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（56線程，256G內(nèi)存，個(gè)人存儲(chǔ)1T）

BWA (Burrows-Wheeler Aligner)是一個(gè)用于DNA序列比對(duì)的快速、高效、可擴(kuò)展的軟件工具。

它采用了一種基于Burrows-Wheeler Transform (BWT)的算法，可以將長(zhǎng)度為幾GB的序列數(shù)據(jù)集與參考序列進(jìn)行比對(duì)。BWA的比對(duì)速度和準(zhǔn)確性都非常高，被廣泛應(yīng)用于基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、表觀遺傳學(xué)等領(lǐng)域的研究中。

BWA的主要特點(diǎn)包括：

1. 高效快速：BWA采用了BWT算法和一些優(yōu)化策略，可以在較短的時(shí)間內(nèi)完成大規(guī)模的比對(duì)任務(wù)。

2. 準(zhǔn)確性高：BWA采用了一些質(zhì)量控制策略，如配對(duì)信息、序列長(zhǎng)度等，可以提高比對(duì)的準(zhǔn)確性。

3. 多功能：BWA支持不同類型的序列比對(duì)，包括單端比對(duì)、雙端比對(duì)、重測(cè)序、局部比對(duì)等。

4. 可擴(kuò)展性強(qiáng)：BWA可以處理多個(gè)比對(duì)任務(wù)，支持多線程和分布式計(jì)算，能夠高效地處理大規(guī)模的數(shù)據(jù)集。

了解這么多之后我們開始吧!還記得小果之前帶大家做過(guò)fastqc質(zhì)控的數(shù)據(jù)嗎，我們剛好繼續(xù)往下做。

看一下結(jié)果：

怎么樣，你學(xué)會(huì)了嗎！

好啦，今天的內(nèi)容暫時(shí)就到這里了，我們下期繼續(xù)！

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