細(xì)胞系建好了,表型實(shí)驗(yàn)想好怎么做了嗎? 源井生物來告訴你!

我相信,同為科研淪落人的你,一定知道只要做了基因編輯細(xì)胞株的構(gòu)建,無論是細(xì)胞敲除、敲入,還是點(diǎn)突變、穩(wěn)轉(zhuǎn)株,都難以逃脫要檢測細(xì)胞表型的命運(yùn)。畢竟你構(gòu)建的細(xì)胞系連想要的表型都沒有,是很難有底氣投高分文章的。 只是,這么多種細(xì)胞表型,哪些表型服務(wù)檢測搭配在一起會(huì)更好?做細(xì)胞凋亡檢測是不是也要檢測細(xì)胞周期?每種細(xì)胞表型都有幾種檢測方法,要選哪個(gè)?
先別急,大部分細(xì)胞(尤其是腫瘤細(xì)胞)表型研究都離不開細(xì)胞增殖、細(xì)胞毒性、細(xì)胞周期、細(xì)胞遷移/侵襲和細(xì)胞凋亡這幾種表型分析,把這幾種表型分析的原理和用途弄明白也許就知道答案了!
1、細(xì)胞增殖
細(xì)胞增殖(cell proliferation)是生物體生長、發(fā)育、繁殖以及遺傳的基礎(chǔ)。 通過對比不同細(xì)胞組別的生長曲線,比如野生型VS突變體、對照VS過表達(dá)、對照VS敲降等等來判斷所構(gòu)建的細(xì)胞系的增殖狀態(tài)是否有顯著差異,進(jìn)而可以選擇進(jìn)行細(xì)胞周期或細(xì)胞凋亡的檢測,如圖1呈現(xiàn)的是過表達(dá)p62對U87和U251細(xì)胞系增殖的影響。
檢測細(xì)胞增殖的方法有很多,其中常用的是CCK-8檢測法和活細(xì)胞計(jì)數(shù)法。計(jì)數(shù)法不必多說,科研人必備技能,而CCK-8檢測法是利用正常細(xì)胞的線粒體內(nèi)含有的琥珀酸脫氫酶可將四唑鹽類物質(zhì)還原為紫色結(jié)晶狀物質(zhì)的原理,當(dāng)這些紫色物質(zhì)沉積在細(xì)胞周圍,可以通過酶標(biāo)儀讀取450nm OD值(optical density),從而檢測細(xì)胞增殖狀態(tài)。其他方法如BrdU染色法和Ki-67檢測法,可以反映出增殖細(xì)胞的空間分布,但只能捕獲單一時(shí)間點(diǎn)的增殖細(xì)胞比例,因此一般用于檢測組織切片的細(xì)胞增殖。

2、細(xì)胞周期
通常,在發(fā)現(xiàn)細(xì)胞增殖有差異后,可以通過檢測細(xì)胞周期來找出產(chǎn)生差異的原因,比如S、G2和/或M期的細(xì)胞減少,而大多數(shù)細(xì)胞停滯在G1期,那就說明可能是G1/S檢驗(yàn)點(diǎn)出現(xiàn)了異常,這對研究深入了解生物的生長發(fā)育和控制腫瘤生長等有重要意義。細(xì)胞周期的檢測方法是簡便直觀的碘化丙啶(Propidium Iodide,PI)染色-流式分析法。
碘化丙啶(Propidium Iodide,PI)與雙鏈DNA結(jié)合后可以產(chǎn)生熒光,并且熒光強(qiáng)度和雙鏈DNA的含量成正比,因此可以用流式細(xì)胞儀對細(xì)胞進(jìn)行DNA含量測定,由于細(xì)胞周期各時(shí)相的DNA含量不同,根據(jù)DNA含量的分布情況,可以將細(xì)胞周期各時(shí)相區(qū)分為G1/G0期、S期和G2/M期,獲得的流式直方圖對應(yīng)的各細(xì)胞周期可通過特殊軟件計(jì)算各時(shí)相的細(xì)胞百分率(圖2),進(jìn)而分析細(xì)胞周期是否正常。

