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OLINK蛋白組助力超400例潰瘍性結(jié)腸炎血漿蛋白標(biāo)志物發(fā)現(xiàn)!

2022-06-13 10:04 作者:中科新生命  | 我要投稿


炎癥性腸病?(IBD) 包括潰瘍性結(jié)腸炎(UC)和胃腸道的慢性炎癥性疾克羅恩病(CD)。與許多其他慢性免疫介導(dǎo)疾病一樣,炎癥似乎是由遺傳易感個體暴露于環(huán)境風(fēng)險因素引起的。目前,人們對最終導(dǎo)致不可逆炎癥的早期關(guān)鍵驅(qū)動因素和引發(fā)免疫失調(diào)的觸發(fā)因素的理解甚少。然而,越來越多的數(shù)據(jù)表明,明顯癥狀出現(xiàn)并得到疾病診斷之前是臨床前疾病階段,在此階段,遺傳和環(huán)境風(fēng)險因素之間的復(fù)雜相互作用導(dǎo)致微生物轉(zhuǎn)移、上皮完整性喪失以及免疫反應(yīng)失調(diào)的啟動和擴(kuò)大。

這些早期疾病過程最終導(dǎo)致亞臨床炎癥,同時激活先天和適應(yīng)性免疫系統(tǒng)。但前序研究表明,在后期被診斷患有潰瘍性結(jié)腸炎的個體的血清中尚未發(fā)現(xiàn)任何蛋白質(zhì)標(biāo)志物特征。深入研究潰瘍性結(jié)腸炎的早期階段有助提高對疾病發(fā)病機(jī)制治療目標(biāo)的進(jìn)一步了解,因?yàn)橐坏┗颊叱霈F(xiàn)癥狀并被診斷出患有既定疾病,早期關(guān)鍵炎癥途徑的模式可能會被非特異性炎癥所掩蓋。

近期瑞典厄勒布魯大學(xué)醫(yī)院研究團(tuán)隊(duì)在Gastroenterology雜志(IF 22.68)發(fā)表題目為“Systemic Inflammation in Preclinical Ulcerative Colitis”的文章,旨在系統(tǒng)研究臨床前潰瘍性結(jié)腸炎的全身性炎癥免疫反應(yīng)。文中通過以含212個體的臨床前潰瘍性結(jié)腸炎隊(duì)列(Pre-clinical Cohort)為發(fā)現(xiàn)隊(duì)列,以及含151個體的起始隊(duì)列(Inception Cohort)和含78個體的雙胞胎隊(duì)列(Healthy Twins Cohort)兩個隊(duì)列為驗(yàn)證隊(duì)列,使用Olink炎癥panel進(jìn)行血漿蛋白組學(xué)研究,最終發(fā)現(xiàn)了6種蛋白標(biāo)志物可以作為潰瘍性結(jié)腸炎的早篩早診,且其中4個蛋白質(zhì)與遺傳及環(huán)境風(fēng)險暴露相關(guān)(圖1)。

圖1 ?隊(duì)列設(shè)計及研究發(fā)現(xiàn)概述

研究方案及結(jié)果

1. 臨床前潰瘍性結(jié)腸炎隊(duì)列

單蛋白邏輯回歸模型找到了6種特定蛋白(MCP-1、CXCL9、SLAMF1、CCL11、MMP10和CXCL11)有差異表達(dá)(標(biāo)稱P值<0.05)(表1)。在將性別、年齡和吸煙習(xí)慣作為協(xié)變量后,所有標(biāo)志物仍然顯著。在這些標(biāo)志物中,MMP10、CXCL9和CCL11與后期潰瘍性結(jié)腸炎的診斷最密切相關(guān)。

表1?臨床前隊(duì)列中差異表達(dá)的血漿蛋白標(biāo)志物

2. 驗(yàn)證臨床前蛋白標(biāo)志物的生物學(xué)相關(guān)性

通過比較IBD特征初始隊(duì)列中診斷為潰瘍性結(jié)腸炎的初治患者和健康對照來驗(yàn)證所鑒定蛋白質(zhì)的生物學(xué)相關(guān)性,與臨床前隊(duì)列中的發(fā)現(xiàn)一致,除MCP-1外的所有已鑒定蛋白質(zhì)均有差異表達(dá)(表2)。


