DNA 編碼化合物庫合成與篩選技術(shù)
DNA 編碼化合物庫(DNA Encoded compound Library,DEL)技術(shù)作為新穎、強(qiáng)大的苗頭化合物發(fā)現(xiàn)引擎,可快速從幾千萬至數(shù)十億分子中,遴選出結(jié)構(gòu)新穎、具有潛在成藥性的化合物,大大縮短藥物研究周期,降低研發(fā)成本。在 DEL 庫中,每一個(gè)分子砌塊(Building Block)都由一段已知唯一的 DNA 序列進(jìn)行標(biāo)記,通過 DNA 兼容反應(yīng)和組合化學(xué)模式,歷經(jīng)數(shù)個(gè)循環(huán)即可獲得上億 DEL 分子。數(shù)十億化合物可以混合在一管中篩選,最終通過高通量測序技術(shù),解碼 DEL 分子的專屬 DNA 標(biāo)簽,快速獲得針對(duì)靶點(diǎn)的苗頭化合物信息。
圖1. DEL 庫的構(gòu)建和篩選
DNA 編碼化合物庫構(gòu)建、合成
:
httpS://www.activeinhibitor.com/hhwk/1414.html
分子砌塊是 DEL 庫設(shè)計(jì)、合成的基礎(chǔ)?;?50000 余種高質(zhì)量、結(jié)構(gòu)多樣的分子砌塊, MCE 優(yōu)中擇優(yōu),剔除 DNA 嵌入劑、含 N-鹵代、重金屬等的“不良”化學(xué)結(jié)構(gòu),保留骨架獨(dú)特、結(jié)構(gòu)新穎、官能團(tuán)多樣、化學(xué)空間覆蓋范圍廣的化合物。結(jié)合 MCE 自主開發(fā)的數(shù)百種 DNA 兼容性化學(xué)反應(yīng),最終構(gòu)建出化學(xué)空間多樣、結(jié)構(gòu)新穎、包含數(shù)十億化合物的 DEL 庫。
圖2. DEL 庫的構(gòu)建
DEL 庫規(guī)格
3 個(gè)量級(jí):
DEL A Kit:20 個(gè) DEL 庫,3 億個(gè) DEL 分子,1 管集合
DEL B Kit:50 個(gè) DEL 庫,10 億個(gè) DEL 分子,1 管集合
DEL T Kit:68 個(gè) DEL 庫,20 億個(gè) DEL 分子,1 管集合
Mini DEL 庫:
DEL C Kit 共價(jià)庫:5 個(gè) DEL 庫,0.03 億個(gè) DEL 分子,1 管集合
DEL D Kit 環(huán)肽庫:5 個(gè) DEL 庫,0.08 億個(gè) DEL 分子,1 管集合
DEL E Kit 常規(guī)庫:5 個(gè) DEL 庫,1.9 億個(gè) DEL 分子,1 管集合
DEL F Kit 常規(guī)庫:5 個(gè) DEL 庫,1.09 億個(gè) DEL 分子,1 管集合
DEL G Kit 常規(guī)庫:5 個(gè) DEL 庫,1.13 億個(gè) DEL 分子,1 管集合
DEL H Kit 常規(guī)庫:10 個(gè) DEL 庫,5.5 億個(gè) DEL 分子,1 管集合
2 種規(guī)格:
5 nmol、20 nmol
DEL 庫優(yōu)點(diǎn)
?68 個(gè) DEL 庫,數(shù)十億 DEL 分子
化學(xué)結(jié)構(gòu)新穎,化學(xué)空間覆蓋范圍廣,具備類藥分子特性
強(qiáng)大的合成能力
嚴(yán)格的質(zhì)量控制、驗(yàn)證體系
完善的產(chǎn)品、數(shù)據(jù)管理系統(tǒng)
緊跟研究趨勢,不斷更新
DNA 編碼化合物庫定制服務(wù)
MCE 不僅可以提供一站式的 DEL 篩選服務(wù),更有熱門的光交聯(lián) DEL 庫、共價(jià) DEL庫、環(huán)肽 DEL 庫等 DEL 庫供選擇,同時(shí)可提供 DEL 庫定制服務(wù),根據(jù)具體化合物結(jié)構(gòu)類型,快速的衍生合成出數(shù)以百計(jì)的 DEL 分子。MCE 擁有強(qiáng)大而專業(yè)的 DEL 合成團(tuán)隊(duì),緊跟科學(xué)前沿開發(fā)了數(shù)百種 DNA 兼容的化合物反應(yīng)。
DNA 編碼化合物庫篩選
相較于傳統(tǒng)的高通量篩選,DEL 篩選可以一次性篩選數(shù)以億計(jì)的化合物;大大節(jié)約靶蛋白的使用量;篩選周期大大縮短;篩選成本更加低廉。DEL 庫的篩選策略基本流程是將 DEL 庫與靶標(biāo)進(jìn)行孵育后,基于小分子-蛋白質(zhì)的親和結(jié)合作用力,經(jīng)過不同的洗脫方式,除去非結(jié)合小分子,實(shí)現(xiàn)具有高親和力的小分子配體的高倍富集,結(jié)合 PCR 擴(kuò)增與下一代測序的技術(shù),可根據(jù)小分子的 DNA 標(biāo)簽實(shí)現(xiàn)化合物信息的解碼。
圖3. DNA 編碼化合物的篩選策略:固相篩選
DEL 庫篩選流程
a.蛋白固載與孵育:將待篩選的靶蛋白預(yù)先固載,隨后將固載的蛋白質(zhì)與 DEL 庫孵育。
b.洗雜:洗去不與蛋白結(jié)合或結(jié)合力弱的 DEL 分子。
c.洗脫:將與蛋白結(jié)合的 DEL 分子洗脫,實(shí)現(xiàn)高親和力小分子的富集。
d.PCR 擴(kuò)增與蛋白結(jié)合 DEL 分子的 DNA 標(biāo)簽。
e.高通量測序與數(shù)據(jù)分析:對(duì)擴(kuò)增后的 DNA 標(biāo)簽進(jìn)行下一代測序,根據(jù) DEL 小分子的 DNA 標(biāo)簽實(shí)現(xiàn)化合物信息的解碼。
DEL 庫篩選優(yōu)點(diǎn)
一站式服務(wù):DEL 庫合成與 DEL 庫篩選
少量蛋白樣本:約 100 μg 蛋白(具體根據(jù)蛋白分子量決定)
4-5 周交付結(jié)果
嚴(yán)格的數(shù)據(jù)隱私管理
專業(yè)的技術(shù)團(tuán)隊(duì)