1、玻璃板清洗后,為了使表面的水快速晾干,可以在烘箱中放置幾分鐘,拿出來的時候后需平衡至室溫再灌膠,不然很容易產(chǎn)生氣泡;
2、配膠用的試劑一般都是在4度冰箱保存,當我們按比例配好混合液的時候,要等混合液恢復室溫時,再灌膠,不然也很容易產(chǎn)生氣泡;
3、?玻加水液封時,速度要慢,可用1ml槍沿著膠板上沿反復移動,不然很容易將分離膠沖變形;
4、?梳子注意和玻璃板匹配,1.5mm的梳子很難插進1mm的玻璃板中,暴力插入會破壞膠板;如果1mm的梳子插到了1.5mm的玻璃板中,由于中間有空隙,就會有膠凝固在里面;
5、?濃縮膠凝好可以泡到電泳緩沖液里,比較容易拔出。
?
03蛋白轉膜?膜的選擇
1、現(xiàn)在用的最多的是PVDF膜,用之前需注意:
1)先在純甲醇中浸濕膜15s,保證PVDF膜充分活化;
2)將膜放入轉膜緩沖液中平衡至少5min;
2、?NC膜不需要甲醇活化。
膜的孔徑
1、?根據(jù)被轉移的蛋白分子量大小,選擇不同孔徑的印跡膜。因為隨著膜孔徑的不斷減小,膜對低分子量蛋白的結合就越牢固;
2、?通常用0.45μm和0.2μm兩種規(guī)格的印跡膜。大于20KD的蛋白可用0.45μm 的膜,小于20KD的蛋白就要用0.2μm的膜。
小分子蛋白
1、小分子蛋白很容易轉過,所以摸索適合自己蛋白的轉膜條件很重要,這一步很難說一次就成功,所以剛開始的時候可以在接觸膠面的PVDF膜上再放一張PVDF膜,轉膜結束后,立春紅染色,觀察使用的條件是否會轉過頭;
2、?小分子蛋白轉膜液中一定不要加SDS,因為SDS會影響轉膜效果;
3、?小分子蛋白濕轉參考100V恒壓,或者150-200恒流,40-60min,都可以跑出來結果,同時也可以保證內(nèi)參的效果很好;
4、?小分子蛋白轉膜液甲醇濃度為20%;
5、?分子量小于10 kDa的多肽或蛋白,建議使用Tricine-SDS-PAGE電泳和轉膜系統(tǒng)。
大分子蛋白
1、?轉膜時間要適當延長,220V,300mA,濕轉,建議時間在2h30min-3h,因為轉膜時間很長,可以預冷轉膜緩沖液,同時提前準備好足夠的冰袋降溫;
2、?轉膜液中可以加入適量SDS(濃度0.1%),對于大分子量蛋白加入SDS是為了增加了蛋白表面電荷,從而增加轉膜效率;
3、?大分子蛋白轉膜液甲醇濃度為5%。
04印跡膜封閉
1、?脫脂奶是最常用的經(jīng)濟配方。
2、?脫脂奶粉不能與生物素化的抗體一起使用,因為脫脂奶粉含有糖蛋白和生物素;建議使用BSA。
3、?分析磷酸化蛋白須用BSA。脫脂奶粉含磷酸酶,用磷酸化特異性抗體分析磷酸化蛋白受到影響,因為磷酸酶與膜上的磷酸化蛋白接觸可使之去磷酸化;也不適用于堿性磷酸酶(AP)檢測系統(tǒng)。
4、?如果用辣根過氧化物酶(HRP)檢測系統(tǒng),封閉液不應加疊氮鈉(NaN3),因為疊氮鈉對辣根過氧化物酶(HRP)有滅活作用。
5、?如果用二抗抗體是堿性磷酸酶(AP)標記的檢測系統(tǒng),可使用酪蛋白封閉,同時須選擇TBS緩沖溶液,不可使用PBS緩沖溶液,因為PBS緩沖溶液干擾堿性磷酸酶。
05一抗二抗孵育
1、?建議孵育抗體之前一定要仔細看抗體說明書,了解抗體的種屬來源和抗體的建議稀釋比例。
