基因按其功能可分為：

　　1．結構基因（structural gene）是指某些能決定某種多肽鏈（蛋白質）或酶分子結構的基因.結構基因的突變可導致特定蛋白質（或酶）一級結構的改變或影響蛋白質（或酶）量的改變.

　　2.調控基因（regulator and control gene）是指某些可調節(jié)控制結構基因表達的基因.調控基因的突變可以影響一個或多個結構基因的功能,或導致一個或多個蛋白質（或酶）時的改變.

　　此外,還有一些只轉錄而不翻譯的基因,如核糖體RNA基因（ribosomal RNA?gene）,也稱為rDNA基因,它們專門轉錄rRNA；還不轉運RNA基因（transfer RNA?gene）,也稱為tRNA基因,是專門轉錄tRNA的.

　　存在于原核生物與真核生物中的基因也有區(qū)別：

　　1．原核生物 一般只有一個染色體,即一個核酸分子（DNA或RNA）,大多數(shù)為雙螺旋結構,少數(shù)以單鏈形式存在.這些核酸分子大多數(shù)為環(huán)狀,少數(shù)為線狀.例如大腸桿菌染色體是由4.2×106bp(堿基對)組成的雙鏈環(huán)狀DNA分子,約有3000~4000個基因,目前已經(jīng)定位的基因已達900多個.

　　2．真核生物包括人類在內(nèi),其基因主要存在于細胞核內(nèi)線狀的染色體上.存在于細胞質的基因位于環(huán)狀的線粒體DNA上.核內(nèi)基因的DNA順序由編碼順序和非編碼順序兩部分構成.編碼順序是不連續(xù)的,被非編碼順序隔開.其次,真核的生物基因大小差別很大,例如,人類血紅蛋白的基因長僅約1700bp,而假肥大型營養(yǎng)不良癥（duchenne muscular dystrophy,DMD）基因全長2300kb,是迄今認識的最巨大的人類基因.