大家好，歡迎查看《時(shí)空日?qǐng)?bào)》第2期。本期追蹤到時(shí)空/單細(xì)胞組學(xué)相關(guān)研究文章共計(jì)6篇。以下是應(yīng)用華大時(shí)空StereoCopilot生成的文章概要，并輔以人工審核，供了解參考。

1：植入后人類干細(xì)胞譜系的自我更新和分化

Self-patterning of human stem cells into post-implantation lineages

Nature; IF: 69.504; DOI: 10.1038/s41586-023-06354-4

內(nèi)容概要：人類多能干細(xì)胞能夠被誘導(dǎo)自我分化形成三維結(jié)構(gòu)，再現(xiàn)了人類早期（從Carnegie階段4到階段7）胚胎發(fā)育的關(guān)鍵時(shí)空事件，并為理解人類發(fā)育的基本細(xì)胞和分子機(jī)制提供了可重復(fù)、可操作和可擴(kuò)展的實(shí)驗(yàn)平臺(tái)。

2：全造血RNA條形碼可實(shí)現(xiàn)有核和無核譜系的動(dòng)力學(xué)測(cè)量和急性血小板耗竭后骨髓克隆的激活

Panhematopoietic RNA barcoding enables kinetic measurements of nucleate and anucleate lineages and the activation of myeloid clones following acute platelet depletion

Genome Biology; IF: 17.906; DOI: 10.1186/s13059-023-02976-z

內(nèi)容概要：介紹了一種新的RNA條形碼技術(shù)，該技術(shù)使用小鼠造血干細(xì)胞的慢病毒基因標(biāo)記來量化所有譜系、有核細(xì)胞和無核細(xì)胞的輸出，同時(shí)使用scRNA-seq將它們與干細(xì)胞和祖細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組表型聯(lián)系起來，以實(shí)現(xiàn)對(duì)外周血中的多譜系輸出和單個(gè)造血干細(xì)胞轉(zhuǎn)錄異質(zhì)性的動(dòng)力學(xué)研究，為血小板耗竭后造血干細(xì)胞的重新激活，以及穩(wěn)態(tài)和應(yīng)激下的克隆動(dòng)態(tài)提供了獨(dú)特見解。

3.年齡相關(guān)B細(xì)胞預(yù)測(cè)接受免疫檢查點(diǎn)阻斷的患者接種COVID-19疫苗后體液免疫受損

Age-associated B cells predict impaired humoral immunity after COVID-19 vaccination in patients receiving immune checkpoint blockade

Nature Communications; IF: 17.694; DOI: 10.1038/s41467-023-38810-0

內(nèi)容概要：應(yīng)用scRNA-seq研究不同免疫系統(tǒng)疾病患者（包括接受免疫檢查點(diǎn)阻斷治療的癌癥患者和先天性免疫缺陷患者）中的年齡相關(guān)B細(xì)胞（age-associated B cells，ABC）是否相似，以及它們?nèi)绾斡绊慍OVID-19疫苗反應(yīng)水平，確認(rèn)了ABC擴(kuò)增可以作為識(shí)別個(gè)體對(duì)疫苗接種反應(yīng)不理想的風(fēng)險(xiǎn)生物標(biāo)志物。

4.scRNA-seq揭示PegIFN-α在慢性乙型肝炎患者中的免疫調(diào)節(jié)作用

Single-cell RNA sequencing reveals the immunoregulatory roles of PegIFN-α in patients with chronic hepatitis B

Hepatology?(Baltimore, Md.); IF: 17.298; DOI: 10.1097/HEP.0000000000000524

內(nèi)容概要：使用scRNA-seq繪制在PegIFN-α治療前后慢性乙型肝炎（chronic hepatitis B，CHB）患者外周免疫細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄組圖譜，拓展了對(duì)CHB病理特征和PegIFN-α免疫調(diào)節(jié)作用的理解，為CHB的臨床診斷和治療提供了新見解。

5.人類疾病中淋巴組織基質(zhì)細(xì)胞的新型低溫保存和生物庫(kù)策略

A novel cryopreservation and biobanking strategy to study lymphoid tissue stromal cells in human disease

European Journal of Immunology; IF: 6.688; DOI: 10.1002/eji.202250362

內(nèi)容概要：介紹了一種新的低溫保存和生物庫(kù)策略，用于研究人類疾病中的淋巴組織基質(zhì)細(xì)胞。通過對(duì)人類扁桃體和淋巴結(jié)進(jìn)行低溫保存，并結(jié)合流式細(xì)胞術(shù)、scRNA-seq和原位分析，發(fā)現(xiàn)低溫保存對(duì)細(xì)胞類型和轉(zhuǎn)錄譜的影響很小，提示這種廣泛適用的方法有望極大地促進(jìn)淋巴組織基質(zhì)細(xì)胞在人類疾病中作用的研究。

6.單細(xì)胞蛋白質(zhì)組學(xué)檢測(cè)揭示相互作用蛋白質(zhì)功能協(xié)調(diào)的相關(guān)蛋白質(zhì)模塊

Correlated protein modules revealing functional coordination of interacting proteins are detected by single-cell proteomics

The Journal of Physical Chemistry. B; IF: 3.466; DOI: 10.1021/acs.jpcb.3c00014

內(nèi)容概要：應(yīng)用單細(xì)胞蛋白質(zhì)組學(xué)測(cè)量單個(gè)哺乳動(dòng)物細(xì)胞中一對(duì)蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)錄水平之間的相關(guān)性，發(fā)現(xiàn)了多個(gè)相關(guān)蛋白模塊（correlated protein modules，CPMs），每個(gè)模塊都包含一組高度正相關(guān)的蛋白質(zhì)，這些蛋白質(zhì)在某些生物功能中具有功能相互作用并共同參與某些功能，如蛋白質(zhì)合成和氧化磷酸化。與單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)相比，單細(xì)胞蛋白質(zhì)組學(xué)檢測(cè)到的蛋白質(zhì)之間的相關(guān)性更加明顯，且功能更相關(guān)。

《時(shí)空日?qǐng)?bào)》是華大時(shí)空基于時(shí)空云平臺(tái)STOmics Cloud的StereoCopilot功能板塊，推出的聚焦于時(shí)空組學(xué)領(lǐng)域?qū)W術(shù)前沿的欄目。以實(shí)時(shí)、精準(zhǔn)追蹤時(shí)空組學(xué)前沿為目標(biāo)，共享最新時(shí)空知識(shí)，助力生命科學(xué)和臨床醫(yī)學(xué)發(fā)展。