3、細(xì)胞凋亡
細(xì)胞凋亡是多基因嚴(yán)格控制的過程,這些基因在種屬之間非常保守,如Bcl-2家族、Caspase家族、抑癌基因P53等。凋亡過程的紊亂可能與許多疾病的發(fā)生有直接或間接的關(guān)系,如腫瘤和自身免疫性疾病等,因此如果你是研究腫瘤或退行性疾病,細(xì)胞凋亡的檢測往往是必要的,因?yàn)檫@一指標(biāo)將會(huì)成為后續(xù)機(jī)制研究的風(fēng)向標(biāo)。
由于細(xì)胞凋亡的過程有典型的形態(tài)和分子層面的變化,檢測方法也是多樣的,常用的有Annexin V/PI雙染法、TUNEL檢測法和Caspase-3活性檢測法。其中,Annexin V/PI雙染法因其可區(qū)分凋亡早期和晚期和方便量化而被廣泛使用。磷脂酰絲氨酸(Phosphatidyl serine,PS)在細(xì)胞凋亡的早期,會(huì)從細(xì)胞膜內(nèi)側(cè)翻轉(zhuǎn)到細(xì)胞膜的表面,暴露在細(xì)胞外環(huán)境中。Annexin-V能與PS高親和力特異性結(jié)合,把綠色熒光分子FITC連接到Annexin-V即可標(biāo)志內(nèi)膜翻轉(zhuǎn)的凋亡小體。而當(dāng)細(xì)胞發(fā)生凋亡時(shí),細(xì)胞膜通透性增強(qiáng),PI可進(jìn)入細(xì)胞結(jié)合DNA并發(fā)出熒光。因此通過流式分析Annexin-V-FITC和PI的信號分布便可區(qū)分凋亡早期(Annexin-V-FITC陽性+PI陰性)和晚期(Annexin-V-FITC陽性+PI陽性)的細(xì)胞(圖3)。

4、細(xì)胞毒性
在研究疾病的細(xì)胞模型中,你或許希望在過表達(dá)、敲降或敲除潛在藥物靶點(diǎn)的基礎(chǔ)上,高通量篩選藥物分子庫,從而鑒定出潛在的治療藥物,又或者是需要進(jìn)行特定物質(zhì)細(xì)胞毒性的檢測,比如藥物篩選,那你可以通過細(xì)胞毒性檢測來篩選敏感化合物,或者篩選不同細(xì)胞系對某一化合物多個(gè)濃度的敏感性。實(shí)現(xiàn)細(xì)胞毒性檢測的方法有很多種,其中基于細(xì)胞代謝活性的CCK-8和ATP檢測法指示的是細(xì)胞活力(圖4),而基于代謝酶泄漏的LDH檢測法指示的則是細(xì)胞損傷程度(圖5),具體可以根據(jù)自身的研究需求來選擇。


5、細(xì)胞遷移、侵襲
在腫瘤治療中,普遍認(rèn)為抑制腫瘤細(xì)胞遷移和侵襲是有效的治療手段。因此在對腫瘤細(xì)胞進(jìn)行干預(yù)(過表達(dá)、敲降、敲除、點(diǎn)突變、藥物處理)后對細(xì)胞的遷移與侵襲能力進(jìn)行檢測,可以作為評估干預(yù)效果的一個(gè)有效指標(biāo)。
檢測細(xì)胞遷移能力和侵襲能力常用的實(shí)驗(yàn)手段是Transwell實(shí)驗(yàn)(圖6)。Transwell顧名思義是“穿孔實(shí)驗(yàn)”,即將小室放在加入完全培養(yǎng)基的24孔板內(nèi),小室中含有密密麻麻的小孔,將細(xì)胞懸液加到小室中,細(xì)胞可通過形變穿過小室中的孔而跑到營養(yǎng)更豐富的小室外部并貼在外側(cè),最后通過對小室外部的細(xì)胞進(jìn)行染色計(jì)數(shù),就可以判斷細(xì)胞的遷移與侵襲能力的強(qiáng)弱。不過檢測遷移和侵襲的實(shí)驗(yàn)方法還是存在差異,侵襲檢測需在聚碳酸酯膜上側(cè)鋪一層基質(zhì)膠,用以模仿細(xì)胞外基質(zhì)。

說到這里,也許你會(huì)發(fā)現(xiàn)有時(shí)候并不是只檢測某一項(xiàng)表型就能夠得出實(shí)驗(yàn)結(jié)論了,而是好幾項(xiàng)一起檢測,還要結(jié)合檢測數(shù)據(jù)進(jìn)行綜合分析,才能得出最終結(jié)論。什么?你問我要做3、4種怎么辦?從細(xì)胞增殖到細(xì)胞周期再到細(xì)胞遷移/侵襲?實(shí)驗(yàn)分組還特別多?
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