運(yùn)用LC-MS非靶向代謝組學(xué)探究青蟹適應(yīng)急性鹽度變化的主要因素
前言
2021年11月,寧波大學(xué)海洋科學(xué)學(xué)院王春琳?qǐng)F(tuán)隊(duì)在Frontiers in Marine Science期刊發(fā)表了題為“Metabolic Changes in Scylla paramamosain During Adaptation to an Acute Decrease in Salinity”的研究成果,通過(guò)LC-MS非靶向代謝組學(xué)研究方法,發(fā)現(xiàn)了氨基酸和能量代謝是參與青蟹適應(yīng)鹽度變化的主要因素,而脂質(zhì)代謝物起輔助作用。
基本信息
中文標(biāo)題:青蟹在適應(yīng)鹽度急劇下降過(guò)程中的代謝變化
研究對(duì)象:青蟹
發(fā)表期刊:Frontiers in Marine Science
影響因子:4.912
發(fā)表時(shí)間:2021年11月2日
合作單位:寧波大學(xué)應(yīng)用海洋生物技術(shù)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
運(yùn)用生物技術(shù):LC-MS非靶向代謝組學(xué)(由鹿明生物提供技術(shù)支持)
研究背景
青蟹是一種廣鹽甲殼類(lèi)動(dòng)物,廣泛分布于從印度洋到西太平洋地區(qū),包括中國(guó)東南沿海地區(qū),它對(duì)鹽度的突然降低極其敏感。青蟹生活在咸水和咸水河口,成熟的雌性遷徙到近海繁殖,而這些地區(qū)容易受到大雨或水環(huán)境大規(guī)模變化的影響,導(dǎo)致鹽度急劇下降。大幅度降低鹽度可能會(huì)超過(guò)青蟹調(diào)節(jié)滲透壓的能力,從而導(dǎo)致死亡。因此,青蟹適應(yīng)急性鹽度降低的生物學(xué)機(jī)制需要進(jìn)一步的探索。
研究思路
研究方法
1.實(shí)驗(yàn)分組
(1) CK組: 海水鹽度為23 psu、溫度為20°C?
(2) LS組: 海水鹽度為3 psu、溫度為20°C
2.鰓中血清滲透壓和酶活性的測(cè)定:ELISA檢測(cè)
3.LC-MS非靶向代謝組學(xué)分析
研究結(jié)果
鹽度急速降低對(duì)青蟹血淋巴滲透壓的影響
鹽度從23下降到3 psu后,青蟹的血淋巴滲透壓開(kāi)始迅速下降,在6 h達(dá)到最低點(diǎn)606.50 mOsm/kg HO,然后開(kāi)始上升,在24 h達(dá)到最高點(diǎn),在它緩慢下降并在 48 小時(shí)后穩(wěn)定之前(圖 1A)。
圖1 | 鹽度對(duì)青蟹血淋巴滲透壓的影響。
(A)顯示了鹽度變化下青蟹滲透壓的變化;
(B)是青蟹和海水的滲透壓等滲圖。在(B)中,D1和C1分別是青蟹在鹽度23和3的血淋巴滲透壓,C2和D2分別是23和3 psu的海水滲透壓。
海水鹽度為 23 psu時(shí),海水的滲透壓 (D2) 為 601.75 mOsm/kgHO,青蟹血淋巴的滲透壓 (C2) 為726.75mOsm/kg HO(圖 2B ) ;?當(dāng)海水鹽度降至 3 psu 時(shí),海水的滲透壓(D1)為 77.18 mOsm/kgHO,青蟹血淋巴的滲透壓為 642.38 mOsm/kgHO(圖 2B)??梢钥闯觯?~23 psu的環(huán)境中,青蟹的滲透壓始終高于海水的滲透壓,并且青蟹的滲透壓不會(huì)隨著海水滲透壓的快速下降而大幅度降低。
圖2 | 鹽度對(duì)青蟹鰓離子轉(zhuǎn)運(yùn)酶活性的影響
* 表示不同鹽度下離子轉(zhuǎn)運(yùn)酶活性同時(shí)存在顯著差異。
鹽度急速降低對(duì)青蟹鰓中參與滲透壓調(diào)節(jié)相關(guān)酶活性的影響
對(duì)當(dāng)鹽度從23 psu降至3 psu時(shí),Na-K-ATPase活性在6 h后升高至31.53 U/mL,該值明顯高于CK組。24 h 后活性逐漸下降,最終達(dá)到 24.28 U/mL 的平衡狀態(tài)(圖 2A)。CA 活性在前 6 小時(shí)內(nèi)增加,此后保持在此穩(wěn)定狀態(tài)。此外,LS組的CA活性(16.54 U/mL)顯著(1.8倍)高于CK組。V-ATPase 活性在前 6 小時(shí)內(nèi)增加,達(dá)到 21.88 U/mL,然后穩(wěn)定下來(lái)(圖 2)。
