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腫瘤領(lǐng)域單細(xì)胞多組學(xué)大盤點之消化系統(tǒng)腫瘤領(lǐng)域合集!

2022-08-30 08:39 作者:上海歐易生物  | 我要投稿

截至2022年8月,歐易生物單細(xì)胞事業(yè)部在腫瘤領(lǐng)域合作的研究碩果累累,助力客戶發(fā)表31篇腫瘤領(lǐng)域單細(xì)胞文章,平均IF達(dá)12.62。

今天,小編帶著大家一起回顧7篇歐易單細(xì)胞消化系統(tǒng)腫瘤領(lǐng)域的客戶文章吧~


基于成像質(zhì)譜技術(shù)的肝癌微環(huán)境拓?fù)浞治鼋沂玖瞬煌瑐€體發(fā)育的巨噬細(xì)胞對細(xì)胞鄰域的反向調(diào)節(jié)

Topological analysis of hepatocellular carcinoma tumour microenvironment based on imaging mass cytometry reveals cellular neighbourhood regulated reversely by macrophages with different ontogeny

發(fā)表期刊:Gut

影響因子:31.793

DOI: 10.1136/gutjnl-2021-324339

文章概述:肝細(xì)胞癌 (HCC) 腫瘤微環(huán)境 (TME) 是高度復(fù)雜的,具有組織成各種功能單元、細(xì)胞鄰域 (CN) 的多種細(xì)胞成分。該研究結(jié)果揭示了肝細(xì)胞癌腫瘤微環(huán)境的各種拓?fù)涔δ軉卧蔡峁┝舜蟮母渭?xì)胞癌病理景觀庫。這項工作突出了特異性靶向Kupffer細(xì)胞而不是阻斷髓樣細(xì)胞整體作為肝細(xì)胞癌治療的新型免疫療法的潛力。


異源Vδ2 γδ T細(xì)胞可作為肝細(xì)胞癌浸潤γδ T細(xì)胞功能缺陷的補(bǔ)充

Hepatocellular carcinoma-infiltrating γδ T cells are functionally defected and allogenic Vδ2 γδ T cell can be a promising complement

發(fā)表期刊:Clinical and Translational Medicine

影響因子:8.554

DOI: 10.1002/ctm2.800

材料:HCC患者和健康人肝灌洗液

文章概述:該研究通過比較肝細(xì)胞癌(HCC)患者和健康人肝灌洗液中的γδ T細(xì)胞,發(fā)現(xiàn)HCC患者中具有一群獨特的γδ T亞群,進(jìn)一步針對該亞群進(jìn)行功能富集分析、擬時序分析、細(xì)胞周期等分析,發(fā)現(xiàn)該亞群LAG3耗竭標(biāo)記基因以及谷氨酰胺等相關(guān)代謝通路顯著上調(diào),細(xì)胞增殖等相關(guān)通路下調(diào),細(xì)胞周期停滯在G2/M期。此外,該亞群TCR多樣性與克隆型相比健康對照組HCC組明顯丟失。研究為未來HCC免疫治療提供重要的參考。


單細(xì)胞RNA測序結(jié)合多組學(xué)解析肝內(nèi)膽管癌的分子亞群

Molecular Subgroups of Intrahepatic Cholangiocarcinoma Discovered by Single-Cell RNA Sequencing–Assisted Multiomics Analysis?

發(fā)表期刊:Cancer Immunology Research

影響因子:12.020

DOI: 10.1158/2326-6066.CIR-21-1101

材料:3例ICC樣本

文章概述:肝內(nèi)膽管癌(ICC)是一種相對罕見但高度侵襲性的腫瘤類型,對化療和免疫治療反應(yīng)較差。ICC全面的分子表征對開發(fā)新療法至關(guān)重要。研究通過蛋白質(zhì)組學(xué)特征獲得了新的ICC腫瘤亞型,并揭示了亞型與預(yù)后的關(guān)聯(lián)。

單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序鑒定出一個APOE+C1QB+巨噬細(xì)胞亞型,該亞型表現(xiàn)出重塑慢性炎癥亞型的能力,并導(dǎo)致ICC的不良預(yù)后。此外,研究驗證了APOE+C1QB+腫瘤相關(guān)巨噬細(xì)胞可作為潛在的免疫治療靶點。


單細(xì)胞測序助力解析食管鱗狀細(xì)胞癌分子圖譜特征

Dissecting the single-cell transcriptome network underlying esophagus non-malignant tissues and esophageal squamous cell carcinoma

