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DNA純化?蛋白濃縮?安捷倫StrataClean樹脂會出手!

2023-03-09 14:06 作者:分子科普小feng子  | 我要投稿

StrataClean?樹脂是一種專利無毒、不可燃的羥基化二氧化硅顆粒漿液,可用于純化 DNA,或?qū)⑾♂尩牡鞍踪|(zhì)混合物濃縮。?使用StrataClean??樹脂純化DNA無需進(jìn)行苯酚:氯仿提?。ㄟ@兩種物質(zhì)劇毒且可燃),?提取的 DNA 可直接用于測序,或沉淀用于連接和限制性酶解等操作。使用StrataClean?樹脂純化濃縮蛋白,不需要像傳統(tǒng)的方法那樣沉淀、透析和超濾等操作;只需要將樹脂加入樣品混和并簡單離心即可。與StrataClean?樹脂結(jié)合的即為已經(jīng)濃縮的蛋白,可以用于下游的SDS-PAGE和二維凝膠電泳。

產(chǎn)品優(yōu)勢:

方法無毒、安全且簡單易用

StrataClean 樹脂是用于 DNA 純化的無酚技術(shù)。固相硅膠型樹脂具有羥基,以與酚羥基相同的方式與蛋白質(zhì)反應(yīng)。采用樹脂處理可將 DNA 與所有限制性內(nèi)切酶和某些修飾酶分離。樹脂是無毒、不可燃,實(shí)驗更加安全

實(shí)驗耗時短

由于 StrataClean 樹脂具有與苯酚相似的特性,因此在中性 pH 下對蛋白質(zhì)具有高親和力,而對核酸則具有較低親和力。該樹脂的硅膠顆粒為不溶性,蛋白質(zhì)通過與 StrataClean 樹脂結(jié)合可在 5 分鐘內(nèi)完全提取。無蛋白質(zhì)的 DNA 可有效用于下游應(yīng)用,例如克隆、PCR、序列分析和 Southern 印跡分析。

使用方法

DNA純化(以鼠尾DNA提取為例)

StrataClean?樹脂可以代替苯酚:氯仿從鼠尾中純化小鼠基因組DNA。所得到的DNA適合用于雜交。

實(shí)驗步驟:

1、準(zhǔn)備鼠尾(6mm左右長度)在750μl 1X STE,11% SDS and 25 μl?of 10 mg/ml?蛋白酶K ,5555°C?消化三小時,或37°C 過夜消化。

2、消化后,加入30μl StrataClean?樹脂,顛倒混勻,然后在離心機(jī)中14,000 rpm?離心10分鐘。

3、提取上清液,并轉(zhuǎn)移到一個新的試管中。加入750 μl冰異丙醇,倒混合。可以看到一個DNA“毛球”形成。

4、將DNA放在14000rpm的離心機(jī)中離心4分鐘,吸出上清液,讓DNA晾干。

5、用250 μl TE緩沖液(10 mM Tris-HCl;1 mM EDTA,pH 7.8)重懸DNA,以備用


蛋白濃縮(以提取限制性內(nèi)切酶和改性酶為例)

StrataClean?樹脂可以用于提取所有限制性內(nèi)切酶和一些改性酶。如果樣品符合以下規(guī)格,則可獲得最佳結(jié)果:

●?最大反應(yīng)體積:250μl

●?最大(最終)酶濃度10%(vol/vol)

●?最大鹽濃度150 mM

●?若體積超過250μl,使用10%的StrataClean?樹脂


StrataClean?樹脂用量,可參考下表

實(shí)驗步驟:

1、使StrataClean?樹脂充分渦旋。

2、使用無酶的槍頭,將StrataClean?樹脂加入反應(yīng)體系,渦旋15秒。

3、在室溫下孵育1分鐘。

4、在2000×g離心1分鐘(可以大于1分鐘)。

5、使用無酶槍頭,小心地將含有DNA清液轉(zhuǎn)移到新的離心管中,請注意不要吸取到底部的StrataClean?樹脂

6、重復(fù)步驟1-5。

7、使用1X LDS 緩沖液?添加DTT?在95℃從StrataClean?樹脂中講蛋白洗脫備用

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高分文獻(xiàn)精選:

1、Silwal P, Kim Y J, Lee Y J, et al. Chemical mimetics of the N-degron pathway alleviate systemic inflammation by activating mitophagy and immunometabolic remodeling[J]. Experimental & Molecular Medicine?1-14?(2023)

2、Stidham S, Villareal V, Chellappa V, et al. Aptamer based point of care diagnostic for the detection of food allergens[J]. Scientific Reports?12(1): 1303?(2022).

3、Zhou, H., Stein, C.B., Shafiq, T.A.?et al.?Rixosomal RNA degradation contributes to silencing of Polycomb target genes.?Nature?604, 167–174 (2022).

4、Peng, M., Curry, S.M., Liu, Y.?et al.?The ex vivo human translaminar autonomous system to study spaceflight associated neuro-ocular syndrome pathogenesis.?npj Microgravity?8, 44 (2022).?

5、Koch H, Dürwald A, Schweder T, et al. Biphasic cellular adaptations and ecological implications of Alteromonas macleodii degrading a mixture of algal polysaccharides[J]. The ISME journal?13(1): 92-103?(2019).

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