揭開(kāi)PRM的神秘面紗:是否真正實(shí)現(xiàn)絕對(duì)定量?
平行反應(yīng)監(jiān)測(cè)(Parallel Reaction Monitoring,PRM)是質(zhì)譜分析中的一種方法,廣泛用于生物分子,特別是蛋白質(zhì)的定量分析。然而,關(guān)于PRM是否屬于絕對(duì)定量的問(wèn)題,往往會(huì)引發(fā)疑惑。那么,PRM真的是絕對(duì)定量的嗎?在這篇文章中,我們將詳細(xì)探討這個(gè)問(wèn)題。
1. 平行反應(yīng)監(jiān)測(cè)(PRM)簡(jiǎn)介
PRM是一種質(zhì)譜技術(shù),其在靶向蛋白質(zhì)分析中尤其有用。它利用了高分辨質(zhì)譜儀的精確度,通過(guò)選擇特定的前體離子(代表目標(biāo)蛋白質(zhì)的特異性肽段),并在碰撞細(xì)胞中對(duì)其進(jìn)行分解,然后監(jiān)測(cè)所有產(chǎn)生的碎片離子。這樣,通過(guò)測(cè)量這些碎片離子的強(qiáng)度,可以推斷出目標(biāo)蛋白質(zhì)的量。

2. 絕對(duì)定量和相對(duì)定量
絕對(duì)定量方法需要對(duì)樣品中目標(biāo)分子的確切濃度進(jìn)行度量,這需要使用一個(gè)準(zhǔn)確的濃度標(biāo)準(zhǔn)或內(nèi)標(biāo)。相對(duì)定量則是基于比較,在同一樣品中或者在不同樣品中比較目標(biāo)分子的豐度。
3. PRM在絕對(duì)定量中的應(yīng)用
PRM本身并不直接提供絕對(duì)定量,但當(dāng)結(jié)合適當(dāng)?shù)膬?nèi)標(biāo)技術(shù)時(shí),可以實(shí)現(xiàn)絕對(duì)定量。其中一種常用的內(nèi)標(biāo)是穩(wěn)定同位素標(biāo)記的肽段(如13C、15N標(biāo)記的肽段)。這種標(biāo)記的肽段在質(zhì)譜中的表現(xiàn)與自然豐度的肽段幾乎相同,但由于質(zhì)量的微小差異,可以在質(zhì)譜圖上將它們區(qū)分開(kāi)來(lái)。
首先,我們需要知道內(nèi)標(biāo)肽段的準(zhǔn)確濃度,然后將其添加到樣品中。在質(zhì)譜分析中,由于內(nèi)標(biāo)肽段和樣品中的自然豐度肽段同時(shí)被測(cè)量,因此可以通過(guò)比較它們的峰高或面積來(lái)推算出目標(biāo)蛋白質(zhì)的絕對(duì)濃度。這種方法可以消除實(shí)驗(yàn)過(guò)程中的各種變量,如樣品制備、離子化效率等。
因此,盡管PRM本身不是絕對(duì)定量技術(shù),但結(jié)合適當(dāng)?shù)膬?nèi)標(biāo)技術(shù),PRM可以用于絕對(duì)定量。這使得PRM成為了蛋白質(zhì)組學(xué)研究中非常強(qiáng)大的工具,因?yàn)樗梢跃_、可靠地測(cè)量目標(biāo)蛋白質(zhì)的豐度,從而提供了關(guān)于生物系統(tǒng)狀態(tài)的重要信息。