【ImageJ】處理電鏡粒徑的一系列教程
【ImageJ】如何統(tǒng)計(jì)電鏡粒徑,繪粒徑分布
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The following article is from Paper繪圖?Author 超級super棟
導(dǎo)言在前面,我們推出過一期電鏡圖片粒徑分布圖【點(diǎn)擊閱讀】Origin繪圖:采用高斯方程對碳量子點(diǎn)TEM粒徑分布柱狀圖的擬合

隨著origin版本的升級,很多類型的繪圖功能會集成在高版本中。以前低版本中繪圖需要很多步驟,但在高版本中,只需要一步。另外,不少讀者提問,怎樣從電鏡圖片中測算粒徑分布,請看這篇教程。
作者:超級Super棟
制劑的電鏡圖,是我們在論文或者實(shí)驗(yàn)中經(jīng)常見到的圖。所以,我們今天的教程是如何使用ImageJ對電鏡圖中的納米粒進(jìn)行粒徑的整體測量,以及如何使用Origin對其進(jìn)行作圖。

軟件ImageJ
Origin 2019b
圖文教程此教程分為兩個(gè)部分,首先使用ImageJ進(jìn)行粒徑的測量,然后使用Origin進(jìn)行作圖。ImageJ粒徑測量1. 使用ImageJ打開圖片

2.?使用直線工具,標(biāo)記標(biāo)尺

3.?設(shè)定標(biāo)尺:菜單欄-Analyze-Set scale

4.?只需要寫上右下角的標(biāo)尺的單位,點(diǎn)擊OK,就會發(fā)現(xiàn)圖片上方變化了


5.?然后點(diǎn)擊ROI manger

6.?然后我們在粒子的直徑上畫一個(gè)橫線,點(diǎn)擊add it??梢渣c(diǎn)擊顯示全部和標(biāo)記,這樣標(biāo)記了的就可以顯示出來,避免二次標(biāo)記,這里我選擇20個(gè)用來演示。
7.?點(diǎn)擊測量

8.?所有的長度就顯示出來了

Origin作圖1. 打開origin,復(fù)制進(jìn)來所有所測量的粒徑數(shù)據(jù)

2.?選中數(shù)據(jù),點(diǎn)擊作圖(選擇分布圖)

3.?我們來看一下形成的基礎(chǔ)圖

4.?對其美化一下

5.?最后,我們可以將兩幅圖組合在一起。
用Image J軟件統(tǒng)計(jì)電鏡圖片中納米顆粒的粒徑
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? ?Image J 軟件占據(jù)空間小,免安裝,用來計(jì)算電鏡照片中納米顆粒的粒徑,尤其是圓形納米顆粒,很方便,時(shí)間久了這種數(shù)據(jù)處理步驟很容易忘記,放在這里留作備份。
1.直接點(diǎn)擊圖標(biāo)

打開工具條

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2.打開圖片:File/open/找到目標(biāo)文件打開;

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3.設(shè)置標(biāo)尺:點(diǎn)擊工具條上放大鏡,左擊標(biāo)尺部分放大,選擇直線工具,點(diǎn)住標(biāo)尺一端不放拖動劃線至另一端,Analyse/Set Scale在跳出對話框中填寫信息(如是圓形納米顆粒,可勾選Global);


4.粒子填色:選擇圓形工具,按住ctrl鍵,套住某一納米顆粒畫圓,ctrl+F填黑;


5.調(diào)整襯度:所需要的納米顆粒全部填黑之后,工具條下Image/type調(diào)整為8-bit,Ajust/Threshold,選擇Black&white,set 0 & 0;


6.粒徑統(tǒng)計(jì):Analyze/Analyse Particles/對話框中設(shè)置參數(shù)(選擇outlines,OK 之后就會顯示所有目標(biāo)顆粒的輪廓,有利于查看統(tǒng)計(jì)情形);


6.粒徑分析:Analyze/distribution/設(shè)置粒徑分布范圍如0-10 nm和作圖分割單元如10(統(tǒng)計(jì)每隔1納米之間的納米顆粒個(gè)數(shù)),那么軟件自動對結(jié)果進(jìn)行分析,做出柱狀圖,橫坐標(biāo)為納米,縱坐標(biāo)為個(gè)數(shù),結(jié)果顯示最大粒徑最小粒徑及平均粒徑等信息,copy結(jié)果到origin作圖即可。