1、單鏈DNA

　　單鏈DNA(single-stranded DNA)大部分DNA以雙螺旋結(jié)構(gòu)存在，但一經(jīng)熱或堿處理就會(huì)變?yōu)閱捂湢顟B(tài)。單鏈DNA就是指以這種狀態(tài)存在的DNA。單鏈DNA在分子流體力學(xué)性質(zhì)、吸收光譜、堿基反應(yīng)性質(zhì)等方面都和雙鏈DNA不同。某些噬菌體粒子內(nèi)含有單鏈環(huán)狀的DNA，這樣的噬菌體DNA在細(xì)胞內(nèi)增殖時(shí)則形成雙鏈DNA。

　　2、閉環(huán)DNA

　　閉環(huán)DNA(closed circular DNA)沒有斷口的雙鏈環(huán)狀DNA，亦稱為超螺旋DNA。由于具有螺旋結(jié)構(gòu)的雙鏈各自閉合，結(jié)果使整個(gè)DNA分子進(jìn)一步旋曲而形成三級(jí)結(jié)構(gòu)。另外如果一條或二條鏈的不同部位上產(chǎn)生一個(gè)斷口，就會(huì)成為無旋曲的開環(huán)DNA分子。從細(xì)胞中提取出來的質(zhì)粒或病毒DNA都含有閉環(huán)和開環(huán)這二種分子?？筛鶕?jù)兩者與色素結(jié)合能力的不同，而將兩者分離開來。

　　3、連接DNA

　　連接DNA(Linker DNA)：核小體中除146bp核心DNA 外的所有DNA。

　　4、互補(bǔ)DNA

　　互補(bǔ)DNA構(gòu)成基因的雙鏈DNA分子用一條單鏈作為模板，轉(zhuǎn)錄產(chǎn)生與其序列互補(bǔ)的信使RNA分子，然后在反轉(zhuǎn)錄酶的作用下，以mRNA分子為模板，合成一條與mRNA序列互補(bǔ)的單鏈DNA，最后再以單鏈DNA為模板合成另一條與其互補(bǔ)的單鏈DNA，兩條互補(bǔ)的單鏈DNA分子組成一個(gè)雙鏈cDNA分子。因此，雙鏈cDNA分子的序列同轉(zhuǎn)錄產(chǎn)生的mRNA分子的基因是相同的中公醫(yī)考|網(wǎng)編輯整理。所以一個(gè)cDNA分子就代表一個(gè)基因。但是cDNA仍不同于基因，因?yàn)榛蛟谵D(zhuǎn)錄產(chǎn)生mRNA時(shí)，一些不編碼的序列即內(nèi)含子被刪除了，保留的只是編碼序列，即外顯子。所以cDNA序列都比基因序列要短得多，因?yàn)閏DNA中不包括基因的非編碼序列---內(nèi)含子。

　　5、模板DNA

　　模板DNA可以是單鏈分子，也可以是雙鏈分子，可以是線狀分子，也可以是環(huán)狀分子(線狀分子比環(huán)狀分子的擴(kuò)增效果稍好)。就模板DNA而言，影響PCR的主要因素是模板的數(shù)量和純度。