鹽度驟降引起青蟹鰓的代謝物變化
采用LC-MS非靶向代謝組學(xué)檢測(cè)CK和LS蟹鰓代謝組的變化。經(jīng)過(guò)數(shù)據(jù)處理,共檢測(cè)到 16,261 個(gè)質(zhì)譜特征信號(hào),鑒定出 4,023 種代謝物。鰓提取物的可檢測(cè)代謝物含有脂肪?;Ⅳ人峒捌溲苌?、甘油磷脂等。
圖3 | LC-MS非靶向代謝組學(xué)分析
在 ESI (+) (A)和 ESI (-) (B)中來(lái)自QC樣品的鰓樣品的BPC;青蟹的CK和LS的PCA得分圖(C)、OPLS-DA 得分圖(D)和響應(yīng)排列測(cè)試(E)。
研究者運(yùn)用主成分分析(PCA)、質(zhì)量控制 (QC) 等進(jìn)一步證實(shí)了數(shù)據(jù)的可靠性。PCA結(jié)果顯示CK組和LS組有比較明顯的分布規(guī)律(圖3C)。同時(shí),OPLS-DA 模型顯示兩組之間的差異顯著(x 軸方向),所有樣本點(diǎn)均在 95% 置信區(qū)間內(nèi)(圖 3D)。通過(guò)對(duì)OPLS-DA模型的擬合檢驗(yàn),可以發(fā)現(xiàn)模型對(duì)樣本的解釋能力[R2Y(cum)]和預(yù)測(cè)能力[Q2(cum)]分別為0.992和0.944。此外,直線(xiàn)的斜率較大,Q2 的截距為-0.646,說(shuō)明 OPLS-DA 模型沒(méi)有超出擬合(圖 3E)。綜上所述,OPLS-DA模型具有良好的解釋和預(yù)測(cè)能力,能夠真實(shí)反映不同樣本組之間的差異。以上結(jié)果均表明,與23 psu海水相比,3 psu海水條件下青蟹鰓的代謝物發(fā)生了明顯變化。
?篩選差異代謝物
之后研究者通過(guò)多維分析、一維分析和火山圖分析(圖4A),篩選出LS組和CK組之間的差異代謝物。共篩選出LS組519種不同代謝物,其中上調(diào)代謝物288種(表2),下調(diào)代謝物231種(表3)。
圖4 | 差異代謝物篩選
(A)LS和CK組差異代謝物火山圖紅色原點(diǎn)代表顯著上調(diào)的差異代謝物,藍(lán)色原點(diǎn)代表顯著下調(diào)的差異代謝物,灰色原點(diǎn)代表差異不顯著的差異代謝物;青蟹鰓組織中CK和LS的差異代謝物分類(lèi)餅圖:(B)上調(diào)差異代謝物和(C)上調(diào)差異代謝物。
不同代謝物的代謝途徑分析
研究者通過(guò)差異代謝物的代謝途徑富集分析,共得到63條代謝途徑,其中有13條重要的代謝途徑,分別為氨基酸代謝/其他氨基酸代謝、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、碳水化合物代謝、輔因子和維生素的代謝、核苷酸代謝(嘌呤代謝)、膜運(yùn)輸、核苷酸代謝、信號(hào)分子和相互作用,以及脂質(zhì)代謝(圖 5A)。此外還有包括氨基酸代謝/其他氨基酸代謝,碳水化合物代謝等50 個(gè)非顯著富集代謝途徑。從分類(lèi)可以發(fā)現(xiàn),顯著代謝途徑和非顯著途徑均主要與氨基酸、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)和能量代謝有關(guān)。
圖5 | 青蟹鰓組織中適應(yīng)低鹽度的代謝途徑分析
餅圖分類(lèi):顯著富集(A)和非顯著富集(B);青蟹適應(yīng)低鹽度的前 20 種代謝途徑的代謝組視圖圖(C)。
通過(guò) GC-MS/LC-MS 進(jìn)行相關(guān)性分析
為了更全面地揭示青蟹對(duì)低鹽度的適應(yīng)代謝機(jī)制,研究者對(duì)GC-MS和LC-MS進(jìn)行了相關(guān)性分析。發(fā)現(xiàn)甜菜堿、?;撬?、天冬酰胺和天冬氨酸等與滲透調(diào)節(jié)相關(guān)的氨基酸出現(xiàn)上調(diào)。并且它們之間存在很強(qiáng)的正相關(guān)關(guān)系。此外,這四種氨基酸與富馬酸、6-磷酸葡萄糖酸、PC(15:0/20:5)、PE(18:2)、PS[O-20:0/18:1(9Z) ],其他代謝物與 LysoPC(20:4)、LysoPC(18:1)、LysoPC(20:5)、乙醇酸、咪唑丙烯酸等呈正相關(guān),均下調(diào),呈強(qiáng)負(fù)相關(guān)(圖6)。
