空間轉(zhuǎn)錄組（Spatial Transcriptomics）是一種以空間的維度分析和描述特定細胞類型的表達譜，來了解器官、組織和病理狀態(tài)之間的表達差異的技術(shù)，它能夠解析組織在不同空間位置的轉(zhuǎn)錄本情況?？臻g轉(zhuǎn)錄組技術(shù)結(jié)合常規(guī)的單細胞測序技術(shù)、原位技術(shù)和其他組學技術(shù)，可實現(xiàn)細胞異質(zhì)性研究，并定位到組織的空間位置，為疾病研究提供更精準的研究方向，對深入理解疾病致病機理以及靶向治療具有重要意義。

作為近年非?；钴S的組學技術(shù)， 空間轉(zhuǎn)錄組一經(jīng)推出立即“引爆”了科研學術(shù)界，在 2020 年被?Nature Methods?評為了年度技術(shù)，同時在2022 年再次被評為值得關(guān)注的7大年度技術(shù)之一。毫無疑問，空間轉(zhuǎn)錄組測序成為了繼單細胞測序技術(shù)之后的另一個生物技術(shù)研究熱點。

根據(jù)統(tǒng)計，從 2018 年至 2022 年，空間組學方向共發(fā)表 655 篇論文。尤其是從 2020年 開始，空間組學文章數(shù)量呈爆發(fā)式增長，主要的研究熱點在腫瘤、神經(jīng)科學及病理研究領(lǐng)域。在 2020年，空間“Visium”一詞第一次出現(xiàn)在?Cell?這類頂級期刊上，表明空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)正式邁上新的里程碑。

包括10x Genomics 在內(nèi)的技術(shù)服務公司在近兩年不斷更新新技術(shù)，推出新儀器，發(fā)表文章的數(shù)量也是逐年增長。目前應用10x Visium空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)發(fā)表的高分文章累計170+篇（數(shù)據(jù)來源為10x官方網(wǎng)站統(tǒng)計），包含了新鮮冷凍組織（FF）和石蠟包埋組織（FFPE）兩類樣本類型，物種涵蓋了人、鼠及其他動植物。

博奧晶典已推出 10x Genomics 的 3 種空間組學解決方案，可滿足幾乎所有物種的新鮮冷凍組織（FF）、人和小鼠的石蠟包埋組織（FFPE）完成空間轉(zhuǎn)錄組實驗。

10x Visium FF空間轉(zhuǎn)錄組

它對于物種選擇基本沒有限制，需要對新鮮冷凍的組織切片進行成像，并將其放置在包含與 RNA 結(jié)合的捕獲探針的陣列上。將組織固定并透化以釋放 RNA，使其與相鄰的捕獲探針結(jié)合，從而捕獲基因表達信息。然后以捕獲的 RNA 為模板反轉(zhuǎn)錄合成 cDNA，制備文庫。最后對文庫進行測序，對下機數(shù)據(jù)進行可視化分析，以確定基因在空間上的表達量。

10x Visium FFPE空間轉(zhuǎn)錄組

它可以解決實驗室中經(jīng)福爾馬林固定和石蠟包埋的人、鼠的石蠟塊樣本，針對特定基因，設(shè)計成對探針與其靶標雜交，組織被滲透后，釋放連接的探針對，結(jié)合捕獲載玻片上的探針，以此捕獲基因表達信息，從而獲得空間轉(zhuǎn)錄組情況。

10x Visium CytAssist FFPE空間轉(zhuǎn)錄組

它在原有的 10x Visium FFPE 空間轉(zhuǎn)錄組基礎(chǔ)上做了試劑/探針升級，針對人的 90% 低表達基因設(shè)計了三對探針，提高了基因檢出率；樣本類型可兼容石蠟塊和已經(jīng)貼好的石蠟切片，極大地豐富了樣本選擇。同時，對于 10x Visium FFPE 空間轉(zhuǎn)錄組不能解決的樣本問題：如珍貴樣本已經(jīng)貼在普通玻片上，無法轉(zhuǎn)移；切片面積大于捕獲面積，希望只針對感興趣的區(qū)域進行研究；病理科石蠟樣本不允許帶出醫(yī)院；重要的石蠟樣本保存時間太久，質(zhì)檢不合格；研究需要更大的切片面積等，都能應用 CytAssist 儀器完成。

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目前博奧晶典已支持發(fā)表 8 篇空間組學文章，其中包括國內(nèi)首篇 10x 空間轉(zhuǎn)錄組學高分文章（點擊查看）。作為 10x Genomics 公司在國內(nèi)的最大服務商，博奧晶典將持續(xù)深耕空間組學領(lǐng)域，致力為科研工作者提供更全面，更優(yōu)質(zhì)的空間組學服務。歡迎各位老師留言咨詢！