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生物信息學:導論與方法(北京大學)

2023-07-24 16:45 作者:藍球三年級練習生  | 我要投稿

Biological pathway

  1. metabolic pathways
  2. gene regulation pathways
  3. signal transduction pathways


通路數(shù)據(jù)庫:

KEGG (最常用)

biocarta/biocyc.....


簡介KEGG數(shù)據(jù)庫

different elements in pathway:

長方形:gene product, mostly protein but including RNA

圓圈:other molecule,mostly chemical compound


different hieratical interactions:

protein-protein interactions

gene expression relations

enzyme-enzyme relations


KEGG pathway的數(shù)據(jù)存儲方式

KEGG markup language format KGML







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