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中國疾控:重慶出現(xiàn)首例同時感染兩種奧密克戎毒株病例

2023-03-22 20:07 作者:CCMTV臨床頻道  | 我要投稿



來源:中國疾病預防控制中心周報,https://weekly.chinacdc.cn/en/article/doi/10.46234/ccdcw2023.046近期,據中國疾控中心網站發(fā)布最新《中國疾病預防控制中心周報(China CDCweekly)》稱,2月14日,在重慶醫(yī)科大學附屬第三醫(yī)院采集并送檢的樣本中檢測到奧密克戎毒株的共同感染,這是我國首次發(fā)現(xiàn)奧密克戎BA.5.2.48 和BF.7.14亞型共同感染的病例。


Omicron BF.7.14和 BA.5.2.48 患者的兩種共感染菌株的系統(tǒng)發(fā)育分析。注:實驗室獲得的 SARS-CoV-2 基因組被整合到另外88個 SARS-CoV-2 序列中從 GISAID 數據庫下載變體。代表共感染樣本序列的無根系統(tǒng)發(fā)育YB20230158和 YB20230202來自BA.5的獨立進化枝報告顯示,2022年12月23日,該患者報告食欲不佳,12月29日新冠感染檢測呈陽性。2023年1月4日,患者出現(xiàn)寒戰(zhàn)和發(fā)燒(體溫38.9℃),并伴有咳嗽癥狀,住進云陽縣中醫(yī)醫(yī)院但未明顯好轉,1月5日出院。1月6日,該患者住進重慶醫(yī)科大學第三附屬醫(yī)院傳染病科。從1月6日到2月12日,8次核酸檢測呈陽性。


測序標本中 SARS-CoV-2 BF.7.14 和 BA.5.2.48譜系定義多態(tài)性變異頻率的基因組水平視圖

注意:編碼每個突變的測序讀數的頻率由直方圖顯示,突出顯示定義每個譜系的突變。共有13個定義 BF.7.14 和 BA.5.2.48 譜系的基因組位置與注釋的 SARS-CoV-2 基因組相關,包括 6 個定義 BF.7.14 的獨特基因組位置(G1085T、G14181C、C7528T、G25290T 、G22599C 和 T22917G)和定義 BA.5.2.48 的 7 個獨特的基因組位置(C2710T、C8626T、C11824T、G12310A、C16616A、C16887T 和 T17208C)。

