不同種類的PCR探針如何工作-雙雜交探針
在雙雜交探針中,沒有猝滅劑。 相反,有兩種寡核苷酸,一種攜帶供體熒光團(tuán),另一種攜帶受體熒光團(tuán)。
供體熒光團(tuán):一種被特定波長(zhǎng)激發(fā)的染料。 這種染料將其能量貢獻(xiàn)給受體熒光團(tuán)。
受體熒光團(tuán):受體熒光團(tuán)是一種染料,它從另一個(gè)熒光團(tuán)(供體熒光團(tuán))接收能量,并利用該能量,受體熒光團(tuán)發(fā)出熒光。 供體和受體熒光團(tuán)都必須接近才能發(fā)生這種情況。
圖 1. 雙雜交探針在供體和受體熒光團(tuán)的基礎(chǔ)上工作,而不是淬滅報(bào)告基因。
雙雜交探針如何工作?
兩個(gè)寡核苷酸,每個(gè)攜帶一個(gè)熒光團(tuán),用于雙重雜交。
這些寡核苷酸及其熒光團(tuán)接近目標(biāo)序列。 我們可以說目標(biāo)互補(bǔ)序列的一部分在供體中,另一部分在受體熒光團(tuán)中。
然后,發(fā)生稱為熒光共振能量轉(zhuǎn)移(或 FRET)的過程。 FRET 是一種依賴于距離的物理過程,它通過偶極-偶極耦合過程將能量從激發(fā)的分子(或供體熒光團(tuán))轉(zhuǎn)移到另一個(gè)分子(受體熒光團(tuán))。
在這里,供體熒光團(tuán)被激發(fā)并將其能量轉(zhuǎn)移到受體熒光團(tuán),使其發(fā)出熒光。 供體與目標(biāo)序列結(jié)合,當(dāng)它靠近受體時(shí),它會(huì)轉(zhuǎn)移能量,使受體熒光團(tuán)發(fā)出熒光。
圖2. 雙雜交探針需要供體和受體熒光團(tuán)。 兩個(gè)探頭必須彼此緊密接觸。 這種接近允許電子從供體轉(zhuǎn)移到熒光團(tuán),然后受體發(fā)出熒光。
該探針的優(yōu)點(diǎn)是對(duì)目標(biāo)序列具有特異性。 缺點(diǎn)是供體和受體熒光團(tuán)的寡核苷酸序列設(shè)計(jì)復(fù)雜。