PCR探針是用報告分子標記的DNA或RNA序列。報告基因是一種分子，在與靶序列雜交時會發(fā)出熒光。

這些探針用于定量和實時熒光定量PCR方法，例如qPCR或定量PCR，可在PCR過程中進行實時擴增檢測。

市場上有幾種PCR探針，那么如何為您的實驗選擇PCR探針呢？

圖1.PCR探針和引物

根據成本選擇探頭

考慮到有一些PCR探針比其他探針更專業(yè)。例如，使用Taq聚合酶的水解探針比其他探針更廣泛且相對便宜。此外，一些探針具有更多成分或專用成分（例如酶），但這種特殊功能會增加成本。

有些探針更難設計引物。例如，在信標探針中，應仔細設計包含發(fā)夾環(huán)結構的引物，以使報告基因和淬滅劑之間的結合足夠牢固。反復試驗可能會增加成本。

根據時間和設置選擇探頭

一些探針具有比其他探針更復雜的機制（水解探針與QZyme）。這意味著某些探針的機制比其他探針更長，最終會消耗更多時間。此外，在繼續(xù)之前，您必須了解工作機制;否則，您可能會得到假熒光。

根據熟悉程度選擇探頭

假設您和您的實驗室伙伴更熟悉水解探針。您了解協(xié)議，了解機制，并且您有很好的故障排除意識。在這種情況下，堅持你所知道的通常更安全。

而且，如果您有一個問題，如果每個人都熟悉所討論的調查，那么咨詢您的同事會容易得多。也就是說，成本、時間和其他因素仍可能影響您的決定。

根據應用選擇探頭

根據應用，有些探頭更專業(yè)。例如，如果您計劃使用探針進行微陣列的基因表達驗證，建議使用雙雜交和水解探針。

對于病原體檢測和SNP檢測，scorpion探針是理想的選擇。

對于PCR多重檢測，許多其他探針比水解探針更好。

選擇探針后，您需要確保PCR條件得到優(yōu)化。優(yōu)化PCR條件時要考慮的事項包括：

• 探針相對于引物的位置

• 熔化溫度

• 退火溫度

• 氣相色譜內容

• 底漆設計