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小伙伴們，大家好呀，很高興和大家見(jiàn)面，最近看到有果粉提問(wèn)關(guān)于WGCNA分析中的module-trait-realtionship圖譜的問(wèn)題，之前呢有寫(xiě)過(guò)關(guān)于WGCNA分析中的一些專(zhuān)業(yè)術(shù)語(yǔ)基礎(chǔ)知識(shí)的推文，如果有小伙伴需要，可直接在往期里面查找就可以了，今天呢我們來(lái)聊聊關(guān)于如何進(jìn)行module-trait-realtionship讀圖。內(nèi)容分為兩部分：

一是介紹什么是module，

二是module-trait-realtionship圖解讀。

走神的，還沒(méi)有準(zhǔn)備好的小伙伴快來(lái)看這吧。

一、介紹Module

Module：稱(chēng)為模塊，也可以把它看為一個(gè)是基因集。在模塊內(nèi)存在高度相關(guān)的基因。在WGCNA分析中把基因聚類(lèi)成模塊后，對(duì)每個(gè)模塊進(jìn)行了功能富集分析、模塊與性狀進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析和模塊與樣本進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析，分別可以去查找基因的功能特征，篩選出表型與性狀關(guān)聯(lián)較高的的模塊和查找樣本中特異表達(dá)基因。

二、解讀module-trait?realtionship圖譜

module-trait-realtionship圖譜是像上圖這樣的，它是模塊與表型特征關(guān)聯(lián)圖譜。首先我們來(lái)看橫坐標(biāo)：它是表型性狀（trait），這里呢它有兩個(gè)表型性狀，一個(gè)是Healthy，另一個(gè)是Heart_failure?？v坐標(biāo)：對(duì)應(yīng)模塊，用每個(gè)模塊的特征基因（eigengene）來(lái)表示這個(gè)模塊。eigengene代表的是每個(gè)模塊的第一主成分。在本圖中有9個(gè)模塊，分別用不同顏色表示。格子代表橫坐標(biāo)的表型性狀和縱坐標(biāo)的每個(gè)模塊的相關(guān)性以及pvalue值，紅色越深，越正相關(guān)；綠色越深，越負(fù)相關(guān)。最右邊的圖例，代表的是相關(guān)性，越接近1紅色越深，代表正相關(guān)，越接近-1綠色越深，代表負(fù)相關(guān)。根據(jù)上圖可以看出分析得到的9個(gè)模塊中，有5個(gè)模塊（MEturquoise、MEpink、MEblack、MEbrown、MEblue）與疾病的相關(guān)性較高（|r|>0.7,p<0.05）。

到這里呢，小果的分享就到此結(jié)束了，小伙伴有什么問(wèn)題可以私信小果哦，期待與小伙伴再會(huì)。

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