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CORAL聯(lián)盟新突破 | Olink 助力阿爾茲海默癥蛋白診斷標(biāo)志物的開發(fā)與轉(zhuǎn)化

2023-03-20 13:22 作者:伯豪生物  | 我要投稿

研究背景

阿爾茨海默病(AD)是最常見的神經(jīng)系統(tǒng)退行性疾病,為癡呆患者的主要病因(60-80%)。腦脊液(CSF)中的蛋白組分可以反映大腦中發(fā)生的生物學(xué)變化,因此CSF中的部分蛋白可作為不同神經(jīng)退行性疾病的生物標(biāo)志物。目前AD常用的CSF生物標(biāo)志物包括Aβ42或Aβ42/40以及磷酸化tau蛋白和總tau蛋白。然而,這幾種生物標(biāo)志物無(wú)法反應(yīng)出AD多因素疾病的特性,且對(duì)于區(qū)分AD和其他非AD癡呆癥的作用有限。因此,繪制AD患者的CSF蛋白組圖譜將有助于更好地了解AD的多因素病理生理學(xué)特征,開發(fā)更有效的生物標(biāo)志物診斷工具。


為了對(duì)神經(jīng)疾病的生物標(biāo)志物生物機(jī)制進(jìn)行深入研究,Olink于2021年成立了一個(gè)科學(xué)家合作社區(qū)——CORAL聯(lián)盟點(diǎn)擊藍(lán)字了解詳情),來(lái)自阿姆斯特丹大學(xué)醫(yī)療中心的Charlotte E. Teunissen教授被委任聯(lián)盟項(xiàng)目主席。該聯(lián)盟利用Olink蛋白組學(xué)平臺(tái),對(duì)血液和腦脊髓液(CSF)樣品進(jìn)行一系列研究,包括生物標(biāo)志物、致病機(jī)制、干預(yù)后有效標(biāo)志物及預(yù)測(cè)指標(biāo)等。


新文速遞Charlotte E. Teunissen團(tuán)隊(duì)近日系統(tǒng)研究了阿爾茲海默癥蛋白組圖譜。其中,在發(fā)現(xiàn)隊(duì)列中對(duì)輕度認(rèn)知障礙伴異常淀粉樣蛋白[MCI(Aβ+),n=50]、AD-癡呆(n=230)、非AD-癡呆(n=322)和無(wú)認(rèn)知障礙對(duì)照(n=195)共797份CSF樣本,使用Olink PEA 技術(shù)對(duì)665種蛋白進(jìn)行了組學(xué)分析,繪制了癡呆譜系疾病的CSF蛋白質(zhì)組圖譜。該研究同時(shí)開發(fā)了蛋白標(biāo)志物診斷Panel, 使用驗(yàn)證隊(duì)列1(n=62)及驗(yàn)證隊(duì)列2(n=513)進(jìn)行驗(yàn)證,為癡呆譜系疾病診斷和臨床試驗(yàn)提供了新的生物標(biāo)志物工具。相關(guān)研究成果發(fā)表于《自然·衰老》雜志。該研究工作是2021年Charlotte教授領(lǐng)導(dǎo)CORAL聯(lián)盟后的一項(xiàng)「里程碑式成果」。

研究解讀

借助Olink PEA蛋白組學(xué)11個(gè)Olink Target Panel進(jìn)行蛋白檢測(cè)(心血管代謝、心血管II和III、細(xì)胞調(diào)節(jié)、發(fā)育、免疫應(yīng)答、免疫炎癥、代謝、神經(jīng)科學(xué)、癌癥II和器官損傷)。在發(fā)現(xiàn)隊(duì)列樣本中,首先分析了MCI(Aβ+)和AD-癡呆與對(duì)照組的CSF蛋白質(zhì)組學(xué)差異。MCI(Aβ+)組與對(duì)照組之間共有112個(gè)CSF蛋白水平存在差異,其中大多數(shù)蛋白質(zhì)在MCI(Aβ+)中被上調(diào)(n = 92)。而AD-癡呆組相比于對(duì)照組則有288個(gè)CSF蛋白具有差異變化,同樣大多數(shù)蛋白在AD-癡呆中上調(diào)(n = 281)。隨后,研究人員對(duì)AD-癡呆和非AD-癡呆組的CSF蛋白組學(xué)差異進(jìn)行了研究,發(fā)現(xiàn)了469個(gè)CSF蛋白在AD-癡呆和非AD-癡呆組之間表達(dá)水平不同,其中大多數(shù)蛋白在AD-癡呆中被上調(diào),僅有16個(gè)蛋白在AD-癡呆組中低水平表達(dá)。

為了將研究發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)化為常規(guī)診斷和臨床試驗(yàn)中可使用的生物標(biāo)志物工具,研究人員通過分類分析并進(jìn)行交叉驗(yàn)證,找到了一個(gè)包含8個(gè)CSF蛋白的組合,可有效地區(qū)分AD-癡呆組和對(duì)照組(AD-診斷組a,AUC 0.96)。該組合在驗(yàn)證隊(duì)列1中的準(zhǔn)確率同樣很高(AUC = 0.94)。研究人員還用同樣的方法建立了一個(gè)可區(qū)分AD-癡呆和非AD-癡呆的蛋白組合(AD-差異化診斷組b),該組合包括9種CSF蛋白,AUC高達(dá)0.87。

為了進(jìn)一步驗(yàn)證AD-診斷組和AD-差異化診斷組panel的性能,研究人員采用Olink Focus定制化開發(fā)了可檢測(cè)AD兩個(gè)診斷組中13種蛋白的Panel,并在驗(yàn)證隊(duì)列2中進(jìn)行了驗(yàn)證。結(jié)果再次證實(shí)了兩個(gè)診斷組的有效性,區(qū)分MCI(Aβ+)和AD與對(duì)照組的準(zhǔn)確率大于0.95;區(qū)分AD-癡呆與非AD-癡呆的準(zhǔn)確率為0.79。研究總結(jié)

CSF蛋白變化圖譜有助于深入理解阿爾茨海默癥的發(fā)病機(jī)制,并將研究結(jié)果轉(zhuǎn)化為實(shí)用的CSF生物標(biāo)志物物panel,為診斷和臨床試驗(yàn)提供了新的生物標(biāo)志物工具,具有非常強(qiáng)的臨床轉(zhuǎn)化價(jià)值。本研究從新標(biāo)志物的發(fā)現(xiàn)到定制化Panel的轉(zhuǎn)化,分別使用了Olink Target Panel?Focus Panel?技術(shù)路線,再一次為廣大科學(xué)家提供了從科研到臨床轉(zhuǎn)化的方法學(xué)工具及研究證據(jù)參考。


參考資料:

1.?Marta del Campo?et?al. CSF proteome profiling across the Alzheimer's disease spectrum reflects the multifactorial nature of the disease and identifies specific biomarkers panels. Nature Aging. 2022.

來(lái)源:Olink Proteomics


CORAL聯(lián)盟新突破 | Olink 助力阿爾茲海默癥蛋白診斷標(biāo)志物的開發(fā)與轉(zhuǎn)化的評(píng)論 (共 條)

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