干貨分享|高通量測(cè)序原始數(shù)據(jù)上傳教程
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Aspera 插件? 下載網(wǎng)址 ： https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/sra_sub/sub.cgi
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NCBI注冊(cè)? 網(wǎng)址：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/account/
申請(qǐng)BioProject? 網(wǎng)址：https://submit.ncbi.nlm.nih.gov/subs/bioproject/
申請(qǐng)BioSample? 網(wǎng)址：https://submit.ncbi.nlm.nih.gov/subs/biosample/
上傳SRA? 網(wǎng)址：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/sra_sub/sub.cgi
數(shù)據(jù)整體上傳的流程圖如下：
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打開(kāi) NCBI，點(diǎn)擊右上角的“Log in”，如下圖：
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很多同學(xué)現(xiàn)在打開(kāi)NCBI想注冊(cè)/登錄的時(shí)候，會(huì)發(fā)現(xiàn)如下提示：強(qiáng)制性使用第三方進(jìn)行注冊(cè)/登錄。
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繼續(xù)往下看就能找到解決辦法，NCBI支持用各種第三方賬戶：
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根據(jù)經(jīng)驗(yàn)，ORCID賬號(hào)和Microsoft注冊(cè)起來(lái)都很方便，只需要個(gè)人郵箱并按要求填寫(xiě)信息后，點(diǎn)擊“Continue”完成注冊(cè)。
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SRA簡(jiǎn)介：SRA(Sequence Read Archieve)數(shù)據(jù)庫(kù)是NCBI搭建的存放原始測(cè)序數(shù)據(jù)的平臺(tái)。SRA能兼容不同測(cè)序平臺(tái)的數(shù)據(jù)，比如Sanger測(cè)序、Illumina測(cè)序、PacBio測(cè)序等，所以無(wú)論是基因組、重測(cè)序、轉(zhuǎn)錄組、微生物擴(kuò)增子，還是宏基因組等組學(xué)分析，都可以將原始數(shù)據(jù)上傳SRA。
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