圖6 | 前50種不同代謝物的相關(guān)性分析圖;
相關(guān)性分析圖表示不同物質(zhì)表達(dá)水平之間的相關(guān)性,紅色表示正相關(guān),藍(lán)色表示負(fù)相關(guān)。顏色越深,圓點(diǎn)越大,相關(guān)值越高。
相關(guān)分析共篩選出76條通路,其中顯著差異代謝通路28條(P< 0.05)。(圖 7A、C)和 48 條非顯著差異代謝途徑(P < 0.05)(圖 7B)。
圖7 | 青蟹鰓組織適應(yīng)低鹽度的代謝途徑類(lèi)餅圖
相關(guān)討論
文章研究結(jié)果表明,青蟹的滲透壓并沒(méi)有隨著環(huán)境鹽度的下降而持續(xù)下降,證實(shí)了 Na-K-ATPase 和 CA能夠調(diào)節(jié)青蟹滲透平衡。LC-MS非靶向代謝組學(xué)的結(jié)果表明,甘油磷脂可能在青蟹滲透壓調(diào)節(jié)中起主導(dǎo)作用,而甘油磷脂代謝主要參與磷脂酰膽堿(PC),磷脂酰乙醇胺(PE)、LysoPC和磷酸膽堿的調(diào)節(jié)。在此研究中,PC是上調(diào)最多的磷脂,這表明PC在青蟹的滲透壓調(diào)節(jié)中起關(guān)鍵作用。GC-MS 和 LC-MS 數(shù)據(jù)的相關(guān)性分析表明青蟹滲透壓的平衡主要依靠調(diào)節(jié)離子和氨基酸。氨基酸大多以自由擴(kuò)散的方式進(jìn)出細(xì)胞以維持滲透平衡狀態(tài)。此外,一些與糖代謝和能量代謝相關(guān)的重要代謝途徑可能也參與了青蟹滲透壓的調(diào)節(jié)。
研究討論
在這項(xiàng)研究中,研究者運(yùn)用非靶向代謝組學(xué)指出了脂質(zhì)和氨基酸在青蟹適應(yīng)鹽度急速下降中的作用和關(guān)系。首次闡明了通過(guò)細(xì)胞膜的運(yùn)輸發(fā)生的細(xì)胞滲透壓調(diào)節(jié)的機(jī)制。這項(xiàng)研究結(jié)果可用于制定應(yīng)急策略,以應(yīng)對(duì)養(yǎng)殖環(huán)境中鹽分的急劇下降,并改進(jìn)內(nèi)陸低鹽度環(huán)境中的水產(chǎn)養(yǎng)殖技術(shù)。在青蟹的養(yǎng)殖中,在飼料中添加一定量的?;撬岷吞鸩藟A或通過(guò)相關(guān)產(chǎn)物增強(qiáng)代謝途徑,可以提高青蟹適應(yīng)鹽度急速下降的能力。
小鹿推薦
鹽度的變化會(huì)影響甲殼類(lèi)動(dòng)物的生長(zhǎng)、免疫力和疾病狀態(tài)。文章作者通過(guò)非靶代謝組學(xué)對(duì)青蟹適應(yīng)鹽度急性下降過(guò)程中的代謝變化進(jìn)行了研究,利用GC-MS 和 LC-MS 數(shù)據(jù)聯(lián)合分析了青蟹應(yīng)對(duì)鹽度急性下降情況的主要代謝途徑。研究結(jié)果表明,在急性低鹽脅迫下,青蟹通過(guò)甘油磷脂代謝物調(diào)節(jié)生物膜的結(jié)構(gòu)發(fā)生變化,然后通過(guò)ABCs轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白運(yùn)輸氨基酸和碳水化合物,實(shí)現(xiàn)細(xì)胞內(nèi)外的滲透平衡。此項(xiàng)研究體現(xiàn)了組學(xué)技術(shù)在機(jī)制研究中的重要作用。
Anger, K., Riesebeck, K., and Püschel, C. (2000). Effects of salinity on larval and early juvenile growth of an extremely euryhaline crab species, Armases miersii (Decapoda: Grapsidae). Hydrobiologia 426, 161–168. doi: 10.1023/A:1003926730312
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