?表2?IBD特征隊(duì)列中未接受治療的潰瘍性結(jié)腸炎患者和健康對照者的診斷前蛋白質(zhì)相對豐度比較

并通過建立一個基于5種炎癥蛋白的多變量預(yù)測模型來檢查這些標(biāo)志物的預(yù)測能力,并通過執(zhí)行LOO交叉驗(yàn)證分析驗(yàn)證其在初始隊(duì)列中的預(yù)測能力(圖2)。該模型在將初治、新診斷的潰瘍性結(jié)腸炎患者與健康對照組區(qū)分開來方面具有很高的預(yù)測能力(LOO AUC=0.92)。

圖2 受試者工作曲線(ROC)分析區(qū)分初始隊(duì)列中的初治潰瘍性結(jié)腸炎患者與健康對照

3.?共享遺傳和環(huán)境風(fēng)險因素對臨床前蛋白標(biāo)志物的影響

通過比較潰瘍性結(jié)腸炎患者的健康雙胞胎兄弟姐妹和健康獻(xiàn)血者來研究共有遺傳和環(huán)境風(fēng)險因素對臨床前蛋白質(zhì)標(biāo)志物的影響。與臨床前隊(duì)列的研究結(jié)果一致,在健康雙胞胎兄弟姐妹中觀察到MMP10、CXCL9、CXCL11和 MCP-1上調(diào)(表3)。


表3?潰瘍性結(jié)腸炎患者健康雙胞胎兄弟姐妹和健康獻(xiàn)血者診斷前蛋白標(biāo)志物相對豐度的比較

此外,CCL11似乎被上調(diào)(P=0.08),但SLAMF1不顯著(P=0.22)。并且這些蛋白質(zhì)標(biāo)志物的水平在同卵和異卵健康雙胞胎之間沒有顯著差異。在由4個顯著重復(fù)的生物標(biāo)志物蛋白(LOO AUC=0.62,圖3)構(gòu)建的 LOO 交叉驗(yàn)證預(yù)測模型中,潰瘍性結(jié)腸炎患者的健康雙胞胎兄弟姐妹在某種程度上也可以與健康的獻(xiàn)血者分開。

圖3 受試者工作曲線(ROC)分析區(qū)分潰瘍性結(jié)腸炎患者的健康雙胞胎與健康獻(xiàn)血者

4. 不同隊(duì)列中蛋白標(biāo)志物水平的探索

當(dāng)相對蛋白標(biāo)志物水平相對于每個隊(duì)列的健康對照的平均值進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化并進(jìn)行比較時,除MCP-1外,所有隊(duì)列中6種預(yù)診斷標(biāo)志物的相對豐度均呈階梯式增加。在健康對照組(調(diào)整為1)中觀察到最低水平,健康的雙胞胎兄弟姐妹和臨床前患者表現(xiàn)出中等水平,而潰瘍性結(jié)腸炎患者表現(xiàn)出最高的相對豐度(圖 4 B-G)。

圖4 (A)來自臨床前隊(duì)列的6種蛋白質(zhì)在3個隊(duì)列中的重合情況。(B-G)臨床前潰瘍性結(jié)腸炎病例、潰瘍性結(jié)腸炎患者和潰瘍性結(jié)腸炎患者的健康雙胞胎與健康對照組的失調(diào)蛋白的相對水平。

最后展望

本文確定了6種血漿蛋白標(biāo)志物的上調(diào),在產(chǎn)生臨床顯著性潰瘍性結(jié)腸炎的數(shù)年前,便參與激活了促炎和組織修復(fù)途徑。這個研究結(jié)果為最終導(dǎo)致潰瘍性結(jié)腸炎的炎癥事件的早期預(yù)測提供了新的數(shù)據(jù),因?yàn)?strong>暴露于遺傳和環(huán)境風(fēng)險因素會觸發(fā)幾種蛋白質(zhì)的激活。對早期疾病機(jī)制的進(jìn)一步了解可能會揭示新的治療靶點(diǎn),并為疾病預(yù)測和干預(yù)措施開辟途徑,以延緩甚至阻止疾病向臨床表現(xiàn)的進(jìn)展。

當(dāng)然,由于隊(duì)列樣本的限制,后續(xù)研究還應(yīng)針對在潰瘍性結(jié)腸炎的所有不同階段(即臨床前階段、診斷時以及診斷后)收集的生物材料的縱向評估,去發(fā)現(xiàn)更多的蛋白標(biāo)志物或證據(jù)??傊?,本文通過三個隊(duì)列的巧妙設(shè)計篩選出一個蛋白標(biāo)志物模型,可以在疾病診斷前區(qū)分潛在患者及健康人群,顯示了蛋白標(biāo)志物在疾病早篩領(lǐng)域中的重要作用。


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