按時間正序劇情，方禮信小時候時常被家暴導致心底邪念滋生，十幾歲弒母，偷車撞死親哥。九年前開始殘殺30名女性犯下屠夫案，在虐待陳儀時收到總部電話，不得已只能先綁了陳儀，等待回來繼續(xù)行兇，不料陳儀自己逃生，方禮信將計就計誘導陳儀，將屠夫案嫁禍給輕微智障的佘強，歐陽劍嫉惡如仇當場射殺佘強，而佘強的女兒是楊麗。五年前搶劫大發(fā)財務，為啟動“神探”組織做資金。方禮信又搞起栽贓嫁禍，犯下魔警案，他劫持秦志濤到小巷口，持槍打死兩個巡警，以小白鞋、搶劫大發(fā)財務的手槍為線索栽贓嫁禍成功，秦志濤的兒子是齊家柱。

隨后的警方發(fā)布會上，黃欣作秀演講，李俊開車拷著胳膊上刺有仇恨二字的女兒行駛在路上，隨后李俊入場大鬧一場為秦志濤申冤，但口空無憑，又舉槍還原魔警案發(fā)現(xiàn)場，同時大喊歐陽劍查案有問題，關鍵時刻又是歐陽劍嫉惡如仇的開槍射傷李俊，李俊被診斷妄想癥，被關進精神病院五年，他女兒看見他被帶走默默離開。

時間回到當前，李俊已經(jīng)被放出來，在天橋露天辦公室里寫滿字眼，全都是破解近年來100樁懸案的關鍵，只可惜無人欣賞。黑暗的世界中，李俊的破案秘籍早就被方禮信發(fā)現(xiàn)并加以利用，創(chuàng)建“神探”組織，尋找、拉攏、洗腦、訓練各種懸案中的遺孤。陳儀懷孕期間，“神探”組織開始作案復仇，第一件“燒尸案”，第二件“雨夜殺人魔”，第三件“義興三虎”案，“神探”組織在這起作案中被李俊帶警察追到，激烈交火后損兵折將6人，第四件“烹尸案”，此案中齊家柱，楊麗反水，歐陽劍被擒，第五件“屠夫案”，此案是終極大戰(zhàn)，因為“神探”組織馬上要被團滅了，所以這是最后一次行動。

此案中方禮信放出“伊恩結”鞋帶為線索，誘導李俊查到屠夫案當年藏尸窩，誘使李俊留下腳印，指紋，還有提前備好的十幾年前撿好的李俊的煙頭，完成栽贓嫁禍，李俊直呼方禮信的算計太過恐怖。這里有很多兄弟覺得是李俊的臆想，不認為方禮信會算計到十年前，但小編認為，不能拿咱們普通人的智商來衡量魔鬼的恐怖，這里邊的智商差距可能像咱們普通人年薪五萬與富豪年薪幾十億的差距一樣。最后李俊先與飛虎隊救出歐陽劍，并跟陳儀活到最后。

方禮信在殺敵李俊女兒又要殺死李俊的時候，上演反派死于話多的電影真理，被陳儀射擊引起汽油燃燒，被活活燒死了。最后的最后全劇懸疑高潮來了。結局的分析很多種，小編說說自己的見解，李俊最后看到一個怪物從死去的方禮信身上冒出，并射擊趕走，隨后問陳儀有沒有看到這只怪物，陳儀雖然沒有看到，但還是安慰李俊說看到了。李俊聽后露出了難以言表的欣慰的笑容。這個笑容是關鍵，小編認為這是李俊郁郁不得志幾十年后突然被理解的復雜感受。

怪物代表人心的邪惡，怪物一直都在，從一個人身上打跑，又附身到下一個邪惡的人身上。結局的李俊警局翻看案宗，玻璃上反射出的是方禮信，又結合李俊在警局一反常態(tài)的謙遜，很多人認為李俊黑化了。小編卻不這么認為，李俊的身上從始至終都有邪惡的一面，而且正是靠著邪惡的嗅覺才破解了無數(shù)的懸案，但他卻始終是善良正義的人格做主導。李俊一反常態(tài)的演講只是他過于珍惜重回警隊的機會，要知道這在現(xiàn)實中是不可能的，也只有他是電影主角才會有這待遇。

所以李俊是否黑化的關鍵在于他的善良正義一面占人格主導的源泉是什么，他的女兒只是給善良正義的人格增加了分量，但并不是源泉，“凝望深淵時，深淵也在凝望你”從他探案的時候已經(jīng)與黑暗相伴了，但黑暗面始終是他的破案工具，所以必定有某種未知的源泉一直在源源不斷的為他的正義人格輸送能量。而這個正義的源泉極有可能跟李俊小時候的原生家庭有關，那么神探大戰(zhàn)第二部的劇情也有了。