最適合生信專業(yè)的筆記軟件(20211227更新)


年紀(jì)大了,反應(yīng)也慢了,碼代碼都碼的慢了。
曾經(jīng)在游戲世界中叱咤風(fēng)云被人膜拜的大佬,現(xiàn)在變成只會(huì)賣萌扣1抱大腿的咸魚。
所以,需要在自己還能碼的時(shí)候,盡可能多的把經(jīng)驗(yàn)和代碼記下來。
那么第一個(gè)問題就是:我記啥?
我把有記錄需求的幾點(diǎn)列在下面,之后分類推薦軟件(主要為開源的軟件)
知識(shí)類筆記:個(gè)人經(jīng)驗(yàn),代碼等
實(shí)驗(yàn)記錄筆記:日常記錄,Todo list,項(xiàng)目規(guī)劃等
合作類筆記:需要多個(gè)人一起做的項(xiàng)目相互交流
文獻(xiàn)筆記:看文獻(xiàn)的idea,關(guān)鍵信息等
第二個(gè)問題,什么樣的筆記本軟件是好的軟件,我覺得:
記錄方便,使用簡單,不折騰(科研不易,筆記上不折磨自己)
查找方便(這也是為什么最好不用紙質(zhì)的實(shí)驗(yàn)筆記的原因)
簡單、美觀得記錄文字、圖片、代碼、公式 (markdown說,干脆你報(bào)我身份證號算了)
多設(shè)備多終端能用,支持多種云同步
版本管理,易于查找歷史記錄以及版本退回
易于導(dǎo)入導(dǎo)出,
這種軟件真有嗎?好像還真的有
由于新軟件不斷產(chǎn)生,老牌軟件有可能會(huì)被替代,所以本博客不斷更新。我先把我目前在用的軟件寫在前面:
20211227更新
????????????????知識(shí)類、試驗(yàn)記錄:Joplin
????????????????合作類筆記:Notion
????????????????文獻(xiàn)筆記:Zotero
接下來是各種筆記軟件的介紹

Joplin (知識(shí)類和工作類筆記)

推薦指數(shù):?????
????剛發(fā)現(xiàn)的寶藏軟件,滿足我全部需求。
特點(diǎn):
所有數(shù)據(jù)全部本地,可以配置云盤和WebDAV同步,外加版本控制
markdown記錄代碼,文本,圖片,公式
支持加密,區(qū)域搜索和全局搜索
支持導(dǎo)入markdown和evernote筆記,導(dǎo)出markdown,pdf,html
如果用官方cloud就可以分享、協(xié)作記筆記(沒測試過)
目前發(fā)現(xiàn)的缺點(diǎn):
沒有圖床,圖全部存本地(也就是云盤)
VScode (全能IDE)

推薦指數(shù):?????
我的上一個(gè)筆記軟件。其實(shí)vscode不能叫筆記軟件了,應(yīng)該叫編輯器或者IDE。vscode作為IDE太全能了,不僅寫python,做前端好用,裝上插件markdown也是一把好手。并且新版本網(wǎng)頁端的vscode隨時(shí)編輯github博客確實(shí)很給力。本地云盤建個(gè)文件夾
特點(diǎn):
裝上插件就是全能IDE。markdown,圖床,導(dǎo)出,git,正則表達(dá)式搜索啥都有
可能的缺點(diǎn):
我感覺markdown渲染速度有點(diǎn)慢
Zotero (強(qiáng)大的開源文獻(xiàn)管理)

推薦指數(shù):?????
用過Endnote, Mendeley,最后還是用上了Zotero。功能強(qiáng)大,開源,多插件可用??梢宰詣?dòng)提取pdf中高亮的注釋,可分類,可做筆記。
優(yōu)點(diǎn):
開源
文獻(xiàn)管理,文獻(xiàn)插入,格式排版
高亮注釋提取,文獻(xiàn)筆記,標(biāo)簽分類,還有一點(diǎn)?
可能的缺點(diǎn):
官方同步空間太貴,通常我用網(wǎng)盤同步,偶爾會(huì)有沖突
上手會(huì)麻煩一點(diǎn),插件配置好就完美了
Typora?(開源的文獻(xiàn)管理)

推薦指數(shù):????
極簡的markdown筆記編輯器,我寫博客偶爾會(huì)用,應(yīng)該是不分屏的markdown編輯器中體驗(yàn)最好的吧。最新更新了付費(fèi)版本,買斷付費(fèi),不過同時(shí)支持免費(fèi)版的下載。
優(yōu)點(diǎn):
完美的markdown筆記體驗(yàn),極簡好用
支持添加圖床,全局搜索等
可能的缺點(diǎn):
只能全局搜索,沒有版本控制
Notion (網(wǎng)紅的筆記軟件)

推薦指數(shù):????
除了付費(fèi)買空間,國內(nèi)需要配置DNS或者科學(xué)上網(wǎng)之外,是個(gè)很不錯(cuò)的筆記軟件。尤其是分享合作,插入表格、數(shù)據(jù)庫都很好用。我用主要是老板買了團(tuán)隊(duì)版=-=
優(yōu)點(diǎn):
除了markdown,多人協(xié)作、圖表展示以及統(tǒng)計(jì)運(yùn)算,數(shù)據(jù)庫查詢都包含其中。
可能的缺點(diǎn):
需要付費(fèi),國內(nèi)不太容易同步,內(nèi)容存在notion服務(wù)器等。
其他我還用過,后續(xù)會(huì)補(bǔ)充:
Zettlr?推薦指數(shù):????
有道云筆記?推薦指數(shù):???
印象筆記?推薦指數(shù):???
如果你有好的筆記軟件可以通過留言推薦給我,我比較喜歡折騰~