2、?選擇二抗抗體取決于一抗抗體的動物來源。例如,如果一抗抗體是小鼠來源單克隆抗體,二抗抗體必須是抗小鼠的抗體;如果一抗抗體是兔來源多克隆抗體、二抗抗體必須是抗兔的抗體。
3、?建議使用商品化的抗體稀釋液稀釋一抗二抗,不僅能有效減少一抗或二抗的非特異性結合,并有效提升稀釋后抗體的穩(wěn)定保存時間,可重復利用。
06顯影成像
1、建議使用高信號強度、高靈敏度、高穩(wěn)定性的ECL化學發(fā)光試劑。
2、?顯影液務必覆蓋整個印跡膜。
3、?顯影液A液和B液吸取過程中必須更換移液器槍頭,避免相互污染失效。
4、?ECL工作液需避免強氧化劑如次氯酸鈉等對工作液的影響。
5、?須確保試劑瓶干凈,無微生物或其它試劑污染。為了小伙伴們的安全,請穿實驗服并佩戴一次性手套。
WB常見問題
01 高背景
原因:
①抗體濃度太高
解決辦法: 優(yōu)化/降低一抗和二抗的濃度
②抗體孵育溫度過高
解決辦法: 4℃孵育
③二抗翡特異性結合或與封閉劑交叉反應
解決辦法:設置二抗對照(不加一抗),降低二抗?jié)舛?/p>
④一抗或二抗與封閉劑有交叉反應
解決辦法:在孵育和洗滌液中加Tween-20減少交叉反應
⑤封閉不充分
解決辦法:延長封閉時間,更換適合的封閉劑(脫脂奶粉、BSA、酪蛋白)
⑥抗體與其它蛋白質(zhì)交叉反應
解決辦法:更換不同的封閉液;勿在含生物素體系中使用脫脂奶粉封閉;降低二抗?jié)舛龋粰z
測二抗與膜的交叉反應性。
⑦洗膜不充分
解決辦法:增加洗滌次數(shù)
⑧膜干燥
解決辦法:保證充分的反應液,避免出現(xiàn)干膜現(xiàn)象。
02 信號弱或無信號
原因:
①抗體
解決辦法:增加抗體濃度;抗體與抗原結合差;抗體是喪失活性
②抗原不足
解決辦法:增加上樣品
③抗原被封閉液遮蔽
解決辦法:試用不同的封閉液;優(yōu)化封閉液中蛋白質(zhì)濃度;縮短封閉時間
④蛋白質(zhì)樣品在儲存過程中降解
解決辦法:重新制備樣品
⑤轉膜不充分,或洗膜過度
解決辦法:使用麗春紅檢測轉膜效果,PVDF膜需浸透,需正確的轉膜操作,勿過度洗膜
⑥過度封閉
解決辦法:勿過度洗膜
⑦;過度封閉
解決辦法:使用含0.5%脫脂奶或無脫脂奶的抗體稀釋液,或更換封閉劑,減少封閉時間
⑧一抗失效
解決辦法:使用有效期內(nèi)的抗體,分裝保存,避免反復凍融取用,工作液現(xiàn)配現(xiàn)用
⑨酶和底物失效
解決辦法:直接將酶和底物進行混合,如果不顯色則說明酶失活了。選擇在有效期內(nèi)、有活性的酶聯(lián)物,使用新鮮的底物
03 非特異性帶條
原因:
①一抗?jié)舛冗^高
解決辦法:在滿足一定的敏感性的情況下,降低一抗?jié)舛?/p>
②二抗引起的非特異條帶
解決辦法:免疫球蛋白是一個超家族,而標本中含有大量的類似球蛋白的抗體,容易和二抗引起反應,尤其是砸變性的情況下,在滿足敏感性要求的前提下,熒光標記一抗,酶標兔抗熒光就可以解決這個問題
③蛋白的降解
解決辦法:同上【2—(4)】
④上樣量過高
解決辦法:適當減少上樣量
⑤洗滌不完全
解決辦法:可適當延長洗滌時間
⑥封閉不好
解決辦法:延長封閉的時間;選擇更適合的封閉液
04 彌散型條帶
原因:
①抗體濃度太高
解決辦法:降低抗體濃度
②蛋白質(zhì)上樣量太多
解決辦法:降低蛋白質(zhì)上樣量
③遷移過快、電泳溫度過高
解決辦法:降低電泳速度,低溫電泳(冷室)