4D蛋白組和代謝組聯(lián)合分析
多組學(xué)聯(lián)合分析是指對(duì)來(lái)自不同組學(xué)如基因組、轉(zhuǎn)錄組、蛋白質(zhì)組、代謝組、微生物組、糖組和脂質(zhì)組等的批量數(shù)據(jù)進(jìn)行整合處理、比較分析以及相關(guān)性分析等統(tǒng)計(jì)學(xué)分析,同時(shí)結(jié)合相關(guān)生物信息學(xué)分析手段如GO富集分析、KEGG分析、代謝通路富集等分析建立不同層次組學(xué)數(shù)據(jù)之間的關(guān)系,挖掘單一組學(xué)不能反映的更多有意義的數(shù)據(jù),系統(tǒng)全面地解析生命活動(dòng)代謝通路和調(diào)控機(jī)制。?
“組”是一個(gè)集體的概念,蛋白質(zhì)組和代謝組就是指一個(gè)生物體、組織、細(xì)胞或混合體系中的全部蛋白質(zhì)或代謝物,蛋白質(zhì)組學(xué)和代謝組學(xué)就是對(duì)某一體系中的全部蛋白質(zhì)和代謝物進(jìn)行研究的科學(xué)。對(duì)蛋白組和代謝組的組學(xué)數(shù)據(jù)進(jìn)行聯(lián)合分析不僅可以對(duì)兩個(gè)組學(xué)的分析結(jié)果進(jìn)行相互驗(yàn)證,還可以在原來(lái)的基礎(chǔ)上進(jìn)行相互補(bǔ)充和延伸,使研究更加系統(tǒng)、全面。最終實(shí)現(xiàn)對(duì)生物分子功能和調(diào)控機(jī)制的全面了解,并篩選出重點(diǎn)代謝通路或者蛋白質(zhì)和代謝物進(jìn)行后續(xù)深入的分析與應(yīng)用。?
4D是質(zhì)譜技術(shù)的一種研究手段,蛋白質(zhì)組、代謝組及其他組學(xué)的研究離不開(kāi)質(zhì)譜技術(shù)。傳統(tǒng)的質(zhì)譜分析一般是基于保留時(shí)間、質(zhì)荷比以及離子強(qiáng)度這三個(gè)維度(3D)進(jìn)行的,4D分析技術(shù)就是在傳統(tǒng)的3D分析上引入肽段碰撞截面積(CCS)——離子淌度這一維度,使質(zhì)譜分析技術(shù)得到了質(zhì)的飛躍,在分析速度、檢測(cè)靈敏度、準(zhǔn)確度以及特異性方面等到了全面提升,4D質(zhì)譜分析技術(shù)也為蛋白組和代謝組聯(lián)合分析提供了更好的分析手段。?
百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺(tái)結(jié)合nanoLC-MS/MS納升色譜,將蛋白質(zhì)組學(xué)定性及定量服務(wù)、多種樣品靶向和非靶向代謝組學(xué)分析服務(wù)結(jié)合可定制化的生物信息學(xué)分析方法,為您提供從實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)、樣品檢測(cè)、到數(shù)據(jù)分析的一站式4D蛋白質(zhì)組學(xué)與代謝組學(xué)整合分析服務(wù),可滿足多種檢測(cè)需求,歡迎免費(fèi)咨詢。?