1996年，重慶市代管涪陵市、萬縣市和黔江地區(qū)

1997年，重慶市升格為直轄市、撤銷涪陵市和涪陵市下轄的枳城區(qū)和李渡區(qū)，合并設立重慶市涪陵區(qū)，轄縣劃歸重慶市直轄、撤銷萬縣市和萬縣市下轄的龍寶區(qū)、天城區(qū)和五橋區(qū)，合并設立重慶市萬縣區(qū)和龍寶管委會、天城管委會、五橋管委會以及萬縣移民開發(fā)區(qū)，萬縣市的城口縣和梁平縣劃歸重慶市直轄，開縣、忠縣、云陽縣、奉節(jié)縣、巫山縣和巫溪縣由萬縣移民開發(fā)區(qū)代管，撤銷黔江地區(qū)，設立黔江開發(fā)區(qū)，代管黔江、石柱、彭水、酉陽和秀山五個土家族苗族自治縣

1998年，重慶市萬縣區(qū)和萬縣移民開發(fā)區(qū)更名為重慶市萬州區(qū)和萬州移民開發(fā)區(qū)

2000年，撤銷萬州移民開發(fā)區(qū)，萬州移民開發(fā)區(qū)代管的開縣、忠縣、云陽縣、奉節(jié)縣、巫山縣和巫溪縣劃歸重慶市直轄，龍寶管委會、天城管委會和五橋管委會分別更名為龍寶移民開發(fā)區(qū)、天城移民開發(fā)區(qū)和五橋移民開發(fā)區(qū)，撤銷黔江開發(fā)區(qū)和黔江土家族苗族自治縣，設立重慶市黔江區(qū)，黔江開發(fā)區(qū)代管的石柱、彭水、酉陽和秀山四個土家族苗族自治縣劃歸重慶市直轄

2005年，撤銷龍寶移民開發(fā)區(qū)、天城移民開發(fā)區(qū)和五橋移民開發(fā)區(qū)，龍寶移民開發(fā)區(qū)、天城移民開發(fā)區(qū)和五橋移民開發(fā)區(qū)代管的街道、鎮(zhèn)和鄉(xiāng)劃歸重慶市萬州區(qū)直轄