回文序列

回文序列:
5’- GAA TTC-3’
3’- C TT AAG-5
雙鏈打開時(shí):3’- C TT AAG-5’中的CTT與AA G互補(bǔ)形成發(fā)夾結(jié)構(gòu)
補(bǔ)充:回文結(jié)構(gòu)序列是指順讀和反讀都一樣的序列,分為短的回文結(jié)構(gòu)及長(zhǎng)的回文結(jié)構(gòu),短的回文結(jié)構(gòu)一般為一種特別的信號(hào),如二型限制性內(nèi)切酶的識(shí)別。較長(zhǎng)的回文結(jié)構(gòu)會(huì)轉(zhuǎn)化形成發(fā)夾結(jié)構(gòu)?;匚慕Y(jié)構(gòu)廣泛存在于各種生物體基因組中,如病毒和細(xì)菌基因組DNA以及真核染色體和細(xì)胞器中,它們與遺傳信息表達(dá)的調(diào)控和基因轉(zhuǎn)移有關(guān),并且廣泛分布于人類癌細(xì)胞中。很多蛋白質(zhì)的結(jié)合位點(diǎn)、轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)合位點(diǎn),終止子、編碼小RNA和其它非翻譯RNA的基因片段均為回文結(jié)構(gòu)[1-3]。
回文結(jié)構(gòu)在生物體中具有很明顯的意義,主要作用為:1)是限制性內(nèi)切酶的識(shí)別位點(diǎn)。2)具有調(diào)節(jié)基因的表達(dá)作用,如色氨酸操縱子前的弱化子。3)轉(zhuǎn)錄終止時(shí)的識(shí)別結(jié)構(gòu)。4)穩(wěn)定RNA的結(jié)構(gòu)和行使功能。5)基因工程中DNA序列的方便操作,限制性內(nèi)切酶如同外科醫(yī)生的"手術(shù)刀",它在基因的切割部位就在DNA序列的回文序列中,并且他們之間是相對(duì)應(yīng)的,回文序列在基因序列的存在使基因的操作成為可能。
有研究表明在人類中,發(fā)夾結(jié)構(gòu)AT重復(fù)單元(PATRRs)會(huì)形成十字形DNA結(jié)構(gòu)促使DNA雙鏈斷裂而使染色體發(fā)生易位,也是人類疾病的病因所在[4]?;匚男蛄性赿na中很常見,它通常作為多種調(diào)控因子的順式序列,