大家好，歡迎觀看《時空日報》第18期。本期追蹤到時空/單細胞組學相關(guān)研究文章共計5篇。以下是應(yīng)用時空云平臺STOmics Cloud的StereoCopilot模塊生成的文章概要，并輔以人工審核，供了解參考。

1、癌細胞利用微環(huán)境神經(jīng)信號反式激活核-線粒體協(xié)同以獲得干性

Cancer cell employs a microenvironmental neural signal trans-activating nucleus-mitochondria coordination to acquire stemness

Signal Transduction and Targeted Therapy; IF: 39.300; DOI: 10.1038/s41392-023-01487-4

內(nèi)容概要：該研究發(fā)現(xiàn)一項針對33種TCGA癌癥類型的10,852個樣本的泛癌癥轉(zhuǎn)錄組學篩查顯示，cAMP應(yīng)答元件（cAMP-responsive element，CRE）轉(zhuǎn)錄因子是癌癥干細胞的趨同激活因子。聯(lián)合轉(zhuǎn)錄組譜的反卷積、神經(jīng)標記的規(guī)范和去甲腎上腺素動力學分析，并經(jīng)scRNA-seq驗證，闡明了癌細胞通過去甲腎上腺素- ATF1驅(qū)動的核-線粒體協(xié)同程序獲得干性，提示通過劫持微環(huán)境神經(jīng)信號獲得空間化干性的可能性。

2、基質(zhì)STAT5介導的營養(yǎng)活性調(diào)節(jié)造血微環(huán)境因子

Stromal STAT5-mediated trophic activity regulates hematopoietic niche factors

Stem Cells?(Dayton, Ohio); IF: 5.200; DOI: 10.1093/stmcls/sxad055

內(nèi)容概要：通過使用多種骨髓造血和基質(zhì)Cre轉(zhuǎn)基因小鼠株系，發(fā)現(xiàn)信號轉(zhuǎn)導和轉(zhuǎn)錄激活因子5（STAT5a和STAT5b，STAT5ab）敲除會導致造血干細胞向粒細胞分化的啟動，同時會影響基質(zhì)細胞的基因表達和細胞功能，進而影響骨髓微環(huán)境的支持作用。此外，STAT5ab/Cish平衡在基質(zhì)細胞和造血干細胞分化中起著關(guān)鍵作用。

3、CD4表型與黑色素瘤患者采用細胞免疫治療時腫瘤浸潤淋巴細胞擴增減少相關(guān)

CD4 phenotypes are associated with reduced expansion of tumor-infiltrating lymphocytes in melanoma patients treated with adoptive cell therapy

Journal of Immunology; IF: 4.400; DOI: 10.4049/jimmunol.2300250

內(nèi)容概要：通過RNA-seq和染色質(zhì)免疫沉淀測序分析CD4+和CD8+腫瘤浸潤淋巴細胞（tumor-infiltrating lymphocyte，TIL）的相關(guān)性，結(jié)合公共scRNA-seq數(shù)據(jù)，發(fā)現(xiàn)輸注CD4+細胞頻率與輸注TIL的數(shù)量呈負相關(guān)，輸注TIL的數(shù)量越多，黑色素瘤患者的總生存期越長。該研究結(jié)果對于深入了解黑色素瘤患者的TIL擴增機制具有重要意義。

4、FDG攝取反映了免疫富集型甲狀腺癌：基于成像的分子特征的臨床意義

FDG uptake reflects an immune-enriched subtype of thyroid cancer: Clinical implications of imaging-based molecular characterization

Cancer Medicine; IF: 4.000; DOI: 10.1002/cam4.6350

內(nèi)容概要：通過分析甲狀腺癌的18F FDG PET和RNA-seq數(shù)據(jù)，以及scRNA-seq數(shù)據(jù)，發(fā)現(xiàn)FDG攝取主要發(fā)生在腫瘤微環(huán)境中的免疫細胞中，F(xiàn)DG攝取可作為免疫富集型甲狀腺癌的標志，并為治療分層提供臨床意義。

5、綜合分析RNA-seq數(shù)據(jù)和scRNA-seq數(shù)據(jù)建立基于m6A調(diào)控因子和干細胞特性的肝細胞癌預后模型

Establishment of a prognostic model based on m6A regulatory factors and stemness of hepatocellular carcinoma using RNA-seq data and scRNA-seq data

Journal of Cancer Research and Clinical Oncology; IF: 3.600; DOI: 10.1007/s00432-023-05045-x

內(nèi)容概要：基于RNA-seq數(shù)據(jù)和scRNA-seq數(shù)據(jù)，綜合分析了m6A調(diào)節(jié)因子與肝細胞癌（hepatocellular carcinoma，HCC）腫瘤干細胞之間的關(guān)系，發(fā)現(xiàn)了10個與肝細胞癌預后相關(guān)的hub m6A關(guān)鍵調(diào)控因子，并確定調(diào)控因子RBM15B、LRPPRC、IGF2BP1和IGF2BP3可作為有價值的預后指標以用于指導肝細胞癌患者的治療。

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