“計算機(jī)輔助藥物設(shè)計及分子動力學(xué)技術(shù)與應(yīng)用實踐”系列專題
近年來,利用高性能計算機(jī)來進(jìn)行藥物虛擬篩選已經(jīng)被廣泛應(yīng)用,計算機(jī)輔助藥物設(shè)計可以提高藥物研發(fā)的成功率,降低研發(fā)成本,縮短研發(fā)周期,是目前創(chuàng)新藥物研究的核心技術(shù)之一。隨著醫(yī)藥大數(shù)據(jù)的積累和人工智能技術(shù)的發(fā)展,運用AI技術(shù)并結(jié)合大數(shù)據(jù)的精準(zhǔn)藥物設(shè)計也不斷推動著創(chuàng)新藥物的發(fā)展。在新型冠狀病毒的治療方案中,通過一系列計算機(jī)輔助藥物生物計算的方法發(fā)現(xiàn)一大類藥物分子可以有效阻止新冠病毒的侵染,為治療新冠提供了新思路。
分子動力學(xué)模擬是分子模擬中最接近實驗條件的模擬方法,能夠從原子層面給出體系的微觀演變過程,直觀的展示實驗現(xiàn)象發(fā)生的機(jī)理與規(guī)律,促使我們的研究向著更高效、更經(jīng)濟(jì)、更有預(yù)見性的方向發(fā)展。分子動力學(xué)可以解決和研究DNA的折疊和性質(zhì)、蛋白與配體的識別機(jī)制、跨膜蛋白的工作機(jī)理、蛋白酶與底物的反應(yīng)、蛋白與蛋白的耦合、比較野生型與突變蛋白的不同特性、蛋白折疊的機(jī)制問題(控制溫度,使蛋白自行折疊和去折疊)等。





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