研究人員于2023年1月28日和2月7日從患者身上采集上呼吸道樣本,分別命名為YB20230158和YB20230202,這兩個樣本形成了一個獨立的分支,不同于奧密克戎亞變體BA.5.2.48和BF.7.14。突變位點分析顯示,兩個樣本都含有奧密克戎亞變體BA.5.2.48和BF.7.14的特異性定義位點,患者同時感染了奧密克戎亞變體BA.5.2.48和BF.7.14。文章稱,目前在重慶流行的主要新冠病毒變異株為BA.5.2.48(>90% ),其次 為BF.7.14(約3.8%)。到目前為止,中國還沒有關于BA.5.2.48和BF.7.14共同感染的報告,特別是在重慶,BF.7.14比例相對較低。周報信息顯示,在該病例中,患者是名67歲的女性,有惡性腫瘤病史,在過去6個月內接受過化療、放療、靶向治療和其他治療,但沒有其他基礎疾病、吸煙史或飲酒習慣,接種過兩針新冠疫苗。報告稱,她的家人和鄰居在12月下旬被發(fā)現(xiàn)感染,這表明有潛在的接觸。兩次住院期間,她可能接觸過其他感染新冠病毒的人。德國埃森大學醫(yī)學院病毒研究所教授陸蒙吉介紹,共同感染的前提是接觸過不同的毒株。目前全球有很多不同的變異株在流傳,個人確實可能被不同變異株感染。他分析稱,這個病人感染后持續(xù)陽性時間很長,有可能是有免疫缺陷,不能和其他人一樣,在1到2周內清除病毒。中疾控周報中稱,監(jiān)測新冠病毒變異株應作為識別合并感染和重組病例的重要策略加以推廣。隨著各種變種在一個地區(qū)共同傳播的風險不斷增加,對新冠病毒變異株的監(jiān)測,特別是對免疫缺陷的關鍵人群的監(jiān)測,變得越來越重要。值得關注的是,3月16日,世衛(wèi)組織更新了對新冠病毒病毒的變異株的跟蹤系統(tǒng)和工作定義,以更好地適應當前全球變異株情況,獨立評估正在流行的奧密克戎亞譜系,并在需要時對新變異株進行更明確的分類。世衛(wèi)組織表示,SARS-CoV-2一直在持續(xù)演變。自暴發(fā)COVID-19大流行疫情以來,考慮到所評估的新變異株擴大和替換先前變異株的潛力、加劇波浪式傳播的潛力以及調整公共衛(wèi)生行動的必要性,世衛(wèi)組織確定了多個需要關注的變異株(VOCs)和需要留意的變異株(VOIs)。在比較了動物血清抗原交叉反應、人類呼吸道實驗模型復制研究結果情況以及人類臨床和流行病學研究的證據后,世衛(wèi)組織SARS-CoV-2病毒進化技術咨詢小組(TAG-VE)的專家達成共識,認為與以前變異株相比,奧密克戎是迄今為止差異最大的需要關注的變異株。從遺傳和抗原角度來看,自出現(xiàn)以來,奧密克戎病毒持續(xù)進化,亞譜系范圍不斷擴大。迄今為止,與奧密克戎之前的需要關注的變異株相比,這些亞譜系的特點是能夠逃避現(xiàn)有的人群免疫力,并且往往是感染上呼吸道,而不是下呼吸道。自2022年2月以來,在所公布的基因序列中,奧密克戎病毒占98%以上。奧密克戎病毒是可能出現(xiàn)的SARS-CoV-2新變異株的基因來源。不過,仍有可能在先前傳播的變異株基礎上演變出新的變異株或出現(xiàn)全新的變異株。以前的系統(tǒng)將奧密克戎所有亞譜系歸為需要關注的奧密克戎變異株,而這缺乏必要的精細度,無法將表型已改變的新的后代譜系與奧密克戎親本譜系(BA.1、BA.2、BA.4/BA.5)進行比較。因此,自2023年3月15日起,世衛(wèi)組織變異株跟蹤系統(tǒng)將奧密克戎亞譜系分為監(jiān)測中的變異株,需要關注的變異株,以及需要留意的變異株。另外,世衛(wèi)組織正在更新需要關注的變異株和需要留意的變異株的工作定義。主要更新了關于需要關注的變異株的定義,新定義更為具體,列出了SARS-CoV-2的主要進化步驟,并指出需要采取相應的重大公共衛(wèi)生干預措施。此外,世衛(wèi)組織今后用希臘字母為需要關注的變異株命名,而不再對需要留意的變異株指定希臘字母名稱。做出這些調整后,阿爾法、貝塔、伽馬、德爾塔以及奧密克戎親本譜系B.1.1.529被視為以前傳播的需要關注的變異株。世衛(wèi)組織現(xiàn)將XBB.1.5定為需要留意的變異株。世衛(wèi)組織還將繼續(xù)定期發(fā)布對需要留意的變異株和需要關注的變異株的風險評估(見關于XBB.1.5的最新風險評估)。世衛(wèi)組織強調,這些變化并不意味著奧密克戎病毒的傳播不再構成公共衛(wèi)生威脅。做出這些調整是為了在當前流行的奧密克戎病毒構成的威脅之外,更好地識別其他威脅或新的威脅。與此同時,我國最近流感的流行態(tài)勢也呈高位運行也需要密切關注留意,3月20日中國疾控中心病毒病所國家流感中心主任王大燕表示,此次流感3月中旬已經進入高峰期,雖然目前整體仍處于高位,但有部分省份流感活動高峰已經出現(xiàn)拐點,開始下降。此次流感活動水平在2023年2月初開始升高,2月底后上升趨勢明顯,到3月中旬已經進入高峰期。雖然目前整體仍處于高位,但已經監(jiān)測到有幾個省份流感活動高峰已經出現(xiàn)拐點,開始下降。今年較往年約晚2個月進入流感流行季,本次流行的流感病毒以甲型H1N1亞型流感病毒為主,其次為甲型H3N2亞型流感病毒。

綜合:中新社、中國疾控中心、世界衛(wèi)生組織

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