單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組與空間轉(zhuǎn)錄組的融合，已經(jīng)在科研界燃起熊熊烈火，成為科研新寵。來和中科新生命一起為這組學(xué)融合的科研之火加薪吧。

為了回饋廣大客戶的信任與關(guān)注，特推出金秋鉅惠活動(dòng)，即：

空間轉(zhuǎn)錄組+單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組聯(lián)合，

3.5W起;

參與本次活動(dòng)可贈(zèng)送組織解離+包埋組織塊切片+質(zhì)檢+HE染色+超高清圖像掃描~

這就完了？no~no~no~

參與本次活動(dòng)的客戶再贈(zèng)送單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組標(biāo)準(zhǔn)分析+空間轉(zhuǎn)錄組標(biāo)準(zhǔn)分析+兩組學(xué)聯(lián)合分析~

最后的最后

中科新生命將開通極速周期，即單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)15個(gè)工作日交付，為您的科研之旅開通最高效便捷的綠色通道。

那么單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組和空間轉(zhuǎn)錄組聯(lián)合到底是如何解決科學(xué)問題的呢？小編今天來做個(gè)簡(jiǎn)述~

為什么要聯(lián)合？

單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組（scRNA-seq）技術(shù)目前在解開單個(gè)細(xì)胞內(nèi)mRNA異質(zhì)性和復(fù)雜性，揭示組織/器官/有機(jī)體中不同細(xì)胞組成和功能，但組織在解離過程丟失了空間維度信息?？臻g轉(zhuǎn)錄組技術(shù)則充分展示空間維度的異質(zhì)性，但無法達(dá)到單細(xì)胞精度。那么，雙劍合璧，空間轉(zhuǎn)錄宛如高通量的免疫熒光，可以發(fā)掘單細(xì)胞的空間定位、驗(yàn)證關(guān)鍵marker的準(zhǔn)確性，觀察空間互作、原位切片的特點(diǎn)等。兩者技術(shù)互補(bǔ)，可更好的探索生命機(jī)理及組織異質(zhì)性和腫瘤微環(huán)境(TEM)的復(fù)雜相互作用，達(dá)到更上一層樓的效果。

如何聯(lián)合？

這篇綜述文章（IF 42.7）回顧總結(jié)了單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組與空間組學(xué)技術(shù)聯(lián)合分析方法。目前的整合方法大體可以分成兩種主要方法，即反卷積（deconvolution）和映射（mapping）。反卷積旨在根據(jù)單細(xì)胞數(shù)據(jù)，從單個(gè)ST spot中轉(zhuǎn)錄的mRNA混合物分離出離散的細(xì)胞亞型。映射的基本思路是以單細(xì)胞分辨率創(chuàng)建空間分辨率的細(xì)胞類型映射，即基于scRNA的細(xì)胞亞型定位到HPRI圖譜上的每個(gè)細(xì)胞和將每個(gè)scRNA-seq細(xì)胞定位到組織的特定生態(tài)位或區(qū)域。

聯(lián)合后應(yīng)用領(lǐng)域有哪些？

應(yīng)用案例

生長(zhǎng)發(fā)育

這篇文章（IF 64.8）通過單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序繪制了人類HSC 從動(dòng)脈造血內(nèi)皮細(xì)胞產(chǎn)生的全過程，并結(jié)合空間轉(zhuǎn)錄組動(dòng)態(tài)展示了主動(dòng)脈內(nèi)造血群（Intra-Aortic Haematopoietic Clusters, IAHCs）中HSC的產(chǎn)生，驗(yàn)證了從人類多能干細(xì)胞中產(chǎn)生的主動(dòng)脈-性腺-中腎樣決定性造血干細(xì)胞和祖細(xì)胞，并為促進(jìn)其向功能性造血干細(xì)胞的成熟提供了指導(dǎo)。

應(yīng)用案例

預(yù)測(cè)生存和靶向治療反應(yīng)

這篇文章（IF16.6）通過單細(xì)胞和空間轉(zhuǎn)錄組的聯(lián)合，描述和揭示腫瘤核心(TC)和腫瘤邊緣(LE)之間獨(dú)特的基因表達(dá)空間模式，幫助更好地了解癌癥侵襲和轉(zhuǎn)移的保守特征，并指導(dǎo)后續(xù)針對(duì)LE癌癥治療工作，時(shí)空機(jī)制見解將有助于指導(dǎo)口腔鱗狀細(xì)胞癌(Oral squamous cell carcinoma, OSCC)及其他領(lǐng)域改進(jìn)靶向治療的發(fā)展。

應(yīng)用案例

肺癌腦轉(zhuǎn)移的致病機(jī)制

本文（IF16.6）通過單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組和空間轉(zhuǎn)錄組的聯(lián)合，揭示了腦轉(zhuǎn)移（BrMs）的分子和細(xì)胞基礎(chǔ)，描繪了用腫瘤核心、腫瘤免疫微環(huán)境（TIME）和腫瘤腦微環(huán)境（TBME）的形態(tài)學(xué)標(biāo)志物解析癌細(xì)胞轉(zhuǎn)移的整個(gè)轉(zhuǎn)錄組圖譜，為理解肺癌腦轉(zhuǎn)移的空間和功能異質(zhì)性提供了一個(gè)系統(tǒng)框架，利于今后對(duì)NSCLC和BrMs的研究，為癌細(xì)胞轉(zhuǎn)移機(jī)制和治療方法研究帶來思路和便利。

應(yīng)用案例

腫瘤微環(huán)境

這篇文章（IF 46.9）通過單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組和空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)的聯(lián)合，揭示了原發(fā)性胰腺腫瘤中的導(dǎo)管細(xì)胞、巨噬細(xì)胞、樹突狀細(xì)胞和癌細(xì)胞亞群具有空間上有限的富集，并且與其他細(xì)胞類型具有明顯的富集。繪制scRNA -seq定義的亞群結(jié)構(gòu)可用于揭示復(fù)雜組織固有的相互作用，通過免疫熒光與組織切片H&E染色實(shí)驗(yàn)證明了癌癥成纖維細(xì)胞和表達(dá)應(yīng)激反應(yīng)基因模塊的癌細(xì)胞存在共定位關(guān)系，表明它們之間的功能相關(guān)性。此外，確定了表達(dá)應(yīng)激反應(yīng)基因模塊的炎性成纖維細(xì)胞和癌細(xì)胞的共定位，將來可能具有預(yù)后價(jià)值。

應(yīng)用案例

腫瘤免疫

本文（IF 64.5）整合單細(xì)胞RNA測(cè)序、空間轉(zhuǎn)錄組和多路離子束成像繪制了人類鱗狀細(xì)胞癌組成和空間結(jié)構(gòu)的多模式圖譜，發(fā)現(xiàn)了一個(gè)定位于腫瘤前沿的腫瘤特異性角化細(xì)胞（TSKs）。TSK在腫瘤微環(huán)境的機(jī)制探索，體內(nèi)CRISPR篩選確定的腫瘤亞群致瘤基因網(wǎng)絡(luò)，為腫瘤和免疫動(dòng)力學(xué)研究提供了極大支持。

這些僅僅是單細(xì)胞和空間組學(xué)聯(lián)合應(yīng)用前景中的冰山一角，單細(xì)胞和空間組學(xué)的聯(lián)合必將成為科學(xué)家們探索器官結(jié)構(gòu)、疾病機(jī)理、個(gè)體發(fā)育、生命演化、腫瘤研究及神經(jīng)類研究等的底層工具。