每一種生物都有自己的基因組。不同生物的基因組從結(jié)構(gòu)、大小到所攜帶的遺傳信息量都有很大區(qū)別?；蚪M決定著一種生物個(gè)體的全部遺傳性狀。

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一種生物基因組的DNA含量是恒定的，該含量值稱為C值（C-value，constant）。C值既可用質(zhì)量（單位pg）表示，也可用長(zhǎng)度（單位bp）表示。C值大小反映了基因組的大小。

不同物種的C值差異極大，隨著生物的進(jìn)化，生物體的結(jié)構(gòu)和功能越來越復(fù)雜，所需基因產(chǎn)物的種類越來越多，因而所需的基因越來越多，其C值也越來越大；生物界每個(gè)門的最小C值與其個(gè)體形態(tài)復(fù)雜程度大致呈正相關(guān)。

例如，在病毒和植物界的各類種群中，C值的變化與進(jìn)化程度一致，其由低到高的順序?yàn)椋翰《尽?xì)菌→真菌→綠藻→苔蘚→蕨類→種子植物。

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然而，物種的C值與其遺傳和形態(tài)復(fù)雜程度之間并無嚴(yán)格的對(duì)應(yīng)關(guān)系，這種現(xiàn)象稱為C值矛盾（C-value enigma）、C值悖理（C-value paradox）。C值矛盾體現(xiàn)在以下幾方面。

1.真核生物基因組C值遠(yuǎn)超過其編碼蛋白質(zhì)所需的DNA量。例如，人類基因組C值為3.5pg，據(jù)推算，其基因組可容納40萬～60萬個(gè)基因，但目前認(rèn)為人類基因組只有不到2.5萬個(gè)基因。

2.結(jié)構(gòu)、功能相似的同類生物，甚至親緣關(guān)系很近的生物，它們的C值可能相差數(shù)十倍甚至上百倍。例如，同是兩棲動(dòng)物，C值可以小到1pg以下，也可以大到100pg。

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3.進(jìn)化程度高的生物C值未必大。例如，C值最大的動(dòng)物是一種埃塞俄比亞肺魚（P.aethiopicus）（132.8pg），遠(yuǎn)大于人類的C值（3.5pg），但顯然人類的結(jié)構(gòu)、功能比肺魚更復(fù)雜，進(jìn)化程度更高。

4.C值大的生物基因未必多。

對(duì)于真核生物基因組C值矛盾現(xiàn)象，目前的解釋是真核生物的DNA序列大部分為非編碼序列，特別是重復(fù)序列。例如，人類基因組DNA中只有不到2%為編碼序列，其余都是非編碼序列，其中很多序列的功能尚未闡明。此外，轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的選擇性剪接也是哺乳動(dòng)物復(fù)雜性的遺傳基礎(chǔ)，而不是簡(jiǎn)單地依靠基因組DNA含量的增大。

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