最近在做單細胞測序的基因相關性分析，畢竟真小白，之前也沒做過，就去網上找，發(fā)現沒有，只有一篇大佬寫的，但我覺得作圖很奇怪，我就自己到處亂查一通，有了自己的新分析方法哈哈哈哈哈哈，這篇就記錄一下怎么分析兩個基因之間的相關性吧。

首先就是TCGA和RNAseq的，兩個差不多，網上也有很多教程，這邊就隨便搞了一下

然后就是單細胞測序的，我一開始是參考了這個大佬的

https://www.jianshu.com/p/9850c4d88a67

但散點圖，這樣每個點代表一個細胞，由于又是count出來的圖就奇奇怪怪

如下：

所以，我想起我以前看過的文獻單細胞測序的基因相關性散點圖，圖上一個點代表一個樣本

于是我就開始自己創(chuàng)作：

這個相關性不好，原理就是把scRNAseq變成了RNAseq，統(tǒng)計腫瘤細胞群中每個樣本的每個基因平均表達量，然后再看基因相關性。