Linux與生物信息
常見的操作系統(tǒng)

Linux屬于一種計(jì)算機(jī)操作系統(tǒng),與 windows 系統(tǒng)和蘋果的 macos 類似,此外手機(jī)中的Android系統(tǒng)也是基于 linux系統(tǒng)衍而來的。
Linux 相比于 windows 和 macos 具有很多顯著的優(yōu)勢。?
第一、開源免費(fèi);?
第二,穩(wěn)定并且效率更高;?
第三,支持多任務(wù)多用戶;?
第四,安全性高;
但是,由于Linux相比于windows系統(tǒng)和macos系統(tǒng)人性化差,學(xué)習(xí)門檻高,軟件生態(tài)較差。目前在個(gè)人計(jì)算操作機(jī)系統(tǒng)市場中只占 3%左右。
Linux發(fā)行版本//

不同發(fā)行版本就像Window系統(tǒng)中的win7、win8、win10、win11一樣。
常見的Linux兩大陣營 Redhat 和 Debian 使用不同的軟件安裝工具,yum 和 apt。選擇不同Linux版本會(huì)對生物軟件安裝過程中環(huán)境問題有影響,環(huán)境問題也是學(xué)習(xí)生信中比較煩惱的。
那么選擇什么版本的Linux系統(tǒng)呢?

Ubuntu 和 CentOS 是 Linux 當(dāng)中非常著名的兩個(gè)發(fā)行版本。很多生物信息軟件都會(huì)分別提供這兩個(gè)系統(tǒng)版本。但由于大多數(shù)個(gè)人開發(fā)者使用ubuntu系統(tǒng)開發(fā)生物信息軟件,因此,選擇ubuntu系統(tǒng)更友好一些。
不過后續(xù)多數(shù)軟件使用bioconda來安裝,二者之間的差別幾乎可以忽略不計(jì)。


原因如下:
1. 使用的生物軟件只有 Linux 命令行版本;
2. Linux 系統(tǒng)是開源免費(fèi)的;
3. 高性能計(jì)算都采Linux系統(tǒng);
4. Linux 系統(tǒng)本身具有很多優(yōu)點(diǎn),例如多用戶多任務(wù);
5. 命令行進(jìn)行自動(dòng)化和批量化操作。
取Linux學(xué)習(xí)環(huán)境

1.在自己電腦上安裝Linux系統(tǒng),形成雙系統(tǒng)。
2.在自己電腦上安裝VBox虛擬機(jī),虛擬一個(gè)Linux系統(tǒng)。
3.購買服務(wù)器
4.租用云服務(wù)器
5.購買國家超算服務(wù)器
明天分享如何獲取Linux學(xué)習(xí)環(huán)境,帶你踏入生信分析大門!