發(fā)表期刊:EbioMedicine

影響因子:11.205

DOI: 10.1016/j.ebiom.2021.103459

材料:5個腫瘤組織和5個配對正常組織

文章概述:食管鱗狀細(xì)胞癌(ESCC)是癌癥中惡性和致命的癌癥之一,盡管其治療方面有一定進(jìn)展,但總體預(yù)后的效果仍普遍較差。這種情況的產(chǎn)生與ESCC的高度異質(zhì)性和腫瘤微環(huán)境(TME)密切有關(guān)。該研究通過GSVA、擬時序和細(xì)胞通訊等分析及實驗驗證證明了在ESCC腫瘤微環(huán)境中多種細(xì)胞存在的廣泛的重編程過程。這些發(fā)現(xiàn)為對ESCC腫瘤微環(huán)境和異質(zhì)性的研究提供了新的參考,并為未來的臨床治療提供了新的潛在治療靶點。


單細(xì)胞測序助力解析新輔助化療手段——紫杉醇+順鉑與單純手術(shù)治療在食管鱗狀細(xì)胞癌中的腫瘤微環(huán)境差異

Dissecting the single-cell transcriptome network in patients with esophageal squamous cell carcinoma receiving operative paclitaxel plus platinum chemotherapy

發(fā)表期刊:Oncogenesis

影響因子:6.524

DOI: 10.1038/s41389-021-00359-2

材料:5例單純手術(shù)治療腫瘤組織、5例新輔助治療腫瘤組織

文章概述:食管鱗狀細(xì)胞癌 (ESCC) 占全世界食管癌病例的90%。雖然新輔助化療 (NACT-ESCC) 提高了ESCC患者的生存率,但患者的5年生存率仍然較低。該研究通過對ESCC患者術(shù)前是否接受NACT治療的單細(xì)胞數(shù)據(jù)進(jìn)行比較分析,全面研究了NACT-ESCC和SA-ESCC來源的上皮細(xì)胞、基質(zhì)細(xì)胞、免疫細(xì)胞的異質(zhì)性,并探討了是否接受NACT治療的腫瘤微環(huán)境異質(zhì)性,發(fā)現(xiàn)不同治療手段細(xì)胞組成的多樣性及分子復(fù)雜性,并提出了ESCC治療的新靶點,為未來ESCC的治療提供重要的參考。


單細(xì)胞和空間轉(zhuǎn)錄組分析揭示了FAP成纖維細(xì)胞和SPP1巨噬細(xì)胞在結(jié)直腸癌中的相互作用

Single-cell? and? spatial? analysis? reveal? interaction?of? FAP fibroblasts? and? SPP1macrophages? in? colorectal? cancer

發(fā)表期刊:Nature Communications

影響因子:17.694

DOI: 10.1038/s41467-022-29366-6

材料:5例非轉(zhuǎn)移性結(jié)直腸癌(結(jié)腸腺癌,n = 2;直腸癌,n = 3)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序;4例結(jié)直腸癌空間轉(zhuǎn)錄組測序

文章概述:結(jié)直腸癌(CRC)是常見的惡性腫瘤之一,除手術(shù)外,現(xiàn)有治療手段有限。該研究闡明了CRC中腫瘤細(xì)胞類型的潛在來源和調(diào)控,發(fā)現(xiàn)腫瘤特異性FAP成纖維細(xì)胞和SPP1巨噬細(xì)胞相互作用,刺激免疫排斥的結(jié)締組織形成,限制T細(xì)胞浸潤。該研究提供了一種潛在的治療策略,即通過破壞FAP成纖維細(xì)胞和SPP1巨噬細(xì)胞的相互作用來改善免疫治療。


一種新的人膽囊癌細(xì)胞系ZJU-0430的特性研究

Characteristics of a novel cell line ZJU-0430 established from human gallbladder carcinoma

發(fā)表期刊:Cancer cell international

影響因子:6.429

DOI: 10.1186/s12935-019-0911-1

材料:ZJU-0430細(xì)胞系

文章概述:膽囊癌(GBC)是膽道常見的惡性腫瘤,占80% - 95%。該研究成功建立了一種名為ZJU-0430的人類GBC細(xì)胞系,有助于研究GBC的發(fā)病機(jī)制以及早期診斷工具和靶向治療。單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序表明,ZJU-0430主要由具有干性特征的細(xì)胞組成,異質(zhì)性不大。該研究證實了ZJU-0430細(xì)胞作為膽囊癌典型模型的潛在應(yīng)用價值,為膽囊癌發(fā)病機(jī)制的體內(nèi)外研究和新的治療方法的開發(fā)提供了依據(jù)。

【未完待續(xù)】

31篇腫瘤領(lǐng)域單細(xì)胞客戶文章持續(xù)更新中··· ···

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