拓端tecdat|R語言多維數(shù)據(jù)層次聚類散點(diǎn)圖矩陣、配對(duì)圖、平行坐標(biāo)圖、樹狀圖可視化城市
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原文出處：拓端數(shù)據(jù)部落公眾號(hào)
本文通過一些指數(shù)對(duì)散點(diǎn)圖矩陣和平行坐標(biāo)顯示中的面板進(jìn)行排序，并根據(jù)其數(shù)值水平對(duì)面板進(jìn)行著色。
顯示相關(guān)矩陣
cor <- cor(ley)leclr <- mat.colr(cor)
mtcolr?根據(jù)相關(guān)性大小為相關(guān)性分配三種顏色。高相關(guān)性為紅色，中間三分之一為藍(lán)色，底部三分之一為天藍(lán)色。
plclrs(lolr,label=ronms(coor)
如果要更改配色方案：
leolo <- colr(cor, brak=FALE)lecor <- tcor(cor, bes,c.cr(4))
如果在繪圖之前重新排列變量，則繪圖更容易解釋。
oge <- rdclust(lnlcor)lgeolor1 <- nlclor[lne.,lo.]plot(lnco1,dlbls=rwe(ngyr1))
顯示帶有彩色面板的配對(duì)圖
?所有高相關(guān)面板一起出現(xiàn)在一個(gè)塊中的一個(gè)版本。
pais(loly, orr= lolo,acor= lgy.or)
如果?order?未提供 ，則按默認(rèn)數(shù)據(jù)集順序繪制變量。
用彩色面板顯示平行坐標(biāo)圖
平行坐標(biāo)圖面板可以著色的版本?。同樣，紅色面板具有高相關(guān)性，藍(lán)色面板具有中等相關(guān)性，天藍(lán)色面板具有低相關(guān)性。
pard(lng, ordr= loyo,color= colr,horol=TRUE)
繪制重新排序的樹狀圖
dist?是一個(gè)內(nèi)置的距離矩陣，給出了城市之間的距離。
hclst(dis, "ave")plt(hc)
重新排序樹狀圖以提高附近分支之間的相似性。將其應(yīng)用于?hc?對(duì)象：
ordeu(hc, dis)
兩個(gè)樹狀圖對(duì)應(yīng)于相同的樹結(jié)構(gòu)，但第二個(gè)樹狀圖顯示巴黎和瑟堡比離慕尼黑更近，羅馬離直布羅陀比離巴塞羅那更近。
我們還可以將兩種排序與顏色的圖像圖進(jìn)行比較。第二個(gè)排序似乎將附近的城市彼此靠近。
ct <- dor(edt, rev(cs(5)))pltcl(cma, rles=lals)
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