酵母非靶向脂質(zhì)組學(xué)介紹
釀酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)是一種廣泛用于研究真核細(xì)胞生理和分子事件的模型生物。酵母被用于開拓轉(zhuǎn)錄組、蛋白質(zhì)組和相互作用組的研究,研究酵母中脂質(zhì)的脂質(zhì)組學(xué)分支被稱為“酵母脂質(zhì)組學(xué)”。與其他真核細(xì)胞相比,釀酒酵母具有相對簡單的脂質(zhì)組,包含約150種迄今已被鑒定的脂類分子。釀酒酵母具有一個保守的脂質(zhì)代謝途徑網(wǎng)絡(luò)。酵母主要含16個或18個碳原子的FAs,這些FAs包括飽和的(約20%)或單不飽和的(約80%)。與哺乳動物細(xì)胞相比,酵母僅含在C9和C10之間具有雙鍵的單不飽和脂肪酸,這顯著降低了酵母脂類中的組合?;湹膹?fù)雜性。
盡管酵母的脂質(zhì)代謝在某些情況下與哺乳動物不同,如酵母中的主要甾醇是麥角甾醇而不是膽固醇(麥角甾醇是由C5(異戊二烯)主鏈通過一系列復(fù)雜的縮合、環(huán)化和氧化還原反應(yīng)合成的),酵母模型系統(tǒng)仍然為操縱控制特定脂質(zhì)合成、轉(zhuǎn)化、定位和降解的蛋白質(zhì)提供了巨大的機(jī)會。酵母細(xì)胞膜顯示出對不同類型的脅迫非常敏感,如D-檸檬烯脅迫、鹽脅迫、缺氧脅迫和營養(yǎng)脅迫。推測膜脂質(zhì)組的變化在應(yīng)激反應(yīng)中起著重要作用。
隨著質(zhì)譜技術(shù)的發(fā)展,酵母脂質(zhì)組可以作為一個整體被更準(zhǔn)確和靈敏的分析。用于鑒定和定量酵母脂質(zhì)組學(xué)的儀器包括MS、GC、HPLC或LC-MS、GC-MS。色譜方法(如GC或HPLC)與MS的結(jié)合可以大大增加脂質(zhì)分析的覆蓋率。作為酵母脂質(zhì)組學(xué)中被廣泛使用的分析技術(shù)之一,LC-MS被用于定性和定量分析酵母中的多種脂質(zhì),包括PC、PE、PI、PS、PA和許多其他脂質(zhì)。
