肽質(zhì)量指紋圖譜(peptide mass fingerprinting, PMF)(又稱蛋白質(zhì)指紋)是一種蛋白質(zhì)鑒定的分析技術(shù)，通過將未知的感興趣的蛋白質(zhì)首先裂解成更小的肽，使用MALDI-TOF或ESI-TOF等質(zhì)譜儀對其絕對質(zhì)量進(jìn)行精確測量的一種分析方法。百泰派克生物科技提供基于肽指紋圖譜PMF的蛋白質(zhì)組質(zhì)譜鑒定服務(wù)。

蛋白質(zhì)組質(zhì)譜鑒定PMF

基于肽質(zhì)量指紋圖譜PMF的蛋白質(zhì)質(zhì)譜鑒定首先將未知的目標(biāo)蛋白質(zhì)裂解為較小的肽段，之后使用質(zhì)譜儀（如MALDI-TOF或ESI-TOF）準(zhǔn)確測量這些肽段的絕對質(zhì)量，將肽段質(zhì)量與包含理論蛋白質(zhì)序列甚至基因組的數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比較，從而實(shí)現(xiàn)目標(biāo)蛋白質(zhì)的鑒定。其中，數(shù)據(jù)庫比對使用生物信息學(xué)的方法實(shí)現(xiàn)，計(jì)算機(jī)程序?qū)⒂袡C(jī)體的已知基因組翻譯成蛋白質(zhì)，從理論上將其切成肽段并計(jì)算出肽段的絕對質(zhì)量，然后將測得的未知蛋白質(zhì)的肽段質(zhì)量與基因組中編碼的每種蛋白質(zhì)的理論肽段質(zhì)量進(jìn)行比較，對結(jié)果進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析后返回可能匹配項(xiàng)的方式，實(shí)現(xiàn)蛋白質(zhì)的質(zhì)譜鑒定。PMF技術(shù)僅需少數(shù)肽段質(zhì)量就能準(zhǔn)確鑒定出一個(gè)蛋白質(zhì)，與傳統(tǒng)技術(shù)比具有速度快、通量高等優(yōu)點(diǎn)，因此可應(yīng)用于蛋白質(zhì)組的質(zhì)譜鑒定。

PMF優(yōu)缺點(diǎn)

基于肽質(zhì)量指紋圖譜PMF的蛋白質(zhì)質(zhì)譜鑒定的優(yōu)點(diǎn)是僅須知道肽的質(zhì)量，不需要耗時(shí)的進(jìn)行從頭測序。缺點(diǎn)是目標(biāo)蛋白質(zhì)需要有理論數(shù)據(jù)庫。因此，肽質(zhì)量指紋圖譜PMF法最適用于已經(jīng)獲得基因組序列、cDNA序列或蛋白質(zhì)序列，特別是已經(jīng)完成全基因組測序的樣品鑒定。