實驗操作喂飯教學—逆轉錄
逆轉錄合成cDNA
①非特異性逆轉錄:根據(jù)實驗需要,如果對全部RNA進行逆轉錄,則使用Takara公司生產(chǎn)的PrimeScriptTM?RT Master Mix(Perfect Real Time)試劑盒(Code No. RR036A)。按照說明書,在冰上配制10 ul反應液,裝于200?ul無酶PCR管內(nèi),反應液體系如下:
非特異性逆轉錄反應體系
試劑? ? ??使用量
Total RNA? ? ??500 ng
5×PrimeScript?RT Master Mix(Perfect Real Time)? ? ??2 ul
RNase Free dH2O? ? ??補足至10 ul
反應液最多可配制成 20 ul體系,各試劑按比例相應增加。輕柔混勻,瞬時離心10?sec,該操作重復3次。在無酶PCR管上標注細胞名稱、PCR管編號等基本信息,打開PCR儀,進行逆轉錄反應,條件設置如下:
非特異性逆轉錄反應條件
溫度? ? ??時間
37℃? ? ??15 min(逆轉錄反應)
85℃? ? ??5?sec(逆轉錄酶的失活反應)
4℃? ? ??∞
反應完成后將PCR管取出,放置于冰上。如果進行Real Time?PCR反應,逆轉錄反應液可以根據(jù)實驗需要,用RNase Free dH2O稀釋2倍。如果暫時不使用,放于﹣80℃冰箱凍存。
②特異性逆轉錄:根據(jù)實驗需要,如果對特定RNA進行逆轉錄,則使用Takara公司生產(chǎn)的PrimeScriptTM?RT reagent Kit(Perfect Real Time)試劑盒(Code No. RR037A)。按照說明書,在冰上配制10 ul反應液,裝于200 ul無酶PCR管內(nèi),反應液體系如下:
特異性逆轉錄反應體系
試劑? ? ??使用量
Gene?specific primer? ? ??0.5 ul
PrimeScript?RT Enzyme Mix I? ? ??0.5 ul
Total RNA? ? ??500 ng
5×PrimeScript?Buffer(for Real Time)? ? ??2 ul
RNase Free dH2O? ? ??補足至10 ul
反應液最多可配制成 20 ul體系,各試劑按比例相應增加。Gene specific primer由廣州銳博公司設計并合成,內(nèi)參為U6,由于該公司對其具有專利,故不予公開。輕柔混勻,瞬時離心10?sec,該操作重復3次。在無酶PCR管上標注細胞名稱、PCR管編號等基本信息,打開PCR儀,進行逆轉錄反應,條件設置如下:
特異性逆轉錄反應條件
溫度? ? ??時間
42℃? ? ??15 min(逆轉錄反應)
85℃? ? ??5?sec(逆轉錄酶的失活反應)
4℃? ? ??∞
?反應完成后將PCR管取出,放置于冰上。如果進行Real Time?PCR反應,逆轉錄反應液可以根據(jù)實驗需要,用RNase Free dH2O稀釋2倍。如果暫時不使用,放于﹣80℃冰箱凍存。
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