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DNA 編碼化合物庫合成與篩選技術(shù)

2023-10-26 18:04 作者:MedChemExpress  | 我要投稿

DNA 編碼化合物庫(DNA Encoded compound Library,DEL)技術(shù)作為新穎、強(qiáng)大的苗頭化合物發(fā)現(xiàn)引擎,可快速從幾千萬至數(shù)十億分子中,遴選出結(jié)構(gòu)新穎、具有潛在成藥性的化合物,大大縮短藥物研究周期,降低研發(fā)成本。在 DEL 庫中,每一個(gè)分子砌塊(Building Block)都由一段已知唯一的 DNA 序列進(jìn)行標(biāo)記,通過 DNA 兼容反應(yīng)和組合化學(xué)模式,歷經(jīng)數(shù)個(gè)循環(huán)即可獲得上億 DEL 分子。數(shù)十億化合物可以混合在一管中篩選,最終通過高通量測序技術(shù),解碼 DEL 分子的專屬 DNA 標(biāo)簽,快速獲得針對(duì)靶點(diǎn)的苗頭化合物信息。

圖1. DEL 庫的構(gòu)建和篩選

DNA 編碼化合物庫構(gòu)建、合成

httpS://www.activeinhibitor.com/hhwk/1414.html

分子砌塊是 DEL 庫設(shè)計(jì)、合成的基礎(chǔ)?;?50000 余種高質(zhì)量、結(jié)構(gòu)多樣的分子砌塊, MCE 優(yōu)中擇優(yōu),剔除 DNA 嵌入劑、含 N-鹵代、重金屬等的“不良”化學(xué)結(jié)構(gòu),保留骨架獨(dú)特、結(jié)構(gòu)新穎、官能團(tuán)多樣、化學(xué)空間覆蓋范圍廣的化合物。結(jié)合 MCE 自主開發(fā)的數(shù)百種 DNA 兼容性化學(xué)反應(yīng),最終構(gòu)建出化學(xué)空間多樣、結(jié)構(gòu)新穎、包含數(shù)十億化合物的 DEL 庫。

圖2. DEL 庫的構(gòu)建

DEL 庫規(guī)格

3 個(gè)量級(jí):

DEL A Kit:20 個(gè) DEL 庫,3 億個(gè) DEL 分子,1 管集合

DEL B Kit:50 個(gè) DEL 庫,10 億個(gè) DEL 分子,1 管集合

DEL T Kit:68 個(gè) DEL 庫,20 億個(gè) DEL 分子,1 管集合

Mini DEL 庫:

DEL C Kit 共價(jià)庫:5 個(gè) DEL 庫,0.03 億個(gè) DEL 分子,1 管集合

DEL D Kit 環(huán)肽庫:5 個(gè) DEL 庫,0.08 億個(gè) DEL 分子,1 管集合

DEL E Kit 常規(guī)庫:5 個(gè) DEL 庫,1.9 億個(gè) DEL 分子,1 管集合

DEL F Kit 常規(guī)庫:5 個(gè) DEL 庫,1.09 億個(gè) DEL 分子,1 管集合

DEL G Kit 常規(guī)庫:5 個(gè) DEL 庫,1.13 億個(gè) DEL 分子,1 管集合

DEL H Kit 常規(guī)庫:10 個(gè) DEL 庫,5.5 億個(gè) DEL 分子,1 管集合

2 種規(guī)格:

5 nmol、20 nmol

DEL 庫優(yōu)點(diǎn)

?68 個(gè) DEL 庫,數(shù)十億 DEL 分子

化學(xué)結(jié)構(gòu)新穎,化學(xué)空間覆蓋范圍廣,具備類藥分子特性

強(qiáng)大的合成能力

嚴(yán)格的質(zhì)量控制、驗(yàn)證體系

完善的產(chǎn)品、數(shù)據(jù)管理系統(tǒng)

緊跟研究趨勢,不斷更新

DNA 編碼化合物庫定制服務(wù)

MCE 不僅可以提供一站式的 DEL 篩選服務(wù),更有熱門的光交聯(lián) DEL 庫、共價(jià) DEL庫、環(huán)肽 DEL 庫等 DEL 庫供選擇,同時(shí)可提供 DEL 庫定制服務(wù),根據(jù)具體化合物結(jié)構(gòu)類型,快速的衍生合成出數(shù)以百計(jì)的 DEL 分子。MCE 擁有強(qiáng)大而專業(yè)的 DEL 合成團(tuán)隊(duì),緊跟科學(xué)前沿開發(fā)了數(shù)百種 DNA 兼容的化合物反應(yīng)。

DNA 編碼化合物庫篩選

相較于傳統(tǒng)的高通量篩選,DEL 篩選可以一次性篩選數(shù)以億計(jì)的化合物;大大節(jié)約靶蛋白的使用量;篩選周期大大縮短;篩選成本更加低廉。DEL 庫的篩選策略基本流程是將 DEL 庫與靶標(biāo)進(jìn)行孵育后,基于小分子-蛋白質(zhì)的親和結(jié)合作用力,經(jīng)過不同的洗脫方式,除去非結(jié)合小分子,實(shí)現(xiàn)具有高親和力的小分子配體的高倍富集,結(jié)合 PCR 擴(kuò)增與下一代測序的技術(shù),可根據(jù)小分子的 DNA 標(biāo)簽實(shí)現(xiàn)化合物信息的解碼。

圖3. DNA 編碼化合物的篩選策略:固相篩選

DEL 庫篩選流程

a.蛋白固載與孵育:將待篩選的靶蛋白預(yù)先固載,隨后將固載的蛋白質(zhì)與 DEL 庫孵育。

b.洗雜:洗去不與蛋白結(jié)合或結(jié)合力弱的 DEL 分子。

c.洗脫:將與蛋白結(jié)合的 DEL 分子洗脫,實(shí)現(xiàn)高親和力小分子的富集。

d.PCR 擴(kuò)增與蛋白結(jié)合 DEL 分子的 DNA 標(biāo)簽。

e.高通量測序與數(shù)據(jù)分析:對(duì)擴(kuò)增后的 DNA 標(biāo)簽進(jìn)行下一代測序,根據(jù) DEL 小分子的 DNA 標(biāo)簽實(shí)現(xiàn)化合物信息的解碼。

DEL 庫篩選優(yōu)點(diǎn)

一站式服務(wù):DEL 庫合成與 DEL 庫篩選

少量蛋白樣本:約 100 μg 蛋白(具體根據(jù)蛋白分子量決定)

4-5 周交付結(jié)果

嚴(yán)格的數(shù)據(jù)隱私管理

專業(yè)的技術(shù)團(tuán)隊(duì)

DNA 編碼化合物庫合成與篩選技術(shù)的評(píng)論 (共 條)

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